RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517402.1

HOXA11-202, Transcript of homeobox A11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXA11, Length 2,137 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-202ENST00000517402 PBRM1Q86U86 1689 aa29.89■■■□□ 2.38
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HOXA11-202ENST00000517402 TIAM1Q13009 1591 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXA11-202ENST00000517402 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.79■■■□□ 2.36
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HOXA11-202ENST00000517402 CEP170Q5SW79 1584 aa29.24■■■□□ 2.27
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HOXA11-202ENST00000517402 SHROOM2Q13796 1616 aa28.59■■■□□ 2.17
HOXA11-202ENST00000517402 PTPRGP23470 1445 aa28.59■■■□□ 2.17
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HOXA11-202ENST00000517402 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.55■■■□□ 2.16
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