RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.64■■■□□ 2.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.56■■■□□ 2.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.56■■■□□ 2.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IQGAP2Q13576 1575 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPRGP23470 1445 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.5■■■□□ 2.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRXQ9BXM0 1461 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DISP1Q96F81 1524 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAPKBP1O60336 1514 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UACAQ9BZF9 1416 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCC2Q92887 1545 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EEA1Q15075 1411 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA0556O60303 1618 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA3Q08378 1498 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DIP2BQ9P265 1576 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASXL2Q76L83 1435 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GLI2P10070 1586 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCA8O94911 1581 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXC-AS3-202ENST00000513165 P3H3Q8IVL6 736 aa28■■■□□ 2.07
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPOAP1O95153 1857 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAMD9Q5K651 1589 aa27.95■■■□□ 2.07
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF21BO75037 1637 aa27.95■■■□□ 2.06
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KDM6BO15054 1643 aa27.89■■■□□ 2.05
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNH8Q96L42 1107 aa27.83■■■□□ 2.05
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP10BO94823 1461 aa27.83■■■□□ 2.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARID3CA6NKF2 412 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD109Q6YHK3 1445 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.7■■■□□ 2.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.57■■■□□ 2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FMN1Q68DA7 1419 aa27.57■■■□□ 2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.57■■■□□ 2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.55■■■□□ 2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.53■■■□□ 2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEO1Q92859 1461 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HECW1Q76N89 1606 aa27.41■■□□□ 1.98
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGRL1O94910 1474 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAPGEF3O95398 923 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AKNAQ7Z591 1439 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FANCAO15360 1455 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLCH2O75038 1416 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLIP1P30622 1438 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF14Q15058 1648 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RICTORQ6R327 1708 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.06■■□□□ 1.92
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