RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514536.5

USP46-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 2

Gene USP46, Length 1,589 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-209ENST00000514536 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
USP46-209ENST00000514536 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.3■■□□□ 1.32
USP46-209ENST00000514536 JPH4Q96JJ6 628 aa23.29■■□□□ 1.32
USP46-209ENST00000514536 EEA1Q15075 1411 aa23.25■■□□□ 1.31
USP46-209ENST00000514536 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.25■■□□□ 1.31
USP46-209ENST00000514536 PRXQ9BXM0 1461 aa23.23■■□□□ 1.31
USP46-209ENST00000514536 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
USP46-209ENST00000514536 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.18■■□□□ 1.3
USP46-209ENST00000514536 SHROOM2Q13796 1616 aa23.18■■□□□ 1.3
USP46-209ENST00000514536 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
USP46-209ENST00000514536 IQGAP2Q13576 1575 aa23.08■■□□□ 1.29
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USP46-209ENST00000514536 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.01■■□□□ 1.27
USP46-209ENST00000514536 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
USP46-209ENST00000514536 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.97■■□□□ 1.27
USP46-209ENST00000514536 KIF21BO75037 1637 aa22.95■■□□□ 1.27
USP46-209ENST00000514536 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.95■■□□□ 1.27
USP46-209ENST00000514536 DISP1Q96F81 1524 aa22.95■■□□□ 1.26
USP46-209ENST00000514536 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.94■■□□□ 1.26
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USP46-209ENST00000514536 P3H3Q8IVL6 736 aa22.87■■□□□ 1.25
USP46-209ENST00000514536 KIAA0556O60303 1618 aa22.85■■□□□ 1.25
USP46-209ENST00000514536 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
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USP46-209ENST00000514536 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.75■■□□□ 1.23
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USP46-209ENST00000514536 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.7■■□□□ 1.22
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USP46-209ENST00000514536 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.67■■□□□ 1.22
USP46-209ENST00000514536 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.63■■□□□ 1.21
USP46-209ENST00000514536 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.63■■□□□ 1.21
USP46-209ENST00000514536 ABCA8O94911 1581 aa22.62■■□□□ 1.21
USP46-209ENST00000514536 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.6■■□□□ 1.21
USP46-209ENST00000514536 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.59■■□□□ 1.21
USP46-209ENST00000514536 ARID3CA6NKF2 412 aa22.59■■□□□ 1.21
USP46-209ENST00000514536 MAPKBP1O60336 1514 aa22.59■■□□□ 1.21
USP46-209ENST00000514536 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.56■■□□□ 1.2
USP46-209ENST00000514536 ASXL2Q76L83 1435 aa22.55■■□□□ 1.2
USP46-209ENST00000514536 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.54■■□□□ 1.2
USP46-209ENST00000514536 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.52■■□□□ 1.2
USP46-209ENST00000514536 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
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USP46-209ENST00000514536 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.5■■□□□ 1.19
USP46-209ENST00000514536 ATP10BO94823 1461 aa22.5■■□□□ 1.19
USP46-209ENST00000514536 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
USP46-209ENST00000514536 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
USP46-209ENST00000514536 FMN1Q68DA7 1419 aa22.48■■□□□ 1.19
USP46-209ENST00000514536 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
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USP46-209ENST00000514536 CEP162Q5TB80 1403 aa22.42■■□□□ 1.18
USP46-209ENST00000514536 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.41■■□□□ 1.18
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USP46-209ENST00000514536 GLI2P10070 1586 aa22.34■■□□□ 1.17
USP46-209ENST00000514536 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.32■■□□□ 1.16
USP46-209ENST00000514536 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
USP46-209ENST00000514536 HECW1Q76N89 1606 aa22.31■■□□□ 1.16
USP46-209ENST00000514536 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
USP46-209ENST00000514536 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
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USP46-209ENST00000514536 CD109Q6YHK3 1445 aa22.24■■□□□ 1.15
USP46-209ENST00000514536 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.23■■□□□ 1.15
USP46-209ENST00000514536 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.21■■□□□ 1.15
USP46-209ENST00000514536 KDM6BO15054 1643 aa22.19■■□□□ 1.14
USP46-209ENST00000514536 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.18■■□□□ 1.14
USP46-209ENST00000514536 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USP46-209ENST00000514536 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.16■■□□□ 1.14
USP46-209ENST00000514536 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.15■■□□□ 1.14
USP46-209ENST00000514536 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.15■■□□□ 1.14
USP46-209ENST00000514536 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USP46-209ENST00000514536 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.15■■□□□ 1.14
USP46-209ENST00000514536 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.14■■□□□ 1.14
USP46-209ENST00000514536 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.13■■□□□ 1.13
USP46-209ENST00000514536 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
USP46-209ENST00000514536 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.07■■□□□ 1.12
USP46-209ENST00000514536 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP46-209ENST00000514536 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.05■■□□□ 1.12
USP46-209ENST00000514536 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.04■■□□□ 1.12
USP46-209ENST00000514536 KIF14Q15058 1648 aa22.03■■□□□ 1.12
USP46-209ENST00000514536 PLCH2O75038 1416 aa22.02■■□□□ 1.12
USP46-209ENST00000514536 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.02■■□□□ 1.12
USP46-209ENST00000514536 NEO1Q92859 1461 aa21.99■■□□□ 1.11
USP46-209ENST00000514536 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.99■■□□□ 1.11
USP46-209ENST00000514536 FANCAO15360 1455 aa21.98■■□□□ 1.11
USP46-209ENST00000514536 AKNAQ7Z591 1439 aa21.97■■□□□ 1.11
USP46-209ENST00000514536 APLP2Q06481 763 aa21.96■■□□□ 1.11
USP46-209ENST00000514536 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.96■■□□□ 1.11
USP46-209ENST00000514536 RAPGEF3O95398 923 aa21.95■■□□□ 1.1
USP46-209ENST00000514536 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
USP46-209ENST00000514536 TIAM1Q13009 1591 aa21.93■■□□□ 1.1
USP46-209ENST00000514536 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.91■■□□□ 1.1
USP46-209ENST00000514536 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.9■■□□□ 1.1
USP46-209ENST00000514536 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.9■■□□□ 1.1
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