RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514560.1

MAGED4B-212, Transcript of MAGE family member D4B, humanhuman

TSL 4

Gene MAGED4B, Length 510 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4B-212ENST00000514560 KIF27Q86VH2 1401 aa29.71■■■□□ 2.35
MAGED4B-212ENST00000514560 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.64■■■□□ 2.34
MAGED4B-212ENST00000514560 IGF1RP08069 1367 aa29.64■■■□□ 2.33
MAGED4B-212ENST00000514560 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.58■■■□□ 2.33
MAGED4B-212ENST00000514560 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.5■■■□□ 2.31
MAGED4B-212ENST00000514560 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.49■■■□□ 2.31
MAGED4B-212ENST00000514560 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.48■■■□□ 2.31
MAGED4B-212ENST00000514560 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
MAGED4B-212ENST00000514560 MAPKBP1O60336 1514 aa29.43■■■□□ 2.3
MAGED4B-212ENST00000514560 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.39■■■□□ 2.3
MAGED4B-212ENST00000514560 DIP2BQ9P265 1576 aa29.38■■■□□ 2.29
MAGED4B-212ENST00000514560 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.37■■■□□ 2.29
MAGED4B-212ENST00000514560 IQGAP2Q13576 1575 aa29.36■■■□□ 2.29
MAGED4B-212ENST00000514560 PTPRGP23470 1445 aa29.32■■■□□ 2.28
MAGED4B-212ENST00000514560 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.32■■■□□ 2.28
MAGED4B-212ENST00000514560 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
MAGED4B-212ENST00000514560 TSPOAP1O95153 1857 aa29.29■■■□□ 2.28
MAGED4B-212ENST00000514560 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.26■■■□□ 2.28
MAGED4B-212ENST00000514560 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.23■■■□□ 2.27
MAGED4B-212ENST00000514560 ABCC2Q92887 1545 aa29.18■■■□□ 2.26
MAGED4B-212ENST00000514560 DISP1Q96F81 1524 aa29.17■■■□□ 2.26
MAGED4B-212ENST00000514560 KDM6BO15054 1643 aa29.16■■■□□ 2.26
MAGED4B-212ENST00000514560 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.13■■■□□ 2.25
MAGED4B-212ENST00000514560 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.12■■■□□ 2.25
MAGED4B-212ENST00000514560 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.1■■■□□ 2.25
MAGED4B-212ENST00000514560 UACAQ9BZF9 1416 aa29.1■■■□□ 2.25
MAGED4B-212ENST00000514560 KIAA0556O60303 1618 aa29.09■■■□□ 2.25
MAGED4B-212ENST00000514560 ASXL2Q76L83 1435 aa29.08■■■□□ 2.25
MAGED4B-212ENST00000514560 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.06■■■□□ 2.24
MAGED4B-212ENST00000514560 GLI2P10070 1586 aa29.01■■■□□ 2.24
MAGED4B-212ENST00000514560 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
MAGED4B-212ENST00000514560 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
MAGED4B-212ENST00000514560 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.98■■■□□ 2.23
MAGED4B-212ENST00000514560 GOLGA3Q08378 1498 aa28.91■■■□□ 2.22
MAGED4B-212ENST00000514560 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
MAGED4B-212ENST00000514560 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.9■■■□□ 2.22
MAGED4B-212ENST00000514560 PRXQ9BXM0 1461 aa28.89■■■□□ 2.22
MAGED4B-212ENST00000514560 ABCA8O94911 1581 aa28.8■■■□□ 2.2
MAGED4B-212ENST00000514560 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.8■■■□□ 2.2
MAGED4B-212ENST00000514560 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.79■■■□□ 2.2
MAGED4B-212ENST00000514560 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.76■■■□□ 2.19
MAGED4B-212ENST00000514560 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.71■■■□□ 2.19
MAGED4B-212ENST00000514560 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
MAGED4B-212ENST00000514560 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
MAGED4B-212ENST00000514560 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.66■■■□□ 2.18
MAGED4B-212ENST00000514560 P3H3Q8IVL6 736 aa28.65■■■□□ 2.18
MAGED4B-212ENST00000514560 KCNH8Q96L42 1107 aa28.65■■■□□ 2.18
MAGED4B-212ENST00000514560 CD109Q6YHK3 1445 aa28.62■■■□□ 2.17
MAGED4B-212ENST00000514560 SAMD9Q5K651 1589 aa28.62■■■□□ 2.17
MAGED4B-212ENST00000514560 ADGRL1O94910 1474 aa28.59■■■□□ 2.17
MAGED4B-212ENST00000514560 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.59■■■□□ 2.17
MAGED4B-212ENST00000514560 ARID3CA6NKF2 412 aa28.57■■■□□ 2.16
MAGED4B-212ENST00000514560 EEA1Q15075 1411 aa28.57■■■□□ 2.16
MAGED4B-212ENST00000514560 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.54■■■□□ 2.16
MAGED4B-212ENST00000514560 ATP10BO94823 1461 aa28.53■■■□□ 2.16
MAGED4B-212ENST00000514560 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
MAGED4B-212ENST00000514560 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.45■■■□□ 2.14
MAGED4B-212ENST00000514560 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
MAGED4B-212ENST00000514560 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
MAGED4B-212ENST00000514560 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.4■■■□□ 2.14
MAGED4B-212ENST00000514560 KIF21BO75037 1637 aa28.4■■■□□ 2.14
MAGED4B-212ENST00000514560 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.37■■■□□ 2.13
MAGED4B-212ENST00000514560 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
MAGED4B-212ENST00000514560 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.33■■■□□ 2.13
MAGED4B-212ENST00000514560 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.29■■■□□ 2.12
MAGED4B-212ENST00000514560 NEO1Q92859 1461 aa28.27■■■□□ 2.12
MAGED4B-212ENST00000514560 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.24■■■□□ 2.11
MAGED4B-212ENST00000514560 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.21■■■□□ 2.11
MAGED4B-212ENST00000514560 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.2■■■□□ 2.1
MAGED4B-212ENST00000514560 RAPGEF3O95398 923 aa28.19■■■□□ 2.1
MAGED4B-212ENST00000514560 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.18■■■□□ 2.1
MAGED4B-212ENST00000514560 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.16■■■□□ 2.1
MAGED4B-212ENST00000514560 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
MAGED4B-212ENST00000514560 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
MAGED4B-212ENST00000514560 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
MAGED4B-212ENST00000514560 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.12■■■□□ 2.09
MAGED4B-212ENST00000514560 RICTORQ6R327 1708 aa28.11■■■□□ 2.09
MAGED4B-212ENST00000514560 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.1■■■□□ 2.09
MAGED4B-212ENST00000514560 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.09■■■□□ 2.09
MAGED4B-212ENST00000514560 FANCAO15360 1455 aa28.08■■■□□ 2.09
MAGED4B-212ENST00000514560 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
MAGED4B-212ENST00000514560 HECW1Q76N89 1606 aa28.07■■■□□ 2.08
MAGED4B-212ENST00000514560 AKNAQ7Z591 1439 aa28.07■■■□□ 2.08
MAGED4B-212ENST00000514560 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.06■■■□□ 2.08
MAGED4B-212ENST00000514560 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.05■■■□□ 2.08
MAGED4B-212ENST00000514560 FMN1Q68DA7 1419 aa28.04■■■□□ 2.08
MAGED4B-212ENST00000514560 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
MAGED4B-212ENST00000514560 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.03■■■□□ 2.08
MAGED4B-212ENST00000514560 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
MAGED4B-212ENST00000514560 PTPRMP28827 1452 aa28■■■□□ 2.07
MAGED4B-212ENST00000514560 MADDQ8WXG6 1647 aa28■■■□□ 2.07
MAGED4B-212ENST00000514560 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.98■■■□□ 2.07
MAGED4B-212ENST00000514560 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.96■■■□□ 2.07
MAGED4B-212ENST00000514560 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
MAGED4B-212ENST00000514560 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
MAGED4B-212ENST00000514560 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.92■■■□□ 2.06
MAGED4B-212ENST00000514560 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.92■■■□□ 2.06
MAGED4B-212ENST00000514560 PLCH2O75038 1416 aa27.92■■■□□ 2.06
MAGED4B-212ENST00000514560 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
MAGED4B-212ENST00000514560 KIF14Q15058 1648 aa27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms