RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513095.5

SH3BP2-226, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-226ENST00000513095 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-226ENST00000513095 EEA1Q15075 1411 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-226ENST00000513095 PRXQ9BXM0 1461 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-226ENST00000513095 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-226ENST00000513095 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-226ENST00000513095 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-226ENST00000513095 JPH4Q96JJ6 628 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-226ENST00000513095 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-226ENST00000513095 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-226ENST00000513095 IQGAP2Q13576 1575 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-226ENST00000513095 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-226ENST00000513095 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-226ENST00000513095 KIF21BO75037 1637 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-226ENST00000513095 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-226ENST00000513095 DISP1Q96F81 1524 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-226ENST00000513095 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-226ENST00000513095 KIAA0556O60303 1618 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-226ENST00000513095 PTPRGP23470 1445 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-226ENST00000513095 GOLGA3Q08378 1498 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-226ENST00000513095 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-226ENST00000513095 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-226ENST00000513095 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-226ENST00000513095 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-226ENST00000513095 SAMD9Q5K651 1589 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2-226ENST00000513095 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-226ENST00000513095 P3H3Q8IVL6 736 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2-226ENST00000513095 UACAQ9BZF9 1416 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2-226ENST00000513095 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-226ENST00000513095 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP2-226ENST00000513095 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-226ENST00000513095 ABCC2Q92887 1545 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-226ENST00000513095 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-226ENST00000513095 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.14■■□□□ 1.3
SH3BP2-226ENST00000513095 ABCA8O94911 1581 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-226ENST00000513095 MAPKBP1O60336 1514 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP2-226ENST00000513095 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-226ENST00000513095 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP2-226ENST00000513095 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP2-226ENST00000513095 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-226ENST00000513095 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-226ENST00000513095 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-226ENST00000513095 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-226ENST00000513095 ASXL2Q76L83 1435 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-226ENST00000513095 DIP2BQ9P265 1576 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-226ENST00000513095 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-226ENST00000513095 ATP10BO94823 1461 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-226ENST00000513095 ARID3CA6NKF2 412 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-226ENST00000513095 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-226ENST00000513095 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-226ENST00000513095 CLIP1P30622 1438 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-226ENST00000513095 FMN1Q68DA7 1419 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-226ENST00000513095 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-226ENST00000513095 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-226ENST00000513095 GLI2P10070 1586 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-226ENST00000513095 CEP162Q5TB80 1403 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-226ENST00000513095 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-226ENST00000513095 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-226ENST00000513095 HECW1Q76N89 1606 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-226ENST00000513095 KCNH8Q96L42 1107 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-226ENST00000513095 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-226ENST00000513095 TSPOAP1O95153 1857 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2-226ENST00000513095 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-226ENST00000513095 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-226ENST00000513095 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-226ENST00000513095 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-226ENST00000513095 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-226ENST00000513095 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-226ENST00000513095 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-226ENST00000513095 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-226ENST00000513095 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-226ENST00000513095 CD109Q6YHK3 1445 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-226ENST00000513095 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-226ENST00000513095 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-226ENST00000513095 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-226ENST00000513095 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-226ENST00000513095 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-226ENST00000513095 KDM6BO15054 1643 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-226ENST00000513095 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-226ENST00000513095 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-226ENST00000513095 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-226ENST00000513095 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-226ENST00000513095 KIF14Q15058 1648 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-226ENST00000513095 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-226ENST00000513095 NEO1Q92859 1461 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-226ENST00000513095 PLCH2O75038 1416 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-226ENST00000513095 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-226ENST00000513095 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-226ENST00000513095 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-226ENST00000513095 FANCAO15360 1455 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-226ENST00000513095 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-226ENST00000513095 TIAM1Q13009 1591 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-226ENST00000513095 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-226ENST00000513095 AKNAQ7Z591 1439 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-226ENST00000513095 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-226ENST00000513095 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-226ENST00000513095 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-226ENST00000513095 PREX2Q70Z35 1606 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-226ENST00000513095 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-226ENST00000513095 MAP3K1Q13233 1512 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-226ENST00000513095 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms