RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
USP46-AS1-201ENST00000503051 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.77■■■□□ 2.84
USP46-AS1-201ENST00000503051 JPH4Q96JJ6 628 aa32.75■■■□□ 2.83
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.72■■■□□ 2.83
USP46-AS1-201ENST00000503051 IQGAP2Q13576 1575 aa32.59■■■□□ 2.81
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.57■■■□□ 2.8
USP46-AS1-201ENST00000503051 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.49■■■□□ 2.79
USP46-AS1-201ENST00000503051 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.45■■■□□ 2.79
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.44■■■□□ 2.78
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.37■■■□□ 2.77
USP46-AS1-201ENST00000503051 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.34■■■□□ 2.77
USP46-AS1-201ENST00000503051 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
USP46-AS1-201ENST00000503051 PTPRGP23470 1445 aa32.33■■■□□ 2.77
USP46-AS1-201ENST00000503051 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.32■■■□□ 2.77
USP46-AS1-201ENST00000503051 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.32■■■□□ 2.76
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRXQ9BXM0 1461 aa32.29■■■□□ 2.76
USP46-AS1-201ENST00000503051 DISP1Q96F81 1524 aa32.29■■■□□ 2.76
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIAA0556O60303 1618 aa32.29■■■□□ 2.76
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAPKBP1O60336 1514 aa32.28■■■□□ 2.76
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.27■■■□□ 2.76
USP46-AS1-201ENST00000503051 EEA1Q15075 1411 aa32.18■■■□□ 2.74
USP46-AS1-201ENST00000503051 DIP2BQ9P265 1576 aa32.17■■■□□ 2.74
USP46-AS1-201ENST00000503051 GOLGA3Q08378 1498 aa32.15■■■□□ 2.74
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.15■■■□□ 2.74
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCC2Q92887 1545 aa32.14■■■□□ 2.74
USP46-AS1-201ENST00000503051 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.12■■■□□ 2.73
USP46-AS1-201ENST00000503051 UACAQ9BZF9 1416 aa32.11■■■□□ 2.73
USP46-AS1-201ENST00000503051 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.1■■■□□ 2.73
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.07■■■□□ 2.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 TSPOAP1O95153 1857 aa32.07■■■□□ 2.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 ASXL2Q76L83 1435 aa31.97■■■□□ 2.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.97■■■□□ 2.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIF21BO75037 1637 aa31.96■■■□□ 2.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.95■■■□□ 2.71
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCA8O94911 1581 aa31.9■■■□□ 2.7
USP46-AS1-201ENST00000503051 SAMD9Q5K651 1589 aa31.9■■■□□ 2.7
USP46-AS1-201ENST00000503051 GLI2P10070 1586 aa31.85■■■□□ 2.69
USP46-AS1-201ENST00000503051 KDM6BO15054 1643 aa31.82■■■□□ 2.68
USP46-AS1-201ENST00000503051 P3H3Q8IVL6 736 aa31.81■■■□□ 2.68
USP46-AS1-201ENST00000503051 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
USP46-AS1-201ENST00000503051 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.77■■■□□ 2.68
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.68
USP46-AS1-201ENST00000503051 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.75■■■□□ 2.67
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.73■■■□□ 2.67
USP46-AS1-201ENST00000503051 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.7■■■□□ 2.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.66■■■□□ 2.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.66■■■□□ 2.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.64■■■□□ 2.66
USP46-AS1-201ENST00000503051 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.63■■■□□ 2.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARID3CA6NKF2 412 aa31.62■■■□□ 2.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP10BO94823 1461 aa31.57■■■□□ 2.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 KCNH8Q96L42 1107 aa31.55■■■□□ 2.64
USP46-AS1-201ENST00000503051 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 CD109Q6YHK3 1445 aa31.49■■■□□ 2.63
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.44■■■□□ 2.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.43■■■□□ 2.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.39■■■□□ 2.62
USP46-AS1-201ENST00000503051 HECW1Q76N89 1606 aa31.37■■■□□ 2.61
USP46-AS1-201ENST00000503051 FMN1Q68DA7 1419 aa31.36■■■□□ 2.61
USP46-AS1-201ENST00000503051 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.27■■■□□ 2.6
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.18■■■□□ 2.58
USP46-AS1-201ENST00000503051 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.18■■■□□ 2.58
USP46-AS1-201ENST00000503051 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.17■■■□□ 2.58
USP46-AS1-201ENST00000503051 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.17■■■□□ 2.58
USP46-AS1-201ENST00000503051 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.17■■■□□ 2.58
USP46-AS1-201ENST00000503051 NEO1Q92859 1461 aa31.16■■■□□ 2.58
USP46-AS1-201ENST00000503051 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
USP46-AS1-201ENST00000503051 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.15■■■□□ 2.58
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADGRL1O94910 1474 aa31.09■■■□□ 2.57
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.09■■■□□ 2.57
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIF14Q15058 1648 aa31.09■■■□□ 2.57
USP46-AS1-201ENST00000503051 CLIP1P30622 1438 aa31.08■■■□□ 2.57
USP46-AS1-201ENST00000503051 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.07■■■□□ 2.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 FANCAO15360 1455 aa31.05■■■□□ 2.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.04■■■□□ 2.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.03■■■□□ 2.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.02■■■□□ 2.56
USP46-AS1-201ENST00000503051 RICTORQ6R327 1708 aa31.01■■■□□ 2.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31■■■□□ 2.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 AKNAQ7Z591 1439 aa30.98■■■□□ 2.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAPGEF3O95398 923 aa30.96■■■□□ 2.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 CEP162Q5TB80 1403 aa30.96■■■□□ 2.55
USP46-AS1-201ENST00000503051 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.92■■■□□ 2.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLCH2O75038 1416 aa30.91■■■□□ 2.54
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.88■■■□□ 2.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.87■■■□□ 2.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.84■■■□□ 2.53
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