RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510424.2

PHOX2B-202, Transcript of paired like homeobox 2B, humanhuman

TSL 3

Gene PHOX2B, Length 540 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2B-202ENST00000510424 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.43■■■■■ 4.54
PHOX2B-202ENST00000510424 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.31■■■■■ 4.52
PHOX2B-202ENST00000510424 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.3■■■■■ 4.52
PHOX2B-202ENST00000510424 JPH4Q96JJ6 628 aa43.27■■■■■ 4.52
PHOX2B-202ENST00000510424 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.2■■■■■ 4.51
PHOX2B-202ENST00000510424 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.15■■■■■ 4.5
PHOX2B-202ENST00000510424 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.02■■■■■ 4.48
PHOX2B-202ENST00000510424 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.97■■■■■ 4.47
PHOX2B-202ENST00000510424 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.94■■■■■ 4.47
PHOX2B-202ENST00000510424 MAPKBP1O60336 1514 aa42.91■■■■■ 4.46
PHOX2B-202ENST00000510424 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.88■■■■■ 4.46
PHOX2B-202ENST00000510424 IQGAP2Q13576 1575 aa42.88■■■■■ 4.45
PHOX2B-202ENST00000510424 DIP2BQ9P265 1576 aa42.85■■■■■ 4.45
PHOX2B-202ENST00000510424 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.84■■■■■ 4.45
PHOX2B-202ENST00000510424 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
PHOX2B-202ENST00000510424 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.69■■■■■ 4.42
PHOX2B-202ENST00000510424 KDM6BO15054 1643 aa42.68■■■■■ 4.42
PHOX2B-202ENST00000510424 TSPOAP1O95153 1857 aa42.68■■■■■ 4.42
PHOX2B-202ENST00000510424 PTPRGP23470 1445 aa42.67■■■■■ 4.42
PHOX2B-202ENST00000510424 DISP1Q96F81 1524 aa42.63■■■■■ 4.42
PHOX2B-202ENST00000510424 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.63■■■■■ 4.41
PHOX2B-202ENST00000510424 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.62■■■■■ 4.41
PHOX2B-202ENST00000510424 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.59■■■■■ 4.41
PHOX2B-202ENST00000510424 PRXQ9BXM0 1461 aa42.57■■■■■ 4.41
PHOX2B-202ENST00000510424 KIAA0556O60303 1618 aa42.51■■■■■ 4.4
PHOX2B-202ENST00000510424 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.45■■■■■ 4.39
PHOX2B-202ENST00000510424 ABCC2Q92887 1545 aa42.39■■■■■ 4.38
PHOX2B-202ENST00000510424 UACAQ9BZF9 1416 aa42.37■■■■■ 4.37
PHOX2B-202ENST00000510424 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.34■■■■■ 4.37
PHOX2B-202ENST00000510424 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.33■■■■■ 4.37
PHOX2B-202ENST00000510424 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.26■■■■■ 4.36
PHOX2B-202ENST00000510424 ASXL2Q76L83 1435 aa42.26■■■■■ 4.36
PHOX2B-202ENST00000510424 GOLGA3Q08378 1498 aa42.24■■■■■ 4.35
PHOX2B-202ENST00000510424 GLI2P10070 1586 aa42.23■■■■■ 4.35
PHOX2B-202ENST00000510424 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
PHOX2B-202ENST00000510424 EEA1Q15075 1411 aa42.22■■■■■ 4.35
PHOX2B-202ENST00000510424 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
PHOX2B-202ENST00000510424 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
PHOX2B-202ENST00000510424 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.15■■■■■ 4.34
PHOX2B-202ENST00000510424 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.07■■■■■ 4.33
PHOX2B-202ENST00000510424 ABCA8O94911 1581 aa42.06■■■■■ 4.32
PHOX2B-202ENST00000510424 P3H3Q8IVL6 736 aa42.06■■■■■ 4.32
PHOX2B-202ENST00000510424 ADGRL1O94910 1474 aa42.01■■■■■ 4.32
PHOX2B-202ENST00000510424 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42■■■■■ 4.31
PHOX2B-202ENST00000510424 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
PHOX2B-202ENST00000510424 SAMD9Q5K651 1589 aa41.98■■■■■ 4.31
PHOX2B-202ENST00000510424 KIF21BO75037 1637 aa41.95■■■■■ 4.31
PHOX2B-202ENST00000510424 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.95■■■■■ 4.31
PHOX2B-202ENST00000510424 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
PHOX2B-202ENST00000510424 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
PHOX2B-202ENST00000510424 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.88■■■■■ 4.29
PHOX2B-202ENST00000510424 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
PHOX2B-202ENST00000510424 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.85■■■■■ 4.29
PHOX2B-202ENST00000510424 ARID3CA6NKF2 412 aa41.84■■■■■ 4.29
PHOX2B-202ENST00000510424 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.76■■■■■ 4.28
PHOX2B-202ENST00000510424 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.74■■■■■ 4.27
PHOX2B-202ENST00000510424 KCNH8Q96L42 1107 aa41.7■■■■■ 4.27
PHOX2B-202ENST00000510424 ATP10BO94823 1461 aa41.69■■■■■ 4.26
PHOX2B-202ENST00000510424 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.66■■■■■ 4.26
PHOX2B-202ENST00000510424 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.62■■■■■ 4.25
PHOX2B-202ENST00000510424 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.62■■■■■ 4.25
PHOX2B-202ENST00000510424 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
PHOX2B-202ENST00000510424 CD109Q6YHK3 1445 aa41.59■■■■■ 4.25
PHOX2B-202ENST00000510424 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.56■■■■■ 4.24
PHOX2B-202ENST00000510424 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
PHOX2B-202ENST00000510424 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
PHOX2B-202ENST00000510424 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
PHOX2B-202ENST00000510424 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.39■■■■■ 4.22
PHOX2B-202ENST00000510424 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.38■■■■■ 4.21
PHOX2B-202ENST00000510424 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
PHOX2B-202ENST00000510424 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.26■■■■■ 4.2
PHOX2B-202ENST00000510424 FMN1Q68DA7 1419 aa41.2■■■■■ 4.19
PHOX2B-202ENST00000510424 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.2■■■■■ 4.19
PHOX2B-202ENST00000510424 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
PHOX2B-202ENST00000510424 HECW1Q76N89 1606 aa41.18■■■■■ 4.18
PHOX2B-202ENST00000510424 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.12■■■■■ 4.17
PHOX2B-202ENST00000510424 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.1■■■■■ 4.17
PHOX2B-202ENST00000510424 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.1■■■■■ 4.17
PHOX2B-202ENST00000510424 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.05■■■■■ 4.16
PHOX2B-202ENST00000510424 NEO1Q92859 1461 aa41.05■■■■■ 4.16
PHOX2B-202ENST00000510424 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.03■■■■■ 4.16
PHOX2B-202ENST00000510424 PTPRMP28827 1452 aa41■■■■■ 4.15
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PHOX2B-202ENST00000510424 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
PHOX2B-202ENST00000510424 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.95■■■■■ 4.15
PHOX2B-202ENST00000510424 FANCAO15360 1455 aa40.92■■■■■ 4.14
PHOX2B-202ENST00000510424 FBXO41Q8TF61 875 aa40.92■■■■■ 4.14
PHOX2B-202ENST00000510424 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.9■■■■■ 4.14
PHOX2B-202ENST00000510424 KIF14Q15058 1648 aa40.9■■■■■ 4.14
PHOX2B-202ENST00000510424 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.9■■■■■ 4.14
PHOX2B-202ENST00000510424 CLIP1P30622 1438 aa40.89■■■■■ 4.14
PHOX2B-202ENST00000510424 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
PHOX2B-202ENST00000510424 AKNAQ7Z591 1439 aa40.86■■■■■ 4.13
PHOX2B-202ENST00000510424 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.84■■■■■ 4.13
PHOX2B-202ENST00000510424 MADDQ8WXG6 1647 aa40.83■■■■■ 4.13
PHOX2B-202ENST00000510424 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
PHOX2B-202ENST00000510424 RICTORQ6R327 1708 aa40.82■■■■■ 4.13
PHOX2B-202ENST00000510424 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.12
PHOX2B-202ENST00000510424 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.81■■■■■ 4.12
PHOX2B-202ENST00000510424 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
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