RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.55■■■□□ 2.32
HERC3-211ENST00000513325 CUL7Q14999 1698 aa29.45■■■□□ 2.31
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.43■■■□□ 2.3
HERC3-211ENST00000513325 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.37■■■□□ 2.29
HERC3-211ENST00000513325 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.28
HERC3-211ENST00000513325 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.27■■■□□ 2.28
HERC3-211ENST00000513325 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.25■■■□□ 2.27
HERC3-211ENST00000513325 MAPKBP1O60336 1514 aa29.2■■■□□ 2.27
HERC3-211ENST00000513325 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.2■■■□□ 2.26
HERC3-211ENST00000513325 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.19■■■□□ 2.26
HERC3-211ENST00000513325 PTPRGP23470 1445 aa29.18■■■□□ 2.26
HERC3-211ENST00000513325 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
HERC3-211ENST00000513325 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.14■■■□□ 2.26
HERC3-211ENST00000513325 IQGAP2Q13576 1575 aa29.13■■■□□ 2.25
HERC3-211ENST00000513325 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
HERC3-211ENST00000513325 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.11■■■□□ 2.25
HERC3-211ENST00000513325 DIP2BQ9P265 1576 aa29.1■■■□□ 2.25
HERC3-211ENST00000513325 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.09■■■□□ 2.25
HERC3-211ENST00000513325 DISP1Q96F81 1524 aa29.01■■■□□ 2.23
HERC3-211ENST00000513325 ABCC2Q92887 1545 aa28.99■■■□□ 2.23
HERC3-211ENST00000513325 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.96■■■□□ 2.23
HERC3-211ENST00000513325 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.94■■■□□ 2.22
HERC3-211ENST00000513325 UACAQ9BZF9 1416 aa28.94■■■□□ 2.22
HERC3-211ENST00000513325 TSPOAP1O95153 1857 aa28.9■■■□□ 2.22
HERC3-211ENST00000513325 ASXL2Q76L83 1435 aa28.9■■■□□ 2.22
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0556O60303 1618 aa28.87■■■□□ 2.21
HERC3-211ENST00000513325 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.87■■■□□ 2.21
HERC3-211ENST00000513325 KDM6BO15054 1643 aa28.84■■■□□ 2.21
HERC3-211ENST00000513325 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.81■■■□□ 2.2
HERC3-211ENST00000513325 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.81■■■□□ 2.2
HERC3-211ENST00000513325 PRXQ9BXM0 1461 aa28.8■■■□□ 2.2
HERC3-211ENST00000513325 GLI2P10070 1586 aa28.79■■■□□ 2.2
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA3Q08378 1498 aa28.73■■■□□ 2.19
HERC3-211ENST00000513325 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
HERC3-211ENST00000513325 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
HERC3-211ENST00000513325 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
HERC3-211ENST00000513325 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.63■■■□□ 2.17
HERC3-211ENST00000513325 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.62■■■□□ 2.17
HERC3-211ENST00000513325 ABCA8O94911 1581 aa28.62■■■□□ 2.17
HERC3-211ENST00000513325 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.61■■■□□ 2.17
HERC3-211ENST00000513325 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.59■■■□□ 2.17
HERC3-211ENST00000513325 P3H3Q8IVL6 736 aa28.56■■■□□ 2.16
HERC3-211ENST00000513325 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
HERC3-211ENST00000513325 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.55■■■□□ 2.16
HERC3-211ENST00000513325 KCNH8Q96L42 1107 aa28.52■■■□□ 2.16
HERC3-211ENST00000513325 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
HERC3-211ENST00000513325 ARID3CA6NKF2 412 aa28.46■■■□□ 2.15
HERC3-211ENST00000513325 EEA1Q15075 1411 aa28.45■■■□□ 2.15
HERC3-211ENST00000513325 CD109Q6YHK3 1445 aa28.45■■■□□ 2.15
HERC3-211ENST00000513325 SAMD9Q5K651 1589 aa28.42■■■□□ 2.14
HERC3-211ENST00000513325 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.41■■■□□ 2.14
HERC3-211ENST00000513325 ATP10BO94823 1461 aa28.4■■■□□ 2.14
HERC3-211ENST00000513325 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.4■■■□□ 2.14
HERC3-211ENST00000513325 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
HERC3-211ENST00000513325 ADGRL1O94910 1474 aa28.34■■■□□ 2.13
HERC3-211ENST00000513325 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.31■■■□□ 2.12
HERC3-211ENST00000513325 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
HERC3-211ENST00000513325 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
HERC3-211ENST00000513325 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.26■■■□□ 2.12
HERC3-211ENST00000513325 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
HERC3-211ENST00000513325 KIF21BO75037 1637 aa28.22■■■□□ 2.11
HERC3-211ENST00000513325 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.21■■■□□ 2.11
HERC3-211ENST00000513325 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.19■■■□□ 2.1
HERC3-211ENST00000513325 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.14■■■□□ 2.1
HERC3-211ENST00000513325 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.13■■■□□ 2.09
HERC3-211ENST00000513325 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.13■■■□□ 2.09
HERC3-211ENST00000513325 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.13■■■□□ 2.09
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.1■■■□□ 2.09
HERC3-211ENST00000513325 NEO1Q92859 1461 aa28.08■■■□□ 2.09
HERC3-211ENST00000513325 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HERC3-211ENST00000513325 RAPGEF3O95398 923 aa28.07■■■□□ 2.08
HERC3-211ENST00000513325 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
HERC3-211ENST00000513325 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.96■■■□□ 2.07
HERC3-211ENST00000513325 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.94■■■□□ 2.06
HERC3-211ENST00000513325 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.93■■■□□ 2.06
HERC3-211ENST00000513325 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.93■■■□□ 2.06
HERC3-211ENST00000513325 FMN1Q68DA7 1419 aa27.92■■■□□ 2.06
HERC3-211ENST00000513325 AKNAQ7Z591 1439 aa27.92■■■□□ 2.06
HERC3-211ENST00000513325 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.91■■■□□ 2.06
HERC3-211ENST00000513325 FANCAO15360 1455 aa27.91■■■□□ 2.06
HERC3-211ENST00000513325 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
HERC3-211ENST00000513325 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.86■■■□□ 2.05
HERC3-211ENST00000513325 HECW1Q76N89 1606 aa27.85■■■□□ 2.05
HERC3-211ENST00000513325 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.84■■■□□ 2.05
HERC3-211ENST00000513325 RICTORQ6R327 1708 aa27.83■■■□□ 2.05
HERC3-211ENST00000513325 PLCH2O75038 1416 aa27.8■■■□□ 2.04
HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.79■■■□□ 2.04
HERC3-211ENST00000513325 PTPRMP28827 1452 aa27.79■■■□□ 2.04
HERC3-211ENST00000513325 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
HERC3-211ENST00000513325 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.77■■■□□ 2.04
HERC3-211ENST00000513325 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.74■■■□□ 2.03
HERC3-211ENST00000513325 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.74■■■□□ 2.03
HERC3-211ENST00000513325 MADDQ8WXG6 1647 aa27.72■■■□□ 2.03
HERC3-211ENST00000513325 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.71■■■□□ 2.03
HERC3-211ENST00000513325 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.71■■■□□ 2.03
HERC3-211ENST00000513325 KIF14Q15058 1648 aa27.7■■■□□ 2.03
HERC3-211ENST00000513325 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
HERC3-211ENST00000513325 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.7■■■□□ 2.02
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