RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515475.1

PRELID2-209, Transcript of PRELI domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene PRELID2, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2-209ENST00000515475 CUL7Q14999 1698 aa46.97■■■■■ 5.11
PRELID2-209ENST00000515475 IGF1RP08069 1367 aa46.88■■■■■ 5.1
PRELID2-209ENST00000515475 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.8■■■■■ 5.08
PRELID2-209ENST00000515475 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.67■■■■■ 5.06
PRELID2-209ENST00000515475 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.6■■■■■ 5.05
PRELID2-209ENST00000515475 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.53■■■■■ 5.04
PRELID2-209ENST00000515475 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.53■■■■■ 5.04
PRELID2-209ENST00000515475 MAPKBP1O60336 1514 aa46.53■■■■■ 5.04
PRELID2-209ENST00000515475 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.43■■■■■ 5.02
PRELID2-209ENST00000515475 IQGAP2Q13576 1575 aa46.39■■■■■ 5.02
PRELID2-209ENST00000515475 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.36■■■■■ 5.01
PRELID2-209ENST00000515475 DIP2BQ9P265 1576 aa46.33■■■■■ 5.01
PRELID2-209ENST00000515475 PTPRGP23470 1445 aa46.31■■■■■ 5
PRELID2-209ENST00000515475 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.29■■■■■ 5
PRELID2-209ENST00000515475 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.26■■■■■ 5
PRELID2-209ENST00000515475 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.23■■■■■ 4.99
PRELID2-209ENST00000515475 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.23■■■■■ 4.99
PRELID2-209ENST00000515475 ABCC2Q92887 1545 aa46.11■■■■■ 4.97
PRELID2-209ENST00000515475 DISP1Q96F81 1524 aa46.09■■■■■ 4.97
PRELID2-209ENST00000515475 UGGT2Q9NYU1 1516 aa46.08■■■■■ 4.97
PRELID2-209ENST00000515475 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa46.06■■■■■ 4.96
PRELID2-209ENST00000515475 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.04■■■■■ 4.96
PRELID2-209ENST00000515475 TSPOAP1O95153 1857 aa46■■■■■ 4.95
PRELID2-209ENST00000515475 UACAQ9BZF9 1416 aa45.98■■■■■ 4.95
PRELID2-209ENST00000515475 KIAA0556O60303 1618 aa45.95■■■■■ 4.95
PRELID2-209ENST00000515475 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.95■■■■■ 4.95
PRELID2-209ENST00000515475 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.94■■■■■ 4.95
PRELID2-209ENST00000515475 KDM6BO15054 1643 aa45.93■■■■■ 4.94
PRELID2-209ENST00000515475 ASXL2Q76L83 1435 aa45.9■■■■■ 4.94
PRELID2-209ENST00000515475 GLI2P10070 1586 aa45.87■■■■■ 4.93
PRELID2-209ENST00000515475 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.83■■■■■ 4.93
PRELID2-209ENST00000515475 PRXQ9BXM0 1461 aa45.75■■■■■ 4.91
PRELID2-209ENST00000515475 GOLGA3Q08378 1498 aa45.74■■■■■ 4.91
PRELID2-209ENST00000515475 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
PRELID2-209ENST00000515475 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.7■■■■■ 4.91
PRELID2-209ENST00000515475 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
PRELID2-209ENST00000515475 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa45.61■■■■■ 4.89
PRELID2-209ENST00000515475 ABCA8O94911 1581 aa45.52■■■■■ 4.88
PRELID2-209ENST00000515475 WDR7Q9Y4E6 1490 aa45.5■■■■■ 4.87
PRELID2-209ENST00000515475 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.49■■■■■ 4.87
PRELID2-209ENST00000515475 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.35■■■■■ 4.85
PRELID2-209ENST00000515475 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.34■■■■■ 4.85
PRELID2-209ENST00000515475 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.32■■■■■ 4.85
PRELID2-209ENST00000515475 EEA1Q15075 1411 aa45.31■■■■■ 4.84
PRELID2-209ENST00000515475 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.3■■■■■ 4.84
PRELID2-209ENST00000515475 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.27■■■■■ 4.84
PRELID2-209ENST00000515475 SAMD9Q5K651 1589 aa45.24■■■■■ 4.83
PRELID2-209ENST00000515475 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.21■■■■■ 4.83
PRELID2-209ENST00000515475 CD109Q6YHK3 1445 aa45.19■■■■■ 4.83
PRELID2-209ENST00000515475 KCNH8Q96L42 1107 aa45.13■■■■■ 4.82
PRELID2-209ENST00000515475 P3H3Q8IVL6 736 aa45.12■■■■■ 4.81
PRELID2-209ENST00000515475 ATP10BO94823 1461 aa45.09■■■■■ 4.81
PRELID2-209ENST00000515475 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45.06■■■■■ 4.8
PRELID2-209ENST00000515475 ADGRL1O94910 1474 aa45.04■■■■■ 4.8
PRELID2-209ENST00000515475 KIF21BO75037 1637 aa44.94■■■■■ 4.79
PRELID2-209ENST00000515475 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.94■■■■■ 4.79
PRELID2-209ENST00000515475 ARID3CA6NKF2 412 aa44.94■■■■■ 4.78
PRELID2-209ENST00000515475 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.86■■■■■ 4.77
PRELID2-209ENST00000515475 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.84■■■■■ 4.77
PRELID2-209ENST00000515475 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
PRELID2-209ENST00000515475 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.83■■■■■ 4.77
PRELID2-209ENST00000515475 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.82■■■■■ 4.76
PRELID2-209ENST00000515475 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
PRELID2-209ENST00000515475 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
PRELID2-209ENST00000515475 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.75■■■■■ 4.75
PRELID2-209ENST00000515475 NEO1Q92859 1461 aa44.7■■■■■ 4.75
PRELID2-209ENST00000515475 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.59■■■■■ 4.73
PRELID2-209ENST00000515475 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.48■■■■■ 4.71
PRELID2-209ENST00000515475 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.48■■■■■ 4.71
PRELID2-209ENST00000515475 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.46■■■■■ 4.71
PRELID2-209ENST00000515475 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
PRELID2-209ENST00000515475 RAPGEF3O95398 923 aa44.44■■■■■ 4.7
PRELID2-209ENST00000515475 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.44■■■■■ 4.78e-6■□□□□ 10.5
PRELID2-209ENST00000515475 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.43■■■■■ 4.7
PRELID2-209ENST00000515475 FMN1Q68DA7 1419 aa44.41■■■■■ 4.7
PRELID2-209ENST00000515475 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
PRELID2-209ENST00000515475 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.37■■■■■ 4.69
PRELID2-209ENST00000515475 HECW1Q76N89 1606 aa44.36■■■■■ 4.69
PRELID2-209ENST00000515475 FANCAO15360 1455 aa44.36■■■■■ 4.69
PRELID2-209ENST00000515475 RICTORQ6R327 1708 aa44.35■■■■■ 4.69
PRELID2-209ENST00000515475 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
PRELID2-209ENST00000515475 AKNAQ7Z591 1439 aa44.33■■■■■ 4.69
PRELID2-209ENST00000515475 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.33■■■■■ 4.69
PRELID2-209ENST00000515475 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.32■■■■■ 4.69
PRELID2-209ENST00000515475 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.28■■■■■ 4.68
PRELID2-209ENST00000515475 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.28■■■■■ 4.68
PRELID2-209ENST00000515475 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.24■■■■■ 4.67
PRELID2-209ENST00000515475 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.19■■■■■ 4.67
PRELID2-209ENST00000515475 PLCH2O75038 1416 aa44.16■■■■■ 4.66
PRELID2-209ENST00000515475 PTPRMP28827 1452 aa44.16■■■■■ 4.66
PRELID2-209ENST00000515475 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
PRELID2-209ENST00000515475 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.15■■■■■ 4.66
PRELID2-209ENST00000515475 MYO5CQ9NQX4 1742 aa44.14■■■■■ 4.66
PRELID2-209ENST00000515475 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
PRELID2-209ENST00000515475 MAGI2Q86UL8 1455 aa44.1■■■■■ 4.65
PRELID2-209ENST00000515475 MADDQ8WXG6 1647 aa44.09■■■■■ 4.65
PRELID2-209ENST00000515475 KIF14Q15058 1648 aa44.08■■■■■ 4.65
PRELID2-209ENST00000515475 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa44.07■■■■■ 4.65
PRELID2-209ENST00000515475 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.03■■■■■ 4.64
PRELID2-209ENST00000515475 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.03■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 179.2 ms