RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498817.5

ALS2CL-210, Transcript of ALS2 C-terminal like, humanhuman

TSL 3

Gene ALS2CL, Length 1,065 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CL-210ENST00000498817 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.35■■■■□ 3.25
ALS2CL-210ENST00000498817 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.3■■■■□ 3.24
ALS2CL-210ENST00000498817 CUL7Q14999 1698 aa35.28■■■■□ 3.24
ALS2CL-210ENST00000498817 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.24■■■■□ 3.23
ALS2CL-210ENST00000498817 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.97■■■■□ 3.19
ALS2CL-210ENST00000498817 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
ALS2CL-210ENST00000498817 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.91■■■■□ 3.18
ALS2CL-210ENST00000498817 IQGAP2Q13576 1575 aa34.91■■■■□ 3.18
ALS2CL-210ENST00000498817 PTPRGP23470 1445 aa34.9■■■■□ 3.18
ALS2CL-210ENST00000498817 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.9■■■■□ 3.18
ALS2CL-210ENST00000498817 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.86■■■■□ 3.17
ALS2CL-210ENST00000498817 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.84■■■■□ 3.17
ALS2CL-210ENST00000498817 DISP1Q96F81 1524 aa34.8■■■■□ 3.16
ALS2CL-210ENST00000498817 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.79■■■■□ 3.16
ALS2CL-210ENST00000498817 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.76■■■■□ 3.16
ALS2CL-210ENST00000498817 MAPKBP1O60336 1514 aa34.76■■■■□ 3.15
ALS2CL-210ENST00000498817 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.75■■■■□ 3.15
ALS2CL-210ENST00000498817 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.73■■■■□ 3.15
ALS2CL-210ENST00000498817 PRXQ9BXM0 1461 aa34.71■■■■□ 3.15
ALS2CL-210ENST00000498817 DIP2BQ9P265 1576 aa34.64■■■■□ 3.14
ALS2CL-210ENST00000498817 ABCC2Q92887 1545 aa34.63■■■■□ 3.13
ALS2CL-210ENST00000498817 UACAQ9BZF9 1416 aa34.62■■■■□ 3.13
ALS2CL-210ENST00000498817 KIAA0556O60303 1618 aa34.6■■■■□ 3.13
ALS2CL-210ENST00000498817 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.58■■■■□ 3.13
ALS2CL-210ENST00000498817 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.57■■■■□ 3.12
ALS2CL-210ENST00000498817 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.54■■■■□ 3.12
ALS2CL-210ENST00000498817 ASXL2Q76L83 1435 aa34.52■■■■□ 3.12
ALS2CL-210ENST00000498817 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.45■■■■□ 3.1
ALS2CL-210ENST00000498817 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.44■■■■□ 3.1
ALS2CL-210ENST00000498817 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
ALS2CL-210ENST00000498817 GOLGA3Q08378 1498 aa34.43■■■■□ 3.1
ALS2CL-210ENST00000498817 P3H3Q8IVL6 736 aa34.38■■■■□ 3.09
ALS2CL-210ENST00000498817 TSPOAP1O95153 1857 aa34.37■■■■□ 3.09
ALS2CL-210ENST00000498817 EEA1Q15075 1411 aa34.34■■■■□ 3.09
ALS2CL-210ENST00000498817 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
ALS2CL-210ENST00000498817 GLI2P10070 1586 aa34.3■■■■□ 3.08
ALS2CL-210ENST00000498817 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
ALS2CL-210ENST00000498817 ABCA8O94911 1581 aa34.29■■■■□ 3.08
ALS2CL-210ENST00000498817 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.27■■■■□ 3.08
ALS2CL-210ENST00000498817 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
ALS2CL-210ENST00000498817 KDM6BO15054 1643 aa34.23■■■■□ 3.07
ALS2CL-210ENST00000498817 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
ALS2CL-210ENST00000498817 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.2■■■■□ 3.06
ALS2CL-210ENST00000498817 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
ALS2CL-210ENST00000498817 ARID3CA6NKF2 412 aa34.19■■■■□ 3.06
ALS2CL-210ENST00000498817 SAMD9Q5K651 1589 aa34.15■■■■□ 3.06
ALS2CL-210ENST00000498817 KCNH8Q96L42 1107 aa34.14■■■■□ 3.06
ALS2CL-210ENST00000498817 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.11■■■■□ 3.05
ALS2CL-210ENST00000498817 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.1■■■■□ 3.05
ALS2CL-210ENST00000498817 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.05
ALS2CL-210ENST00000498817 ATP10BO94823 1461 aa34.07■■■■□ 3.04
ALS2CL-210ENST00000498817 KIF21BO75037 1637 aa34.05■■■■□ 3.04
ALS2CL-210ENST00000498817 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.04■■■■□ 3.04
ALS2CL-210ENST00000498817 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.99■■■■□ 3.03
ALS2CL-210ENST00000498817 CD109Q6YHK3 1445 aa33.98■■■■□ 3.03
ALS2CL-210ENST00000498817 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.94■■■■□ 3.02
ALS2CL-210ENST00000498817 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.93■■■■□ 3.02
ALS2CL-210ENST00000498817 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
ALS2CL-210ENST00000498817 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
ALS2CL-210ENST00000498817 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
ALS2CL-210ENST00000498817 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
ALS2CL-210ENST00000498817 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.89■■■■□ 3.02
ALS2CL-210ENST00000498817 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.87■■■■□ 3.01
ALS2CL-210ENST00000498817 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.83■■■■□ 3.01
ALS2CL-210ENST00000498817 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.72■■■□□ 2.99
ALS2CL-210ENST00000498817 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.7■■■□□ 2.99
ALS2CL-210ENST00000498817 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.69■■■□□ 2.98
ALS2CL-210ENST00000498817 ADGRL1O94910 1474 aa33.64■■■□□ 2.98
ALS2CL-210ENST00000498817 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
ALS2CL-210ENST00000498817 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
ALS2CL-210ENST00000498817 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.62■■■□□ 2.97
ALS2CL-210ENST00000498817 FMN1Q68DA7 1419 aa33.57■■■□□ 2.96
ALS2CL-210ENST00000498817 RAPGEF3O95398 923 aa33.57■■■□□ 2.96
ALS2CL-210ENST00000498817 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.55■■■□□ 2.96
ALS2CL-210ENST00000498817 NEO1Q92859 1461 aa33.53■■■□□ 2.96
ALS2CL-210ENST00000498817 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.51■■■□□ 2.95
ALS2CL-210ENST00000498817 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.45■■■□□ 2.95
ALS2CL-210ENST00000498817 HECW1Q76N89 1606 aa33.45■■■□□ 2.95
ALS2CL-210ENST00000498817 FANCAO15360 1455 aa33.4■■■□□ 2.94
ALS2CL-210ENST00000498817 AKNAQ7Z591 1439 aa33.4■■■□□ 2.94
ALS2CL-210ENST00000498817 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.38■■■□□ 2.93
ALS2CL-210ENST00000498817 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
ALS2CL-210ENST00000498817 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
ALS2CL-210ENST00000498817 PLCH2O75038 1416 aa33.31■■■□□ 2.92
ALS2CL-210ENST00000498817 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
ALS2CL-210ENST00000498817 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.28■■■□□ 2.92
ALS2CL-210ENST00000498817 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.28■■■□□ 2.92
ALS2CL-210ENST00000498817 CLIP1P30622 1438 aa33.28■■■□□ 2.92
ALS2CL-210ENST00000498817 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
ALS2CL-210ENST00000498817 KIF14Q15058 1648 aa33.27■■■□□ 2.92
ALS2CL-210ENST00000498817 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.24■■■□□ 2.91
ALS2CL-210ENST00000498817 RICTORQ6R327 1708 aa33.22■■■□□ 2.91
ALS2CL-210ENST00000498817 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.21■■■□□ 2.91
ALS2CL-210ENST00000498817 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.2■■■□□ 2.91
ALS2CL-210ENST00000498817 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
ALS2CL-210ENST00000498817 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.16■■■□□ 2.9
ALS2CL-210ENST00000498817 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.15■■■□□ 2.9
ALS2CL-210ENST00000498817 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.14■■■□□ 2.9
ALS2CL-210ENST00000498817 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.12■■■□□ 2.89
ALS2CL-210ENST00000498817 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms