RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504162.1

CDK18-212, Transcript of cyclin dependent kinase 18, humanhuman

TSL 4

Gene CDK18, Length 556 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18-212ENST00000504162 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.15■■■■□ 3.54
CDK18-212ENST00000504162 KIF27Q86VH2 1401 aa37.1■■■■□ 3.53
CDK18-212ENST00000504162 CUL7Q14999 1698 aa37.07■■■■□ 3.52
CDK18-212ENST00000504162 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.04■■■■□ 3.52
CDK18-212ENST00000504162 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.99■■■■□ 3.51
CDK18-212ENST00000504162 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.89■■■■□ 3.5
CDK18-212ENST00000504162 MAPKBP1O60336 1514 aa36.88■■■■□ 3.49
CDK18-212ENST00000504162 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.87■■■■□ 3.49
CDK18-212ENST00000504162 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
CDK18-212ENST00000504162 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.82■■■■□ 3.48
CDK18-212ENST00000504162 DIP2BQ9P265 1576 aa36.82■■■■□ 3.48
CDK18-212ENST00000504162 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.81■■■■□ 3.48
CDK18-212ENST00000504162 PTPRGP23470 1445 aa36.7■■■■□ 3.47
CDK18-212ENST00000504162 IQGAP2Q13576 1575 aa36.69■■■■□ 3.46
CDK18-212ENST00000504162 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
CDK18-212ENST00000504162 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.63■■■■□ 3.45
CDK18-212ENST00000504162 TSPOAP1O95153 1857 aa36.61■■■■□ 3.45
CDK18-212ENST00000504162 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.6■■■■□ 3.45
CDK18-212ENST00000504162 DISP1Q96F81 1524 aa36.58■■■■□ 3.45
CDK18-212ENST00000504162 ABCC2Q92887 1545 aa36.54■■■■□ 3.44
CDK18-212ENST00000504162 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.53■■■■□ 3.44
CDK18-212ENST00000504162 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.47■■■■□ 3.43
CDK18-212ENST00000504162 KDM6BO15054 1643 aa36.47■■■■□ 3.43
CDK18-212ENST00000504162 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.46■■■■□ 3.43
CDK18-212ENST00000504162 ASXL2Q76L83 1435 aa36.44■■■■□ 3.42
CDK18-212ENST00000504162 UACAQ9BZF9 1416 aa36.43■■■■□ 3.42
CDK18-212ENST00000504162 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
CDK18-212ENST00000504162 KIAA0556O60303 1618 aa36.37■■■■□ 3.41
CDK18-212ENST00000504162 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.37■■■■□ 3.41
CDK18-212ENST00000504162 GLI2P10070 1586 aa36.36■■■■□ 3.41
CDK18-212ENST00000504162 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.33■■■■□ 3.41
CDK18-212ENST00000504162 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.31■■■■□ 3.4
CDK18-212ENST00000504162 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
CDK18-212ENST00000504162 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.23■■■■□ 3.39
CDK18-212ENST00000504162 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
CDK18-212ENST00000504162 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.19■■■■□ 3.38
CDK18-212ENST00000504162 PRXQ9BXM0 1461 aa36.18■■■■□ 3.38
CDK18-212ENST00000504162 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
CDK18-212ENST00000504162 ABCA8O94911 1581 aa36.07■■■■□ 3.37
CDK18-212ENST00000504162 GOLGA3Q08378 1498 aa36.06■■■■□ 3.36
CDK18-212ENST00000504162 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.05■■■■□ 3.36
CDK18-212ENST00000504162 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.97■■■■□ 3.35
CDK18-212ENST00000504162 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.87■■■■□ 3.33
CDK18-212ENST00000504162 ADGRL1O94910 1474 aa35.86■■■■□ 3.33
CDK18-212ENST00000504162 KCNH8Q96L42 1107 aa35.86■■■■□ 3.33
CDK18-212ENST00000504162 P3H3Q8IVL6 736 aa35.85■■■■□ 3.33
CDK18-212ENST00000504162 CD109Q6YHK3 1445 aa35.83■■■■□ 3.33
CDK18-212ENST00000504162 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.83■■■■□ 3.33
CDK18-212ENST00000504162 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.82■■■■□ 3.32
CDK18-212ENST00000504162 SAMD9Q5K651 1589 aa35.78■■■■□ 3.32
CDK18-212ENST00000504162 ARID3CA6NKF2 412 aa35.77■■■■□ 3.32
CDK18-212ENST00000504162 ATP10BO94823 1461 aa35.77■■■■□ 3.32
CDK18-212ENST00000504162 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.64■■■■□ 3.3
CDK18-212ENST00000504162 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.6■■■■□ 3.29
CDK18-212ENST00000504162 EEA1Q15075 1411 aa35.58■■■■□ 3.29
CDK18-212ENST00000504162 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.56■■■■□ 3.28
CDK18-212ENST00000504162 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
CDK18-212ENST00000504162 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
CDK18-212ENST00000504162 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
CDK18-212ENST00000504162 KIF21BO75037 1637 aa35.52■■■■□ 3.28
CDK18-212ENST00000504162 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.51■■■■□ 3.28
CDK18-212ENST00000504162 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.42■■■■□ 3.26
CDK18-212ENST00000504162 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
CDK18-212ENST00000504162 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
CDK18-212ENST00000504162 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.38■■■■□ 3.25
CDK18-212ENST00000504162 RAPGEF3O95398 923 aa35.37■■■■□ 3.25
CDK18-212ENST00000504162 NEO1Q92859 1461 aa35.36■■■■□ 3.25
CDK18-212ENST00000504162 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.35■■■■□ 3.25
CDK18-212ENST00000504162 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.32■■■■□ 3.24
CDK18-212ENST00000504162 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.24■■■■□ 3.23
CDK18-212ENST00000504162 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.24■■■■□ 3.23
CDK18-212ENST00000504162 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
CDK18-212ENST00000504162 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
CDK18-212ENST00000504162 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.2■■■■□ 3.23
CDK18-212ENST00000504162 RICTORQ6R327 1708 aa35.19■■■■□ 3.22
CDK18-212ENST00000504162 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.19■■■■□ 3.22
CDK18-212ENST00000504162 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
CDK18-212ENST00000504162 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.14■■■■□ 3.22
CDK18-212ENST00000504162 AKNAQ7Z591 1439 aa35.14■■■■□ 3.22
CDK18-212ENST00000504162 FANCAO15360 1455 aa35.13■■■■□ 3.21
CDK18-212ENST00000504162 PTPRMP28827 1452 aa35.12■■■■□ 3.21
CDK18-212ENST00000504162 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.12■■■■□ 3.21
CDK18-212ENST00000504162 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
CDK18-212ENST00000504162 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.08■■■■□ 3.21
CDK18-212ENST00000504162 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.08■■■■□ 3.21
CDK18-212ENST00000504162 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
CDK18-212ENST00000504162 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.08■■■■□ 3.21
CDK18-212ENST00000504162 MADDQ8WXG6 1647 aa35.06■■■■□ 3.2
CDK18-212ENST00000504162 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.02■■■■□ 3.2
CDK18-212ENST00000504162 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
CDK18-212ENST00000504162 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35■■■■□ 3.19
CDK18-212ENST00000504162 HECW1Q76N89 1606 aa34.99■■■■□ 3.19
CDK18-212ENST00000504162 FMN1Q68DA7 1419 aa34.98■■■■□ 3.19
CDK18-212ENST00000504162 PLCH2O75038 1416 aa34.96■■■■□ 3.19
CDK18-212ENST00000504162 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.96■■■■□ 3.19
CDK18-212ENST00000504162 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.95■■■■□ 3.18
CDK18-212ENST00000504162 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
CDK18-212ENST00000504162 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
CDK18-212ENST00000504162 KIF14Q15058 1648 aa34.91■■■■□ 3.18
CDK18-212ENST00000504162 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.91■■■■□ 3.18
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