RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510319.5

RAI14-215, Transcript of retinoic acid induced 14, human

TSL 4

Gene RAI14, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAI14-215	ENST00000510319	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RAI14-215	ENST00000510319	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		33.23	■■■□□ 2.91
RAI14-215	ENST00000510319	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
RAI14-215	ENST00000510319	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RAI14-215	ENST00000510319	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.05	■■■□□ 2.88
RAI14-215	ENST00000510319	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
RAI14-215	ENST00000510319	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.89	■■■□□ 2.86
RAI14-215	ENST00000510319	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.85	■■■□□ 2.85
RAI14-215	ENST00000510319	PTPRG	P23470	1445 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RAI14-215	ENST00000510319	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.82	■■■□□ 2.84
RAI14-215	ENST00000510319	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.82	■■■□□ 2.84
RAI14-215	ENST00000510319	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.82	■■■□□ 2.84
RAI14-215	ENST00000510319	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.79	■■■□□ 2.84
RAI14-215	ENST00000510319	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
RAI14-215	ENST00000510319	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.73	■■■□□ 2.83
RAI14-215	ENST00000510319	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RAI14-215	ENST00000510319	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RAI14-215	ENST00000510319	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RAI14-215	ENST00000510319	EEA1	Q15075	1411 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RAI14-215	ENST00000510319	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RAI14-215	ENST00000510319	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RAI14-215	ENST00000510319	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RAI14-215	ENST00000510319	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RAI14-215	ENST00000510319	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RAI14-215	ENST00000510319	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RAI14-215	ENST00000510319	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RAI14-215	ENST00000510319	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RAI14-215	ENST00000510319	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RAI14-215	ENST00000510319	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.47	■■■□□ 2.79
RAI14-215	ENST00000510319	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RAI14-215	ENST00000510319	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
RAI14-215	ENST00000510319	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RAI14-215	ENST00000510319	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RAI14-215	ENST00000510319	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RAI14-215	ENST00000510319	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RAI14-215	ENST00000510319	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.34	■■■□□ 2.77
RAI14-215	ENST00000510319	KIF21B	O75037	1637 aa		32.3	■■■□□ 2.76
RAI14-215	ENST00000510319	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
RAI14-215	ENST00000510319	ABCA8	O94911	1581 aa		32.25	■■■□□ 2.75
RAI14-215	ENST00000510319	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
RAI14-215	ENST00000510319	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RAI14-215	ENST00000510319	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RAI14-215	ENST00000510319	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
RAI14-215	ENST00000510319	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RAI14-215	ENST00000510319	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.13	■■■□□ 2.73
RAI14-215	ENST00000510319	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.13	■■■□□ 2.73
RAI14-215	ENST00000510319	GLI2	P10070	1586 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RAI14-215	ENST00000510319	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RAI14-215	ENST00000510319	ATP10B	O94823	1461 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RAI14-215	ENST00000510319	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
RAI14-215	ENST00000510319	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
RAI14-215	ENST00000510319	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RAI14-215	ENST00000510319	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32	■■■□□ 2.71
RAI14-215	ENST00000510319	KDM6B	O15054	1643 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RAI14-215	ENST00000510319	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RAI14-215	ENST00000510319	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
RAI14-215	ENST00000510319	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
RAI14-215	ENST00000510319	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RAI14-215	ENST00000510319	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.89	■■■□□ 2.7
RAI14-215	ENST00000510319	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.89	■■■□□ 2.7
RAI14-215	ENST00000510319	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
RAI14-215	ENST00000510319	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RAI14-215	ENST00000510319	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
RAI14-215	ENST00000510319	FMN1	Q68DA7	1419 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RAI14-215	ENST00000510319	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
RAI14-215	ENST00000510319	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RAI14-215	ENST00000510319	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RAI14-215	ENST00000510319	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
RAI14-215	ENST00000510319	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.67	■■■□□ 2.66
RAI14-215	ENST00000510319	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RAI14-215	ENST00000510319	CLIP1	P30622	1438 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RAI14-215	ENST00000510319	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
RAI14-215	ENST00000510319	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.56	■■■□□ 2.64
RAI14-215	ENST00000510319	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.53	■■■□□ 2.64
RAI14-215	ENST00000510319	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.53	■■■□□ 2.64
RAI14-215	ENST00000510319	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.53	■■■□□ 2.64
RAI14-215	ENST00000510319	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.52	■■■□□ 2.64
RAI14-215	ENST00000510319	NEO1	Q92859	1461 aa		31.51	■■■□□ 2.63
RAI14-215	ENST00000510319	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.5	■■■□□ 2.63
RAI14-215	ENST00000510319	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.47	■■■□□ 2.63
RAI14-215	ENST00000510319	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
RAI14-215	ENST00000510319	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RAI14-215	ENST00000510319	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
RAI14-215	ENST00000510319	FANCA	O15360	1455 aa		31.42	■■■□□ 2.62
RAI14-215	ENST00000510319	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.41	■■■□□ 2.62
RAI14-215	ENST00000510319	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RAI14-215	ENST00000510319	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.39	■■■□□ 2.62
RAI14-215	ENST00000510319	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.39	■■■□□ 2.62
RAI14-215	ENST00000510319	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.39	■■■□□ 2.62
RAI14-215	ENST00000510319	PLCH2	O75038	1416 aa		31.38	■■■□□ 2.61
RAI14-215	ENST00000510319	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.34	■■■□□ 2.61
RAI14-215	ENST00000510319	KIF14	Q15058	1648 aa		31.34	■■■□□ 2.61
RAI14-215	ENST00000510319	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
RAI14-215	ENST00000510319	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.33	■■■□□ 2.61
RAI14-215	ENST00000510319	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.3	■■■□□ 2.6
RAI14-215	ENST00000510319	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.26	■■■□□ 2.6
RAI14-215	ENST00000510319	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.25	■■■□□ 2.59
RAI14-215	ENST00000510319	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RAI14-215	ENST00000510319	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RAI14-215	ENST00000510319	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58

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