RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-216ENST00000510193 JPH4Q96JJ6 628 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-216ENST00000510193 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-216ENST00000510193 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-216ENST00000510193 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-216ENST00000510193 IQGAP2Q13576 1575 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-216ENST00000510193 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-216ENST00000510193 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-216ENST00000510193 MAPKBP1O60336 1514 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-216ENST00000510193 DISP1Q96F81 1524 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-216ENST00000510193 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-216ENST00000510193 PTPRGP23470 1445 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-216ENST00000510193 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-216ENST00000510193 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-216ENST00000510193 PRXQ9BXM0 1461 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP2-216ENST00000510193 DIP2BQ9P265 1576 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-216ENST00000510193 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-216ENST00000510193 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-216ENST00000510193 KIAA0556O60303 1618 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-216ENST00000510193 ABCC2Q92887 1545 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-216ENST00000510193 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-216ENST00000510193 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-216ENST00000510193 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-216ENST00000510193 UACAQ9BZF9 1416 aa21.64■■□□□ 1.06
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-216ENST00000510193 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-216ENST00000510193 ASXL2Q76L83 1435 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-216ENST00000510193 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-216ENST00000510193 GOLGA3Q08378 1498 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-216ENST00000510193 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-216ENST00000510193 ABCA8O94911 1581 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-216ENST00000510193 GLI2P10070 1586 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-216ENST00000510193 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-216ENST00000510193 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-216ENST00000510193 EEA1Q15075 1411 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-216ENST00000510193 TSPOAP1O95153 1857 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP2-216ENST00000510193 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-216ENST00000510193 SAMD9Q5K651 1589 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP2-216ENST00000510193 KDM6BO15054 1643 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 KIF21BO75037 1637 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2-216ENST00000510193 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 P3H3Q8IVL6 736 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-216ENST00000510193 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP2-216ENST00000510193 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-216ENST00000510193 ATP10BO94823 1461 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-216ENST00000510193 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP2-216ENST00000510193 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP2-216ENST00000510193 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2-216ENST00000510193 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-216ENST00000510193 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-216ENST00000510193 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-216ENST00000510193 ARID3CA6NKF2 412 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-216ENST00000510193 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-216ENST00000510193 CD109Q6YHK3 1445 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-216ENST00000510193 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BP2-216ENST00000510193 KCNH8Q96L42 1107 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-216ENST00000510193 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-216ENST00000510193 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.14■□□□□ 0.97
SH3BP2-216ENST00000510193 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP2-216ENST00000510193 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-216ENST00000510193 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP2-216ENST00000510193 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
SH3BP2-216ENST00000510193 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SH3BP2-216ENST00000510193 ADGRL1O94910 1474 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP2-216ENST00000510193 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP2-216ENST00000510193 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
SH3BP2-216ENST00000510193 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.95
SH3BP2-216ENST00000510193 TTC37Q6PGP7 1564 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP2-216ENST00000510193 NEO1Q92859 1461 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP2-216ENST00000510193 HECW1Q76N89 1606 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP2-216ENST00000510193 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP2-216ENST00000510193 FMN1Q68DA7 1419 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP2-216ENST00000510193 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP2-216ENST00000510193 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-216ENST00000510193 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP2-216ENST00000510193 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
SH3BP2-216ENST00000510193 RAPGEF3O95398 923 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-216ENST00000510193 RICTORQ6R327 1708 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-216ENST00000510193 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-216ENST00000510193 FANCAO15360 1455 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-216ENST00000510193 KIF14Q15058 1648 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-216ENST00000510193 AKNAQ7Z591 1439 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-216ENST00000510193 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-216ENST00000510193 PLCH2O75038 1416 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-216ENST00000510193 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-216ENST00000510193 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-216ENST00000510193 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.83■□□□□ 0.92
SH3BP2-216ENST00000510193 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-216ENST00000510193 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.82■□□□□ 0.92
SH3BP2-216ENST00000510193 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP2-216ENST00000510193 CLIP1P30622 1438 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-216ENST00000510193 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-216ENST00000510193 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.77■□□□□ 0.92
SH3BP2-216ENST00000510193 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-216ENST00000510193 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.75■□□□□ 0.91
SH3BP2-216ENST00000510193 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.7 ms