RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497251.1

TRAPPC3-207, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-207ENST00000497251 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.45■■■□□ 2.3
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC3-207ENST00000497251 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC3-207ENST00000497251 CUL7Q14999 1698 aa29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC3-207ENST00000497251 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC3-207ENST00000497251 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAPKBP1O60336 1514 aa29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3-207ENST00000497251 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3-207ENST00000497251 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC3-207ENST00000497251 PTPRGP23470 1445 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3-207ENST00000497251 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC3-207ENST00000497251 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3-207ENST00000497251 DIP2BQ9P265 1576 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC3-207ENST00000497251 IQGAP2Q13576 1575 aa29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCC2Q92887 1545 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3-207ENST00000497251 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29■■■□□ 2.23
TRAPPC3-207ENST00000497251 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC3-207ENST00000497251 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3-207ENST00000497251 UACAQ9BZF9 1416 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3-207ENST00000497251 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3-207ENST00000497251 DISP1Q96F81 1524 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAPPC3-207ENST00000497251 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3-207ENST00000497251 ASXL2Q76L83 1435 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC3-207ENST00000497251 KDM6BO15054 1643 aa28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3-207ENST00000497251 GLI2P10070 1586 aa28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC3-207ENST00000497251 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.82■■■□□ 2.2
TRAPPC3-207ENST00000497251 TSPOAP1O95153 1857 aa28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC3-207ENST00000497251 GOLGA3Q08378 1498 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIAA0556O60303 1618 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC3-207ENST00000497251 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC3-207ENST00000497251 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC3-207ENST00000497251 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRXQ9BXM0 1461 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC3-207ENST00000497251 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC3-207ENST00000497251 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.64■■■□□ 2.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCA8O94911 1581 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC3-207ENST00000497251 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 CD109Q6YHK3 1445 aa28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 KCNH8Q96L42 1107 aa28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 EEA1Q15075 1411 aa28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC3-207ENST00000497251 ADGRL1O94910 1474 aa28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3-207ENST00000497251 ATP10BO94823 1461 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 P3H3Q8IVL6 736 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 SAMD9Q5K651 1589 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARID3CA6NKF2 412 aa28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 NEO1Q92859 1461 aa28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3-207ENST00000497251 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC3-207ENST00000497251 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC3-207ENST00000497251 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC3-207ENST00000497251 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIF21BO75037 1637 aa28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC3-207ENST00000497251 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
TRAPPC3-207ENST00000497251 RAPGEF3O95398 923 aa27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3-207ENST00000497251 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC3-207ENST00000497251 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC3-207ENST00000497251 AKNAQ7Z591 1439 aa27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC3-207ENST00000497251 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.89■■■□□ 2.05
TRAPPC3-207ENST00000497251 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3-207ENST00000497251 FANCAO15360 1455 aa27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC3-207ENST00000497251 FMN1Q68DA7 1419 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC3-207ENST00000497251 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC3-207ENST00000497251 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3-207ENST00000497251 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC3-207ENST00000497251 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3-207ENST00000497251 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC3-207ENST00000497251 PTPRMP28827 1452 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 PLCH2O75038 1416 aa27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 RICTORQ6R327 1708 aa27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.76■■■□□ 2.04
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 HECW1Q76N89 1606 aa27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC3-207ENST00000497251 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 MADDQ8WXG6 1647 aa27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3-207ENST00000497251 CLIP1P30622 1438 aa27.64■■■□□ 2.02
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