RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495904.1

VSTM2A-207, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 3

Gene VSTM2A, Length 865 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-207ENST00000495904 CEP170Q5SW79 1584 aa35.79■■■■□ 3.32
VSTM2A-207ENST00000495904 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.68■■■■□ 3.3
VSTM2A-207ENST00000495904 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.65■■■■□ 3.3
VSTM2A-207ENST00000495904 SHROOM2Q13796 1616 aa35.65■■■■□ 3.3
VSTM2A-207ENST00000495904 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.64■■■■□ 3.3
VSTM2A-207ENST00000495904 PRXQ9BXM0 1461 aa35.6■■■■□ 3.29
VSTM2A-207ENST00000495904 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.57■■■■□ 3.28
VSTM2A-207ENST00000495904 JPH4Q96JJ6 628 aa35.55■■■■□ 3.28
VSTM2A-207ENST00000495904 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
VSTM2A-207ENST00000495904 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
VSTM2A-207ENST00000495904 IQGAP2Q13576 1575 aa35.35■■■■□ 3.25
VSTM2A-207ENST00000495904 KIF21BO75037 1637 aa35.31■■■■□ 3.24
VSTM2A-207ENST00000495904 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.23■■■■□ 3.23
VSTM2A-207ENST00000495904 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.23■■■■□ 3.23
VSTM2A-207ENST00000495904 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.19■■■■□ 3.22
VSTM2A-207ENST00000495904 GOLGA3Q08378 1498 aa35.16■■■■□ 3.22
VSTM2A-207ENST00000495904 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.22
VSTM2A-207ENST00000495904 DISP1Q96F81 1524 aa35.06■■■■□ 3.2
VSTM2A-207ENST00000495904 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.06■■■■□ 3.2
VSTM2A-207ENST00000495904 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
VSTM2A-207ENST00000495904 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.01■■■■□ 3.19
VSTM2A-207ENST00000495904 PTPRGP23470 1445 aa35■■■■□ 3.19
VSTM2A-207ENST00000495904 KIAA0556O60303 1618 aa35■■■■□ 3.19
VSTM2A-207ENST00000495904 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.99■■■■□ 3.19
VSTM2A-207ENST00000495904 MAPKBP1O60336 1514 aa34.98■■■■□ 3.19
VSTM2A-207ENST00000495904 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.95■■■■□ 3.19
VSTM2A-207ENST00000495904 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.94■■■■□ 3.18
VSTM2A-207ENST00000495904 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.93■■■■□ 3.18
VSTM2A-207ENST00000495904 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
VSTM2A-207ENST00000495904 SAMD9Q5K651 1589 aa34.84■■■■□ 3.17
VSTM2A-207ENST00000495904 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.81■■■■□ 3.16
VSTM2A-207ENST00000495904 DIP2BQ9P265 1576 aa34.8■■■■□ 3.16
VSTM2A-207ENST00000495904 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
VSTM2A-207ENST00000495904 UACAQ9BZF9 1416 aa34.78■■■■□ 3.16
VSTM2A-207ENST00000495904 ABCC2Q92887 1545 aa34.76■■■■□ 3.16
VSTM2A-207ENST00000495904 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.75■■■■□ 3.15
VSTM2A-207ENST00000495904 P3H3Q8IVL6 736 aa34.74■■■■□ 3.15
VSTM2A-207ENST00000495904 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
VSTM2A-207ENST00000495904 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.64■■■■□ 3.14
VSTM2A-207ENST00000495904 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.64■■■■□ 3.14
VSTM2A-207ENST00000495904 ASXL2Q76L83 1435 aa34.62■■■■□ 3.13
VSTM2A-207ENST00000495904 ABCA8O94911 1581 aa34.61■■■■□ 3.13
VSTM2A-207ENST00000495904 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.59■■■■□ 3.13
VSTM2A-207ENST00000495904 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.57■■■■□ 3.12
VSTM2A-207ENST00000495904 TSPOAP1O95153 1857 aa34.54■■■■□ 3.12
VSTM2A-207ENST00000495904 CLIP1P30622 1438 aa34.52■■■■□ 3.12
VSTM2A-207ENST00000495904 FMN1Q68DA7 1419 aa34.52■■■■□ 3.12
VSTM2A-207ENST00000495904 GLI2P10070 1586 aa34.51■■■■□ 3.12
VSTM2A-207ENST00000495904 KDM6BO15054 1643 aa34.47■■■■□ 3.11
VSTM2A-207ENST00000495904 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.46■■■■□ 3.11
VSTM2A-207ENST00000495904 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.45■■■■□ 3.11
VSTM2A-207ENST00000495904 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
VSTM2A-207ENST00000495904 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
VSTM2A-207ENST00000495904 CEP162Q5TB80 1403 aa34.39■■■■□ 3.1
VSTM2A-207ENST00000495904 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
VSTM2A-207ENST00000495904 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
VSTM2A-207ENST00000495904 ATP10BO94823 1461 aa34.33■■■■□ 3.09
VSTM2A-207ENST00000495904 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.3■■■■□ 3.08
VSTM2A-207ENST00000495904 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.29■■■■□ 3.08
VSTM2A-207ENST00000495904 ARID3CA6NKF2 412 aa34.27■■■■□ 3.08
VSTM2A-207ENST00000495904 HECW1Q76N89 1606 aa34.26■■■■□ 3.08
VSTM2A-207ENST00000495904 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
VSTM2A-207ENST00000495904 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
VSTM2A-207ENST00000495904 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.24■■■■□ 3.07
VSTM2A-207ENST00000495904 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.22■■■■□ 3.07
VSTM2A-207ENST00000495904 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
VSTM2A-207ENST00000495904 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.16■■■■□ 3.06
VSTM2A-207ENST00000495904 KCNH8Q96L42 1107 aa34.16■■■■□ 3.06
VSTM2A-207ENST00000495904 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
VSTM2A-207ENST00000495904 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.13■■■■□ 3.05
VSTM2A-207ENST00000495904 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
VSTM2A-207ENST00000495904 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
VSTM2A-207ENST00000495904 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.11■■■■□ 3.05
VSTM2A-207ENST00000495904 CD109Q6YHK3 1445 aa34.11■■■■□ 3.05
VSTM2A-207ENST00000495904 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.09■■■■□ 3.05
VSTM2A-207ENST00000495904 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
VSTM2A-207ENST00000495904 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.08■■■■□ 3.05
VSTM2A-207ENST00000495904 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.07■■■■□ 3.04
VSTM2A-207ENST00000495904 VPS8Q8N3P4 1428 aa34■■■■□ 3.03
VSTM2A-207ENST00000495904 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
VSTM2A-207ENST00000495904 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.9■■■■□ 3.02
VSTM2A-207ENST00000495904 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.89■■■■□ 3.02
VSTM2A-207ENST00000495904 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.84■■■■□ 3.01
VSTM2A-207ENST00000495904 ADGRL1O94910 1474 aa33.82■■■■□ 3
VSTM2A-207ENST00000495904 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.81■■■■□ 3
VSTM2A-207ENST00000495904 KIF14Q15058 1648 aa33.8■■■■□ 3
VSTM2A-207ENST00000495904 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.79■■■■□ 3
VSTM2A-207ENST00000495904 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.76■■■■□ 3
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VSTM2A-207ENST00000495904 NEO1Q92859 1461 aa33.7■■■□□ 2.99
VSTM2A-207ENST00000495904 MAP3K1Q13233 1512 aa33.7■■■□□ 2.99
VSTM2A-207ENST00000495904 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.69■■■□□ 2.98
VSTM2A-207ENST00000495904 TIAM1Q13009 1591 aa33.68■■■□□ 2.98
VSTM2A-207ENST00000495904 APLP2Q06481 763 aa33.68■■■□□ 2.98
VSTM2A-207ENST00000495904 PLCH2O75038 1416 aa33.66■■■□□ 2.98
VSTM2A-207ENST00000495904 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.6■■■□□ 2.97
VSTM2A-207ENST00000495904 FANCAO15360 1455 aa33.6■■■□□ 2.97
VSTM2A-207ENST00000495904 RAPGEF3O95398 923 aa33.59■■■□□ 2.97
VSTM2A-207ENST00000495904 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.57■■■□□ 2.96
VSTM2A-207ENST00000495904 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.57■■■□□ 2.96
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