RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494800.1

HDAC4-211, Transcript of histone deacetylase 4, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC4, Length 451 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4-211ENST00000494800 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.84■■■□□ 2.37
HDAC4-211ENST00000494800 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
HDAC4-211ENST00000494800 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.81■■■□□ 2.36
HDAC4-211ENST00000494800 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.76■■■□□ 2.35
HDAC4-211ENST00000494800 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
HDAC4-211ENST00000494800 IQGAP2Q13576 1575 aa29.63■■■□□ 2.33
HDAC4-211ENST00000494800 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.59■■■□□ 2.33
HDAC4-211ENST00000494800 EEA1Q15075 1411 aa29.56■■■□□ 2.32
HDAC4-211ENST00000494800 PRXQ9BXM0 1461 aa29.55■■■□□ 2.32
HDAC4-211ENST00000494800 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.53■■■□□ 2.32
HDAC4-211ENST00000494800 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
HDAC4-211ENST00000494800 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.47■■■□□ 2.31
HDAC4-211ENST00000494800 PTPRGP23470 1445 aa29.46■■■□□ 2.31
HDAC4-211ENST00000494800 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.45■■■□□ 2.31
HDAC4-211ENST00000494800 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.45■■■□□ 2.3
HDAC4-211ENST00000494800 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.43■■■□□ 2.3
HDAC4-211ENST00000494800 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
HDAC4-211ENST00000494800 DISP1Q96F81 1524 aa29.4■■■□□ 2.3
HDAC4-211ENST00000494800 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
HDAC4-211ENST00000494800 GOLGA3Q08378 1498 aa29.35■■■□□ 2.29
HDAC4-211ENST00000494800 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.34■■■□□ 2.29
HDAC4-211ENST00000494800 KIAA0556O60303 1618 aa29.33■■■□□ 2.29
HDAC4-211ENST00000494800 MAPKBP1O60336 1514 aa29.25■■■□□ 2.27
HDAC4-211ENST00000494800 UACAQ9BZF9 1416 aa29.25■■■□□ 2.27
HDAC4-211ENST00000494800 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.23■■■□□ 2.27
HDAC4-211ENST00000494800 ABCC2Q92887 1545 aa29.21■■■□□ 2.27
HDAC4-211ENST00000494800 KIF21BO75037 1637 aa29.2■■■□□ 2.26
HDAC4-211ENST00000494800 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.15■■■□□ 2.26
HDAC4-211ENST00000494800 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.14■■■□□ 2.26
HDAC4-211ENST00000494800 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.08■■■□□ 2.25
HDAC4-211ENST00000494800 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.07■■■□□ 2.24
HDAC4-211ENST00000494800 P3H3Q8IVL6 736 aa29.07■■■□□ 2.24
HDAC4-211ENST00000494800 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.07■■■□□ 2.24
HDAC4-211ENST00000494800 DIP2BQ9P265 1576 aa29.06■■■□□ 2.24
HDAC4-211ENST00000494800 SAMD9Q5K651 1589 aa29.05■■■□□ 2.24
HDAC4-211ENST00000494800 ASXL2Q76L83 1435 aa29.04■■■□□ 2.24
HDAC4-211ENST00000494800 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
HDAC4-211ENST00000494800 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
HDAC4-211ENST00000494800 ABCA8O94911 1581 aa29.01■■■□□ 2.23
HDAC4-211ENST00000494800 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.99■■■□□ 2.23
HDAC4-211ENST00000494800 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
HDAC4-211ENST00000494800 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.94■■■□□ 2.22
HDAC4-211ENST00000494800 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.89■■■□□ 2.22
HDAC4-211ENST00000494800 GLI2P10070 1586 aa28.88■■■□□ 2.21
HDAC4-211ENST00000494800 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.88■■■□□ 2.21
HDAC4-211ENST00000494800 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
HDAC4-211ENST00000494800 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.83■■■□□ 2.21
HDAC4-211ENST00000494800 ARID3CA6NKF2 412 aa28.8■■■□□ 2.2
HDAC4-211ENST00000494800 TSPOAP1O95153 1857 aa28.78■■■□□ 2.2
HDAC4-211ENST00000494800 ATP10BO94823 1461 aa28.78■■■□□ 2.2
HDAC4-211ENST00000494800 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
HDAC4-211ENST00000494800 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
HDAC4-211ENST00000494800 KCNH8Q96L42 1107 aa28.75■■■□□ 2.19
HDAC4-211ENST00000494800 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.72■■■□□ 2.19
HDAC4-211ENST00000494800 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
HDAC4-211ENST00000494800 FMN1Q68DA7 1419 aa28.71■■■□□ 2.19
HDAC4-211ENST00000494800 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.71■■■□□ 2.19
HDAC4-211ENST00000494800 KDM6BO15054 1643 aa28.7■■■□□ 2.19
HDAC4-211ENST00000494800 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.7■■■□□ 2.18
HDAC4-211ENST00000494800 CD109Q6YHK3 1445 aa28.65■■■□□ 2.18
HDAC4-211ENST00000494800 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
HDAC4-211ENST00000494800 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.63■■■□□ 2.17
HDAC4-211ENST00000494800 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.61■■■□□ 2.17
HDAC4-211ENST00000494800 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
HDAC4-211ENST00000494800 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.58■■■□□ 2.17
HDAC4-211ENST00000494800 HECW1Q76N89 1606 aa28.56■■■□□ 2.16
HDAC4-211ENST00000494800 CLIP1P30622 1438 aa28.52■■■□□ 2.16
HDAC4-211ENST00000494800 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.51■■■□□ 2.15
HDAC4-211ENST00000494800 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
HDAC4-211ENST00000494800 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
HDAC4-211ENST00000494800 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.42■■■□□ 2.14
HDAC4-211ENST00000494800 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
HDAC4-211ENST00000494800 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.41■■■□□ 2.14
HDAC4-211ENST00000494800 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
HDAC4-211ENST00000494800 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.37■■■□□ 2.13
HDAC4-211ENST00000494800 NEO1Q92859 1461 aa28.36■■■□□ 2.13
HDAC4-211ENST00000494800 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
HDAC4-211ENST00000494800 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.34■■■□□ 2.13
HDAC4-211ENST00000494800 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
HDAC4-211ENST00000494800 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.33■■■□□ 2.13
HDAC4-211ENST00000494800 CEP162Q5TB80 1403 aa28.32■■■□□ 2.12
HDAC4-211ENST00000494800 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
HDAC4-211ENST00000494800 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.28■■■□□ 2.12
HDAC4-211ENST00000494800 KIF14Q15058 1648 aa28.27■■■□□ 2.12
HDAC4-211ENST00000494800 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.27■■■□□ 2.12
HDAC4-211ENST00000494800 FANCAO15360 1455 aa28.26■■■□□ 2.11
HDAC4-211ENST00000494800 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.24■■■□□ 2.11
HDAC4-211ENST00000494800 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.23■■■□□ 2.11
HDAC4-211ENST00000494800 PLCH2O75038 1416 aa28.22■■■□□ 2.11
HDAC4-211ENST00000494800 AKNAQ7Z591 1439 aa28.21■■■□□ 2.11
HDAC4-211ENST00000494800 RAPGEF3O95398 923 aa28.18■■■□□ 2.1
HDAC4-211ENST00000494800 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
HDAC4-211ENST00000494800 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.16■■■□□ 2.1
HDAC4-211ENST00000494800 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.15■■■□□ 2.1
HDAC4-211ENST00000494800 ADGRL1O94910 1474 aa28.1■■■□□ 2.09
HDAC4-211ENST00000494800 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.1■■■□□ 2.09
HDAC4-211ENST00000494800 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.09■■■□□ 2.09
HDAC4-211ENST00000494800 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.07■■■□□ 2.08
HDAC4-211ENST00000494800 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.06■■■□□ 2.08
HDAC4-211ENST00000494800 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.06■■■□□ 2.08
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