RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512716.1

RASGEF1B-210, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-210ENST00000512716 JPH4Q96JJ6 628 aa40.65■■■■■ 4.1
RASGEF1B-210ENST00000512716 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.62■■■■■ 4.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.56■■■■■ 4.08
RASGEF1B-210ENST00000512716 IQGAP2Q13576 1575 aa40.42■■■■■ 4.06
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRXQ9BXM0 1461 aa40.33■■■■■ 4.05
RASGEF1B-210ENST00000512716 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.27■■■■■ 4.04
RASGEF1B-210ENST00000512716 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.27■■■■■ 4.04
RASGEF1B-210ENST00000512716 EEA1Q15075 1411 aa40.26■■■■■ 4.04
RASGEF1B-210ENST00000512716 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
RASGEF1B-210ENST00000512716 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.24■■■■■ 4.03
RASGEF1B-210ENST00000512716 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.23■■■■■ 4.03
RASGEF1B-210ENST00000512716 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.16■■■■■ 4.02
RASGEF1B-210ENST00000512716 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 DISP1Q96F81 1524 aa40.1■■■■■ 4.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.1■■■■■ 4.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 PTPRGP23470 1445 aa40.09■■■■■ 4.01
RASGEF1B-210ENST00000512716 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
RASGEF1B-210ENST00000512716 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.05■■■■■ 4
RASGEF1B-210ENST00000512716 KIAA0556O60303 1618 aa40.03■■■■■ 4
RASGEF1B-210ENST00000512716 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.96■■■■□ 3.99
RASGEF1B-210ENST00000512716 GOLGA3Q08378 1498 aa39.93■■■■□ 3.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 KIF21BO75037 1637 aa39.91■■■■□ 3.98
RASGEF1B-210ENST00000512716 MAPKBP1O60336 1514 aa39.83■■■■□ 3.97
RASGEF1B-210ENST00000512716 UACAQ9BZF9 1416 aa39.82■■■■□ 3.96
RASGEF1B-210ENST00000512716 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.79■■■■□ 3.96
RASGEF1B-210ENST00000512716 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.77■■■■□ 3.96
RASGEF1B-210ENST00000512716 ABCC2Q92887 1545 aa39.77■■■■□ 3.96
RASGEF1B-210ENST00000512716 SAMD9Q5K651 1589 aa39.67■■■■□ 3.94
RASGEF1B-210ENST00000512716 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.67■■■■□ 3.94
RASGEF1B-210ENST00000512716 P3H3Q8IVL6 736 aa39.64■■■■□ 3.94
RASGEF1B-210ENST00000512716 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.63■■■■□ 3.94
RASGEF1B-210ENST00000512716 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.63■■■■□ 3.93
RASGEF1B-210ENST00000512716 DIP2BQ9P265 1576 aa39.63■■■■□ 3.93
RASGEF1B-210ENST00000512716 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.6■■■■□ 3.93
RASGEF1B-210ENST00000512716 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
RASGEF1B-210ENST00000512716 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.59■■■■□ 3.93
RASGEF1B-210ENST00000512716 ABCA8O94911 1581 aa39.59■■■■□ 3.93
RASGEF1B-210ENST00000512716 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
RASGEF1B-210ENST00000512716 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
RASGEF1B-210ENST00000512716 ASXL2Q76L83 1435 aa39.54■■■■□ 3.92
RASGEF1B-210ENST00000512716 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.46■■■■□ 3.91
RASGEF1B-210ENST00000512716 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.42■■■■□ 3.9
RASGEF1B-210ENST00000512716 TSPOAP1O95153 1857 aa39.4■■■■□ 3.9
RASGEF1B-210ENST00000512716 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.37■■■■□ 3.89
RASGEF1B-210ENST00000512716 GLI2P10070 1586 aa39.34■■■■□ 3.89
RASGEF1B-210ENST00000512716 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.31■■■■□ 3.88
RASGEF1B-210ENST00000512716 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARID3CA6NKF2 412 aa39.27■■■■□ 3.88
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATP10BO94823 1461 aa39.24■■■■□ 3.87
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.21■■■■□ 3.87
RASGEF1B-210ENST00000512716 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.18■■■■□ 3.86
RASGEF1B-210ENST00000512716 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
RASGEF1B-210ENST00000512716 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
RASGEF1B-210ENST00000512716 KCNH8Q96L42 1107 aa39.13■■■■□ 3.85
RASGEF1B-210ENST00000512716 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
RASGEF1B-210ENST00000512716 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
RASGEF1B-210ENST00000512716 FMN1Q68DA7 1419 aa39.08■■■■□ 3.85
RASGEF1B-210ENST00000512716 KDM6BO15054 1643 aa39.08■■■■□ 3.85
RASGEF1B-210ENST00000512716 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.06■■■■□ 3.84
RASGEF1B-210ENST00000512716 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.01■■■■□ 3.84
RASGEF1B-210ENST00000512716 CD109Q6YHK3 1445 aa38.97■■■■□ 3.83
RASGEF1B-210ENST00000512716 HECW1Q76N89 1606 aa38.97■■■■□ 3.83
RASGEF1B-210ENST00000512716 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 CLIP1P30622 1438 aa38.9■■■■□ 3.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.9■■■■□ 3.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.89■■■■□ 3.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.89■■■■□ 3.82
RASGEF1B-210ENST00000512716 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
RASGEF1B-210ENST00000512716 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.77■■■■□ 3.8
RASGEF1B-210ENST00000512716 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
RASGEF1B-210ENST00000512716 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.73■■■■□ 3.79
RASGEF1B-210ENST00000512716 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.68■■■■□ 3.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 CEP162Q5TB80 1403 aa38.67■■■■□ 3.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.66■■■■□ 3.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.64■■■■□ 3.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.64■■■■□ 3.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.64■■■■□ 3.78
RASGEF1B-210ENST00000512716 NEO1Q92859 1461 aa38.58■■■■□ 3.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.57■■■■□ 3.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.57■■■■□ 3.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 KIF14Q15058 1648 aa38.56■■■■□ 3.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.52■■■■□ 3.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.48■■■■□ 3.75
RASGEF1B-210ENST00000512716 FANCAO15360 1455 aa38.47■■■■□ 3.75
RASGEF1B-210ENST00000512716 PLCH2O75038 1416 aa38.42■■■■□ 3.74
RASGEF1B-210ENST00000512716 AKNAQ7Z591 1439 aa38.4■■■■□ 3.74
RASGEF1B-210ENST00000512716 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
RASGEF1B-210ENST00000512716 RAPGEF3O95398 923 aa38.36■■■■□ 3.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.33■■■■□ 3.73
RASGEF1B-210ENST00000512716 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.72
RASGEF1B-210ENST00000512716 RICTORQ6R327 1708 aa38.3■■■■□ 3.72
RASGEF1B-210ENST00000512716 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.28■■■■□ 3.72
RASGEF1B-210ENST00000512716 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.28■■■■□ 3.72
RASGEF1B-210ENST00000512716 ADGRL1O94910 1474 aa38.27■■■■□ 3.72
RASGEF1B-210ENST00000512716 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.26■■■■□ 3.72
RASGEF1B-210ENST00000512716 PREX2Q70Z35 1606 aa38.24■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms