RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513800.5

DCUN1D4-222, Transcript of defective in cullin neddylation 1 domain containing 4, human

TSL 2

Gene DCUN1D4, Length 949 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCUN1D4-222	ENST00000513800	JPH4	Q96JJ6	628 aa		42.92	■■■■■ 4.46
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.46
DCUN1D4-222	ENST00000513800	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.85	■■■■■ 4.45
DCUN1D4-222	ENST00000513800	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
DCUN1D4-222	ENST00000513800	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.63	■■■■■ 4.42
DCUN1D4-222	ENST00000513800	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.52	■■■■■ 4.4
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.48	■■■■■ 4.39
DCUN1D4-222	ENST00000513800	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.36	■■■■■ 4.37
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PTPRG	P23470	1445 aa		42.33	■■■■■ 4.37
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.32	■■■■■ 4.37
DCUN1D4-222	ENST00000513800	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.32	■■■■■ 4.37
DCUN1D4-222	ENST00000513800	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.27	■■■■■ 4.36
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.24	■■■■■ 4.35
DCUN1D4-222	ENST00000513800	EEA1	Q15075	1411 aa		42.24	■■■■■ 4.35
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.21	■■■■■ 4.35
DCUN1D4-222	ENST00000513800	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.2	■■■■■ 4.35
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.2	■■■■■ 4.35
DCUN1D4-222	ENST00000513800	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.18	■■■■■ 4.34
DCUN1D4-222	ENST00000513800	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.15	■■■■■ 4.34
DCUN1D4-222	ENST00000513800	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.1	■■■■■ 4.33
DCUN1D4-222	ENST00000513800	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.08	■■■■■ 4.33
DCUN1D4-222	ENST00000513800	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.03	■■■■■ 4.32
DCUN1D4-222	ENST00000513800	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.02	■■■■■ 4.32
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.01	■■■■■ 4.32
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42	■■■■■ 4.31
DCUN1D4-222	ENST00000513800	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		41.97	■■■■■ 4.31
DCUN1D4-222	ENST00000513800	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.95	■■■■■ 4.31
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		41.94	■■■■■ 4.3
DCUN1D4-222	ENST00000513800	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.88	■■■■■ 4.3
DCUN1D4-222	ENST00000513800	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.88	■■■■■ 4.29
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		41.82	■■■■■ 4.29
DCUN1D4-222	ENST00000513800	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.79	■■■■■ 4.28
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.78	■■■■■ 4.28
DCUN1D4-222	ENST00000513800	KIF21B	O75037	1637 aa		41.74	■■■■■ 4.27
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.67	■■■■■ 4.26
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ABCA8	O94911	1581 aa		41.66	■■■■■ 4.26
DCUN1D4-222	ENST00000513800	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.64	■■■■■ 4.26
DCUN1D4-222	ENST00000513800	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.62	■■■■■ 4.25
DCUN1D4-222	ENST00000513800	GLI2	P10070	1586 aa		41.59	■■■■■ 4.25
DCUN1D4-222	ENST00000513800	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.52	■■■■■ 4.24
DCUN1D4-222	ENST00000513800	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.51	■■■■■ 4.24
DCUN1D4-222	ENST00000513800	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.51	■■■■■ 4.24
DCUN1D4-222	ENST00000513800	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.49	■■■■■ 4.23
DCUN1D4-222	ENST00000513800	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.45	■■■■■ 4.23
DCUN1D4-222	ENST00000513800	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.44	■■■■■ 4.23
DCUN1D4-222	ENST00000513800	KDM6B	O15054	1643 aa		41.39	■■■■■ 4.22
DCUN1D4-222	ENST00000513800	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.38	■■■■■ 4.22
DCUN1D4-222	ENST00000513800	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.36	■■■■■ 4.21
DCUN1D4-222	ENST00000513800	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.35	■■■■■ 4.21
DCUN1D4-222	ENST00000513800	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.35	■■■■■ 4.21
DCUN1D4-222	ENST00000513800	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.32	■■■■■ 4.2
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ATP10B	O94823	1461 aa		41.31	■■■■■ 4.2
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.29	■■■■■ 4.2
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.28	■■■■■ 4.2
DCUN1D4-222	ENST00000513800	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.27	■■■■■ 4.2
DCUN1D4-222	ENST00000513800	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.2	■■■■■ 4.19
DCUN1D4-222	ENST00000513800	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.2	■■■■■ 4.19
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.2	■■■■■ 4.19
DCUN1D4-222	ENST00000513800	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.19	■■■■■ 4.18
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.18	■■■■■ 4.18
DCUN1D4-222	ENST00000513800	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.13	■■■■■ 4.17
DCUN1D4-222	ENST00000513800	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.1	■■■■■ 4.17
DCUN1D4-222	ENST00000513800	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.07	■■■■■ 4.17
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.07	■■■■■ 4.16
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.01	■■■■■ 4.16
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		40.99	■■■■■ 4.15
DCUN1D4-222	ENST00000513800	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	40.95	■■■■■ 4.15
DCUN1D4-222	ENST00000513800	HECW1	Q76N89	1606 aa		40.92	■■■■■ 4.14
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.89	■■■■■ 4.14
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.87	■■■■■ 4.13
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.83	■■■■■ 4.13
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.8	■■■■■ 4.12
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.77	■■■■■ 4.12
DCUN1D4-222	ENST00000513800	NEO1	Q92859	1461 aa		40.77	■■■■■ 4.12
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CLIP1	P30622	1438 aa		40.73	■■■■■ 4.11
DCUN1D4-222	ENST00000513800	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.69	■■■■■ 4.1
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.67	■■■■■ 4.1
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.62	■■■■■ 4.09
DCUN1D4-222	ENST00000513800	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.61	■■■■■ 4.09
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.61	■■■■■ 4.09
DCUN1D4-222	ENST00000513800	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		40.6	■■■■■ 4.09
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.59	■■■■■ 4.09
DCUN1D4-222	ENST00000513800	FANCA	O15360	1455 aa		40.58	■■■■■ 4.09
DCUN1D4-222	ENST00000513800	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.08
DCUN1D4-222	ENST00000513800	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.56	■■■■■ 4.08
DCUN1D4-222	ENST00000513800	KIF14	Q15058	1648 aa		40.53	■■■■■ 4.08
DCUN1D4-222	ENST00000513800	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.52	■■■■■ 4.08
DCUN1D4-222	ENST00000513800	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.5	■■■■■ 4.07
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.5	■■■■■ 4.07
DCUN1D4-222	ENST00000513800	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.49	■■■■■ 4.07
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PLCH2	O75038	1416 aa		40.49	■■■■■ 4.07
DCUN1D4-222	ENST00000513800	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
DCUN1D4-222	ENST00000513800	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.41	■■■■■ 4.06
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.4	■■■■■ 4.06
DCUN1D4-222	ENST00000513800	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.39	■■■■■ 4.06
DCUN1D4-222	ENST00000513800	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.39	■■■■■ 4.06
DCUN1D4-222	ENST00000513800	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.33	■■■■■ 4.05
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		40.28	■■■■■ 4.04
DCUN1D4-222	ENST00000513800	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		40.28	■■■■■ 4.04
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		40.25	■■■■■ 4.03

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