RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF27Q86VH2 1401 aa39.55■■■■□ 3.92
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TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.41■■■■□ 3.9
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.4■■■■□ 3.9
TRDMT1-211ENST00000495022 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.24■■■■□ 3.87
TRDMT1-211ENST00000495022 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.24■■■■□ 3.87
TRDMT1-211ENST00000495022 MAPKBP1O60336 1514 aa39.2■■■■□ 3.87
TRDMT1-211ENST00000495022 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.16■■■■□ 3.86
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.13■■■■□ 3.85
TRDMT1-211ENST00000495022 IQGAP2Q13576 1575 aa39.07■■■■□ 3.85
TRDMT1-211ENST00000495022 DIP2BQ9P265 1576 aa39.07■■■■□ 3.85
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.02■■■■□ 3.84
TRDMT1-211ENST00000495022 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.02■■■■□ 3.84
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPRGP23470 1445 aa39.01■■■■□ 3.84
TRDMT1-211ENST00000495022 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
TRDMT1-211ENST00000495022 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.96■■■■□ 3.83
TRDMT1-211ENST00000495022 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.92■■■■□ 3.82
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCC2Q92887 1545 aa38.85■■■■□ 3.81
TRDMT1-211ENST00000495022 DISP1Q96F81 1524 aa38.85■■■■□ 3.81
TRDMT1-211ENST00000495022 TSPOAP1O95153 1857 aa38.84■■■■□ 3.81
TRDMT1-211ENST00000495022 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.83■■■■□ 3.81
TRDMT1-211ENST00000495022 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.8■■■■□ 3.8
TRDMT1-211ENST00000495022 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
TRDMT1-211ENST00000495022 UACAQ9BZF9 1416 aa38.73■■■■□ 3.79
TRDMT1-211ENST00000495022 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.72■■■■□ 3.79
TRDMT1-211ENST00000495022 KDM6BO15054 1643 aa38.72■■■■□ 3.79
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA0556O60303 1618 aa38.71■■■■□ 3.79
TRDMT1-211ENST00000495022 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.7■■■■□ 3.79
TRDMT1-211ENST00000495022 ASXL2Q76L83 1435 aa38.69■■■■□ 3.78
TRDMT1-211ENST00000495022 GLI2P10070 1586 aa38.65■■■■□ 3.78
TRDMT1-211ENST00000495022 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.62■■■■□ 3.77
TRDMT1-211ENST00000495022 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
TRDMT1-211ENST00000495022 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
TRDMT1-211ENST00000495022 PRXQ9BXM0 1461 aa38.52■■■■□ 3.76
TRDMT1-211ENST00000495022 GOLGA3Q08378 1498 aa38.5■■■■□ 3.75
TRDMT1-211ENST00000495022 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.45■■■■□ 3.75
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCA8O94911 1581 aa38.35■■■■□ 3.73
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.34■■■■□ 3.73
TRDMT1-211ENST00000495022 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.31■■■■□ 3.72
TRDMT1-211ENST00000495022 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.23■■■■□ 3.71
TRDMT1-211ENST00000495022 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
TRDMT1-211ENST00000495022 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.19■■■■□ 3.7
TRDMT1-211ENST00000495022 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.17■■■■□ 3.7
TRDMT1-211ENST00000495022 SAMD9Q5K651 1589 aa38.11■■■■□ 3.69
TRDMT1-211ENST00000495022 EEA1Q15075 1411 aa38.1■■■■□ 3.69
TRDMT1-211ENST00000495022 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.1■■■■□ 3.69
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
TRDMT1-211ENST00000495022 CD109Q6YHK3 1445 aa38.07■■■■□ 3.68
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNH8Q96L42 1107 aa38.03■■■■□ 3.68
TRDMT1-211ENST00000495022 P3H3Q8IVL6 736 aa38.01■■■■□ 3.68
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP10BO94823 1461 aa37.99■■■■□ 3.67
TRDMT1-211ENST00000495022 ADGRL1O94910 1474 aa37.99■■■■□ 3.67
TRDMT1-211ENST00000495022 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.96■■■■□ 3.67
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.88■■■■□ 3.65
TRDMT1-211ENST00000495022 ARID3CA6NKF2 412 aa37.87■■■■□ 3.65
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF21BO75037 1637 aa37.83■■■■□ 3.65
TRDMT1-211ENST00000495022 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.8■■■■□ 3.64
TRDMT1-211ENST00000495022 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
TRDMT1-211ENST00000495022 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.76■■■■□ 3.63
TRDMT1-211ENST00000495022 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.73■■■■□ 3.63
TRDMT1-211ENST00000495022 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.73■■■■□ 3.63
TRDMT1-211ENST00000495022 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
TRDMT1-211ENST00000495022 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
TRDMT1-211ENST00000495022 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
TRDMT1-211ENST00000495022 NEO1Q92859 1461 aa37.65■■■■□ 3.62
TRDMT1-211ENST00000495022 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.53■■■■□ 3.6
TRDMT1-211ENST00000495022 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.49■■■■□ 3.59
TRDMT1-211ENST00000495022 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.49■■■■□ 3.59
TRDMT1-211ENST00000495022 RAPGEF3O95398 923 aa37.46■■■■□ 3.59
TRDMT1-211ENST00000495022 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.46■■■■□ 3.59
TRDMT1-211ENST00000495022 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.45■■■■□ 3.58
TRDMT1-211ENST00000495022 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.42■■■■□ 3.58
TRDMT1-211ENST00000495022 RICTORQ6R327 1708 aa37.41■■■■□ 3.58
TRDMT1-211ENST00000495022 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.4■■■■□ 3.58
TRDMT1-211ENST00000495022 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
TRDMT1-211ENST00000495022 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
TRDMT1-211ENST00000495022 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.39■■■■□ 3.58
TRDMT1-211ENST00000495022 FANCAO15360 1455 aa37.37■■■■□ 3.57
TRDMT1-211ENST00000495022 FMN1Q68DA7 1419 aa37.36■■■■□ 3.57
TRDMT1-211ENST00000495022 HECW1Q76N89 1606 aa37.35■■■■□ 3.57
TRDMT1-211ENST00000495022 AKNAQ7Z591 1439 aa37.34■■■■□ 3.57
TRDMT1-211ENST00000495022 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.33■■■■□ 3.57
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.32■■■■□ 3.57
TRDMT1-211ENST00000495022 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.32■■■■□ 3.56
TRDMT1-211ENST00000495022 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.29■■■■□ 3.56
TRDMT1-211ENST00000495022 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.24■■■■□ 3.55
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPRMP28827 1452 aa37.23■■■■□ 3.55
TRDMT1-211ENST00000495022 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.2■■■■□ 3.55
TRDMT1-211ENST00000495022 PLCH2O75038 1416 aa37.19■■■■□ 3.54
TRDMT1-211ENST00000495022 MADDQ8WXG6 1647 aa37.19■■■■□ 3.54
TRDMT1-211ENST00000495022 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
TRDMT1-211ENST00000495022 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.14■■■■□ 3.54
TRDMT1-211ENST00000495022 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.13■■■■□ 3.53
TRDMT1-211ENST00000495022 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.13■■■■□ 3.53
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF14Q15058 1648 aa37.12■■■■□ 3.53
TRDMT1-211ENST00000495022 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.08■■■■□ 3.53
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