RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502501.1

PROM1-202, Transcript of prominin 1, humanhuman

TSL 4

Gene PROM1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1-202ENST00000502501 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.45■■■■■ 4.55
PROM1-202ENST00000502501 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.44■■■■■ 4.54
PROM1-202ENST00000502501 JPH4Q96JJ6 628 aa43.39■■■■■ 4.54
PROM1-202ENST00000502501 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
PROM1-202ENST00000502501 PRXQ9BXM0 1461 aa43.32■■■■■ 4.52
PROM1-202ENST00000502501 EEA1Q15075 1411 aa43.31■■■■■ 4.52
PROM1-202ENST00000502501 IQGAP2Q13576 1575 aa43.27■■■■■ 4.52
PROM1-202ENST00000502501 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.16■■■■■ 4.5
PROM1-202ENST00000502501 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.09■■■■■ 4.49
PROM1-202ENST00000502501 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.09■■■■■ 4.49
PROM1-202ENST00000502501 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.07■■■■■ 4.48
PROM1-202ENST00000502501 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.03■■■■■ 4.48
PROM1-202ENST00000502501 DISP1Q96F81 1524 aa42.96■■■■■ 4.47
PROM1-202ENST00000502501 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.89■■■■■ 4.46
PROM1-202ENST00000502501 KIF21BO75037 1637 aa42.86■■■■■ 4.45
PROM1-202ENST00000502501 KIAA0556O60303 1618 aa42.86■■■■■ 4.45
PROM1-202ENST00000502501 PTPRGP23470 1445 aa42.82■■■■■ 4.45
PROM1-202ENST00000502501 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.8■■■■■ 4.44
PROM1-202ENST00000502501 GOLGA3Q08378 1498 aa42.8■■■■■ 4.44
PROM1-202ENST00000502501 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.67■■■■■ 4.42
PROM1-202ENST00000502501 MAPKBP1O60336 1514 aa42.66■■■■■ 4.42
PROM1-202ENST00000502501 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
PROM1-202ENST00000502501 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
PROM1-202ENST00000502501 UACAQ9BZF9 1416 aa42.59■■■■■ 4.41
PROM1-202ENST00000502501 SAMD9Q5K651 1589 aa42.58■■■■■ 4.41
PROM1-202ENST00000502501 ABCC2Q92887 1545 aa42.58■■■■■ 4.41
PROM1-202ENST00000502501 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.55■■■■■ 4.4
PROM1-202ENST00000502501 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.44■■■■■ 4.38
PROM1-202ENST00000502501 ABCA8O94911 1581 aa42.41■■■■■ 4.38
PROM1-202ENST00000502501 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.41■■■■■ 4.38
PROM1-202ENST00000502501 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.4■■■■■ 4.38
PROM1-202ENST00000502501 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
PROM1-202ENST00000502501 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.39■■■■■ 4.38
PROM1-202ENST00000502501 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.35■■■■■ 4.37
PROM1-202ENST00000502501 DIP2BQ9P265 1576 aa42.35■■■■■ 4.37
PROM1-202ENST00000502501 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
PROM1-202ENST00000502501 ASXL2Q76L83 1435 aa42.23■■■■■ 4.35
PROM1-202ENST00000502501 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
PROM1-202ENST00000502501 GLI2P10070 1586 aa42.15■■■■■ 4.34
PROM1-202ENST00000502501 P3H3Q8IVL6 736 aa42.14■■■■■ 4.34
PROM1-202ENST00000502501 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.13■■■■■ 4.34
PROM1-202ENST00000502501 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.13■■■■■ 4.33
PROM1-202ENST00000502501 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.12■■■■■ 4.33
PROM1-202ENST00000502501 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.06■■■■■ 4.32
PROM1-202ENST00000502501 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
PROM1-202ENST00000502501 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.03■■■■■ 4.32
PROM1-202ENST00000502501 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
PROM1-202ENST00000502501 ATP10BO94823 1461 aa41.98■■■■■ 4.31
PROM1-202ENST00000502501 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
PROM1-202ENST00000502501 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.95■■■■■ 4.31
PROM1-202ENST00000502501 FMN1Q68DA7 1419 aa41.93■■■■■ 4.3
PROM1-202ENST00000502501 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.91■■■■■ 4.3
PROM1-202ENST00000502501 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
PROM1-202ENST00000502501 TSPOAP1O95153 1857 aa41.79■■■■■ 4.28
PROM1-202ENST00000502501 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.79■■■■■ 4.28
PROM1-202ENST00000502501 HECW1Q76N89 1606 aa41.75■■■■■ 4.27
PROM1-202ENST00000502501 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.72■■■■■ 4.27
PROM1-202ENST00000502501 CLIP1P30622 1438 aa41.69■■■■■ 4.27
PROM1-202ENST00000502501 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.67■■■■■ 4.26
PROM1-202ENST00000502501 ARID3CA6NKF2 412 aa41.66■■■■■ 4.26
PROM1-202ENST00000502501 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.66■■■■■ 4.26
PROM1-202ENST00000502501 KDM6BO15054 1643 aa41.65■■■■■ 4.26
PROM1-202ENST00000502501 CD109Q6YHK3 1445 aa41.61■■■■■ 4.25
PROM1-202ENST00000502501 KCNH8Q96L42 1107 aa41.58■■■■■ 4.25
PROM1-202ENST00000502501 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.58■■■■■ 4.25
PROM1-202ENST00000502501 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
PROM1-202ENST00000502501 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
PROM1-202ENST00000502501 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
PROM1-202ENST00000502501 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.53■■■■■ 4.24
PROM1-202ENST00000502501 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
PROM1-202ENST00000502501 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.51■■■■■ 4.24
PROM1-202ENST00000502501 CEP162Q5TB80 1403 aa41.47■■■■■ 4.23
PROM1-202ENST00000502501 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.47■■■■■ 4.23
PROM1-202ENST00000502501 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.47■■■■■ 4.23
PROM1-202ENST00000502501 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
PROM1-202ENST00000502501 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.38■■■■■ 4.22
PROM1-202ENST00000502501 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.38■■■■■ 4.21
PROM1-202ENST00000502501 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
PROM1-202ENST00000502501 NEO1Q92859 1461 aa41.34■■■■■ 4.21
PROM1-202ENST00000502501 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
PROM1-202ENST00000502501 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
PROM1-202ENST00000502501 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.32■■■■■ 4.2
PROM1-202ENST00000502501 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.32■■■■■ 4.2
PROM1-202ENST00000502501 KIF14Q15058 1648 aa41.27■■■■■ 4.2
PROM1-202ENST00000502501 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.25■■■■■ 4.19
PROM1-202ENST00000502501 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.23■■■■■ 4.19
PROM1-202ENST00000502501 PLCH2O75038 1416 aa41.14■■■■■ 4.18
PROM1-202ENST00000502501 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.13■■■■■ 4.18
PROM1-202ENST00000502501 FANCAO15360 1455 aa41.13■■■■■ 4.17
PROM1-202ENST00000502501 AKNAQ7Z591 1439 aa41.04■■■■■ 4.16
PROM1-202ENST00000502501 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.04■■■■■ 4.16
PROM1-202ENST00000502501 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.99■■■■■ 4.15
PROM1-202ENST00000502501 PREX2Q70Z35 1606 aa40.96■■■■■ 4.15
PROM1-202ENST00000502501 RICTORQ6R327 1708 aa40.96■■■■■ 4.15
PROM1-202ENST00000502501 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
PROM1-202ENST00000502501 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.93■■■■■ 4.14
PROM1-202ENST00000502501 ADGRL1O94910 1474 aa40.9■■■■■ 4.14
PROM1-202ENST00000502501 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.9■■■■■ 4.14
PROM1-202ENST00000502501 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.9■■■■■ 4.14
PROM1-202ENST00000502501 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.89■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms