RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496015.5

ABCD4-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,248 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-217ENST00000496015 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ABCD4-217ENST00000496015 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.43■■□□□ 1.34
ABCD4-217ENST00000496015 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.38■■□□□ 1.33
ABCD4-217ENST00000496015 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.37■■□□□ 1.33
ABCD4-217ENST00000496015 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
ABCD4-217ENST00000496015 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.2■■□□□ 1.3
ABCD4-217ENST00000496015 IQGAP2Q13576 1575 aa23.19■■□□□ 1.3
ABCD4-217ENST00000496015 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.18■■□□□ 1.3
ABCD4-217ENST00000496015 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.18■■□□□ 1.3
ABCD4-217ENST00000496015 PTPRGP23470 1445 aa23.13■■□□□ 1.29
ABCD4-217ENST00000496015 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.12■■□□□ 1.29
ABCD4-217ENST00000496015 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.1■■□□□ 1.29
ABCD4-217ENST00000496015 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
ABCD4-217ENST00000496015 MAPKBP1O60336 1514 aa23.07■■□□□ 1.28
ABCD4-217ENST00000496015 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.03■■□□□ 1.28
ABCD4-217ENST00000496015 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.03■■□□□ 1.28
ABCD4-217ENST00000496015 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.01■■□□□ 1.27
ABCD4-217ENST00000496015 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.01■■□□□ 1.27
ABCD4-217ENST00000496015 DISP1Q96F81 1524 aa23.01■■□□□ 1.27
ABCD4-217ENST00000496015 PRXQ9BXM0 1461 aa22.98■■□□□ 1.27
ABCD4-217ENST00000496015 DIP2BQ9P265 1576 aa22.96■■□□□ 1.27
ABCD4-217ENST00000496015 KIAA0556O60303 1618 aa22.95■■□□□ 1.26
ABCD4-217ENST00000496015 ABCC2Q92887 1545 aa22.95■■□□□ 1.26
ABCD4-217ENST00000496015 UACAQ9BZF9 1416 aa22.95■■□□□ 1.26
ABCD4-217ENST00000496015 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-217ENST00000496015 GOLGA3Q08378 1498 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-217ENST00000496015 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCD4-217ENST00000496015 EEA1Q15075 1411 aa22.89■■□□□ 1.25
ABCD4-217ENST00000496015 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.86■■□□□ 1.25
ABCD4-217ENST00000496015 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ABCD4-217ENST00000496015 ASXL2Q76L83 1435 aa22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-217ENST00000496015 TSPOAP1O95153 1857 aa22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-217ENST00000496015 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-217ENST00000496015 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-217ENST00000496015 GLI2P10070 1586 aa22.76■■□□□ 1.23
ABCD4-217ENST00000496015 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
ABCD4-217ENST00000496015 ABCA8O94911 1581 aa22.72■■□□□ 1.23
ABCD4-217ENST00000496015 KDM6BO15054 1643 aa22.72■■□□□ 1.23
ABCD4-217ENST00000496015 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ABCD4-217ENST00000496015 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ABCD4-217ENST00000496015 P3H3Q8IVL6 736 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-217ENST00000496015 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-217ENST00000496015 SAMD9Q5K651 1589 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-217ENST00000496015 KIF21BO75037 1637 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-217ENST00000496015 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.65■■□□□ 1.22
ABCD4-217ENST00000496015 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.64■■□□□ 1.22
ABCD4-217ENST00000496015 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.62■■□□□ 1.21
ABCD4-217ENST00000496015 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-217ENST00000496015 KCNH8Q96L42 1107 aa22.59■■□□□ 1.21
ABCD4-217ENST00000496015 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.56■■□□□ 1.2
ABCD4-217ENST00000496015 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.55■■□□□ 1.2
ABCD4-217ENST00000496015 ARID3CA6NKF2 412 aa22.54■■□□□ 1.2
ABCD4-217ENST00000496015 ATP10BO94823 1461 aa22.54■■□□□ 1.2
ABCD4-217ENST00000496015 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-217ENST00000496015 CD109Q6YHK3 1445 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-217ENST00000496015 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-217ENST00000496015 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-217ENST00000496015 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-217ENST00000496015 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-217ENST00000496015 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.48■■□□□ 1.19
ABCD4-217ENST00000496015 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.47■■□□□ 1.19
ABCD4-217ENST00000496015 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
ABCD4-217ENST00000496015 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ABCD4-217ENST00000496015 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.42■■□□□ 1.18
ABCD4-217ENST00000496015 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.39■■□□□ 1.18
ABCD4-217ENST00000496015 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.38■■□□□ 1.17
ABCD4-217ENST00000496015 FMN1Q68DA7 1419 aa22.34■■□□□ 1.17
ABCD4-217ENST00000496015 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.34■■□□□ 1.17
ABCD4-217ENST00000496015 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.31■■□□□ 1.16
ABCD4-217ENST00000496015 ADGRL1O94910 1474 aa22.29■■□□□ 1.16
ABCD4-217ENST00000496015 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.29■■□□□ 1.16
ABCD4-217ENST00000496015 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ABCD4-217ENST00000496015 NEO1Q92859 1461 aa22.27■■□□□ 1.16
ABCD4-217ENST00000496015 HECW1Q76N89 1606 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCD4-217ENST00000496015 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-217ENST00000496015 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-217ENST00000496015 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
ABCD4-217ENST00000496015 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.19■■□□□ 1.14
ABCD4-217ENST00000496015 RAPGEF3O95398 923 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCD4-217ENST00000496015 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.16■■□□□ 1.14
ABCD4-217ENST00000496015 FANCAO15360 1455 aa22.15■■□□□ 1.14
ABCD4-217ENST00000496015 AKNAQ7Z591 1439 aa22.13■■□□□ 1.13
ABCD4-217ENST00000496015 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-217ENST00000496015 CLIP1P30622 1438 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-217ENST00000496015 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-217ENST00000496015 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-217ENST00000496015 PLCH2O75038 1416 aa22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-217ENST00000496015 KIF14Q15058 1648 aa22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-217ENST00000496015 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.08■■□□□ 1.12
ABCD4-217ENST00000496015 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.08■■□□□ 1.12
ABCD4-217ENST00000496015 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.08■■□□□ 1.12
ABCD4-217ENST00000496015 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ABCD4-217ENST00000496015 RICTORQ6R327 1708 aa22.06■■□□□ 1.12
ABCD4-217ENST00000496015 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ABCD4-217ENST00000496015 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.05■■□□□ 1.12
ABCD4-217ENST00000496015 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.04■■□□□ 1.12
ABCD4-217ENST00000496015 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.03■■□□□ 1.12
ABCD4-217ENST00000496015 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ABCD4-217ENST00000496015 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.99■■□□□ 1.11
ABCD4-217ENST00000496015 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.9 ms