RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494971.2

USP20-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 3

Gene USP20, Length 503 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-208ENST00000494971 JPH4Q96JJ6 628 aa29.1■■■□□ 2.25
USP20-208ENST00000494971 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.09■■■□□ 2.25
USP20-208ENST00000494971 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
USP20-208ENST00000494971 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.98■■■□□ 2.23
USP20-208ENST00000494971 IQGAP2Q13576 1575 aa28.88■■■□□ 2.21
USP20-208ENST00000494971 PRXQ9BXM0 1461 aa28.85■■■□□ 2.21
USP20-208ENST00000494971 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
USP20-208ENST00000494971 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.76■■■□□ 2.19
USP20-208ENST00000494971 EEA1Q15075 1411 aa28.75■■■□□ 2.19
USP20-208ENST00000494971 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.74■■■□□ 2.19
USP20-208ENST00000494971 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.72■■■□□ 2.19
USP20-208ENST00000494971 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.71■■■□□ 2.19
USP20-208ENST00000494971 DISP1Q96F81 1524 aa28.71■■■□□ 2.19
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USP20-208ENST00000494971 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.69■■■□□ 2.18
USP20-208ENST00000494971 PTPRGP23470 1445 aa28.68■■■□□ 2.18
USP20-208ENST00000494971 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.67■■■□□ 2.18
USP20-208ENST00000494971 KIAA0556O60303 1618 aa28.61■■■□□ 2.17
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USP20-208ENST00000494971 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.56■■■□□ 2.16
USP20-208ENST00000494971 GOLGA3Q08378 1498 aa28.53■■■□□ 2.16
USP20-208ENST00000494971 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.53■■■□□ 2.16
USP20-208ENST00000494971 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
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USP20-208ENST00000494971 ABCC2Q92887 1545 aa28.48■■■□□ 2.15
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USP20-208ENST00000494971 KIF21BO75037 1637 aa28.47■■■□□ 2.15
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USP20-208ENST00000494971 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.38■■■□□ 2.13
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USP20-208ENST00000494971 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.34■■■□□ 2.13
USP20-208ENST00000494971 ABCA8O94911 1581 aa28.33■■■□□ 2.12
USP20-208ENST00000494971 ASXL2Q76L83 1435 aa28.31■■■□□ 2.12
USP20-208ENST00000494971 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
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USP20-208ENST00000494971 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.18■■■□□ 2.1
USP20-208ENST00000494971 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
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USP20-208ENST00000494971 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
USP20-208ENST00000494971 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.14■■■□□ 2.1
USP20-208ENST00000494971 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.14■■■□□ 2.09
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USP20-208ENST00000494971 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.1■■■□□ 2.09
USP20-208ENST00000494971 TSPOAP1O95153 1857 aa28.1■■■□□ 2.09
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USP20-208ENST00000494971 KDM6BO15054 1643 aa27.96■■■□□ 2.07
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USP20-208ENST00000494971 FMN1Q68DA7 1419 aa27.92■■■□□ 2.06
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USP20-208ENST00000494971 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
USP20-208ENST00000494971 HECW1Q76N89 1606 aa27.8■■■□□ 2.04
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USP20-208ENST00000494971 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.66■■■□□ 2.02
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USP20-208ENST00000494971 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.65■■■□□ 2.02
USP20-208ENST00000494971 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.65■■■□□ 2.02
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USP20-208ENST00000494971 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.59■■■□□ 2.01
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USP20-208ENST00000494971 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.48■■□□□ 1.99
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USP20-208ENST00000494971 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.44■■□□□ 1.98
USP20-208ENST00000494971 RAPGEF3O95398 923 aa27.44■■□□□ 1.98
USP20-208ENST00000494971 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
USP20-208ENST00000494971 RICTORQ6R327 1708 aa27.39■■□□□ 1.98
USP20-208ENST00000494971 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.36■■□□□ 1.97
USP20-208ENST00000494971 ADGRL1O94910 1474 aa27.36■■□□□ 1.97
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USP20-208ENST00000494971 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.32■■□□□ 1.96
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