RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494559.5

PDZRN3-211, Transcript of PDZ domain containing ring finger 3, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3, Length 2,080 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-211ENST00000494559 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.48■■□□□ 1.35
PDZRN3-211ENST00000494559 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3-211ENST00000494559 TIAM1Q13009 1591 aa23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3-211ENST00000494559 PBRM1Q86U86 1689 aa23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3-211ENST00000494559 WDR62O43379 1518 aa23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3-211ENST00000494559 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3-211ENST00000494559 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3-211ENST00000494559 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3-211ENST00000494559 P3H3Q8IVL6 736 aa23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3-211ENST00000494559 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
PDZRN3-211ENST00000494559 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.39■■□□□ 1.33
PDZRN3-211ENST00000494559 IFT140Q96RY7 1462 aa23.38■■□□□ 1.33
PDZRN3-211ENST00000494559 SAMD9Q5K651 1589 aa23.37■■□□□ 1.33
PDZRN3-211ENST00000494559 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.36■■□□□ 1.33
PDZRN3-211ENST00000494559 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.35■■□□□ 1.33
PDZRN3-211ENST00000494559 ADAMTS12P58397 1594 aa23.35■■□□□ 1.33
PDZRN3-211ENST00000494559 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.34■■□□□ 1.33
PDZRN3-211ENST00000494559 GRIN2BQ13224 1484 aa23.33■■□□□ 1.33
PDZRN3-211ENST00000494559 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PDZRN3-211ENST00000494559 FMN1Q68DA7 1419 aa23.3■■□□□ 1.32
PDZRN3-211ENST00000494559 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.3■■□□□ 1.32
PDZRN3-211ENST00000494559 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PDZRN3-211ENST00000494559 ERCC6Q03468 1493 aa23.28■■□□□ 1.32
PDZRN3-211ENST00000494559 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.27■■□□□ 1.32
PDZRN3-211ENST00000494559 IQGAP2Q13576 1575 aa23.2■■□□□ 1.31
PDZRN3-211ENST00000494559 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3-211ENST00000494559 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PDZRN3-211ENST00000494559 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PDZRN3-211ENST00000494559 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.17■■□□□ 1.3
PDZRN3-211ENST00000494559 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3-211ENST00000494559 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3-211ENST00000494559 GRIN2AQ12879 1464 aa23.08■■□□□ 1.28
PDZRN3-211ENST00000494559 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.07■■□□□ 1.28
PDZRN3-211ENST00000494559 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.07■■□□□ 1.28
PDZRN3-211ENST00000494559 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PDZRN3-211ENST00000494559 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
PDZRN3-211ENST00000494559 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.02■■□□□ 1.28
PDZRN3-211ENST00000494559 ITGAEP38570 1179 aa23.02■■□□□ 1.28
PDZRN3-211ENST00000494559 HECW1Q76N89 1606 aa23■■□□□ 1.27
PDZRN3-211ENST00000494559 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23■■□□□ 1.27
PDZRN3-211ENST00000494559 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3-211ENST00000494559 SYNJ2O15056 1496 aa22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3-211ENST00000494559 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3-211ENST00000494559 DISP1Q96F81 1524 aa22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3-211ENST00000494559 KIAA0556O60303 1618 aa22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3-211ENST00000494559 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3-211ENST00000494559 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3-211ENST00000494559 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3-211ENST00000494559 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3-211ENST00000494559 NCOA2Q15596 1464 aa22.95■■□□□ 1.26
PDZRN3-211ENST00000494559 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3-211ENST00000494559 CEP170Q5SW79 1584 aa22.94■■□□□ 1.26
PDZRN3-211ENST00000494559 ARHGEF11O15085 1522 aa22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3-211ENST00000494559 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PDZRN3-211ENST00000494559 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PDZRN3-211ENST00000494559 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.9■■□□□ 1.26
PDZRN3-211ENST00000494559 NUP160Q12769 1436 aa22.88■■□□□ 1.25
PDZRN3-211ENST00000494559 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PDZRN3-211ENST00000494559 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PDZRN3-211ENST00000494559 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3-211ENST00000494559 MAPKBP1O60336 1514 aa22.82■■□□□ 1.24
PDZRN3-211ENST00000494559 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3-211ENST00000494559 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.81■■□□□ 1.24
PDZRN3-211ENST00000494559 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3-211ENST00000494559 FBLN2P98095 1184 aa22.8■■□□□ 1.24
PDZRN3-211ENST00000494559 PTPRKQ15262 1439 aa22.79■■□□□ 1.24
PDZRN3-211ENST00000494559 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3-211ENST00000494559 JPH4Q96JJ6 628 aa22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3-211ENST00000494559 HFM1A2PYH4 1435 aa22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3-211ENST00000494559 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.72■■□□□ 1.23
PDZRN3-211ENST00000494559 ARID3CA6NKF2 412 aa22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3-211ENST00000494559 MIA2Q96PC5 1412 aa22.71■■□□□ 1.23
PDZRN3-211ENST00000494559 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3-211ENST00000494559 NAIPQ13075 1403 aa22.66■■□□□ 1.22
PDZRN3-211ENST00000494559 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PDZRN3-211ENST00000494559 CHD1O14646 1710 aa22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3-211ENST00000494559 ABCA8O94911 1581 aa22.61■■□□□ 1.21
PDZRN3-211ENST00000494559 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PDZRN3-211ENST00000494559 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3-211ENST00000494559 UACAQ9BZF9 1416 aa22.59■■□□□ 1.21
PDZRN3-211ENST00000494559 AKNAQ7Z591 1439 aa22.58■■□□□ 1.21
PDZRN3-211ENST00000494559 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PDZRN3-211ENST00000494559 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.57■■□□□ 1.2
PDZRN3-211ENST00000494559 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.55■■□□□ 1.2
PDZRN3-211ENST00000494559 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 KIF14Q15058 1648 aa22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.51■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 SHROOM2Q13796 1616 aa22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 DAPK1P53355 1430 aa22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 ATP10BO94823 1461 aa22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 NEUROD1Q13562 356 aa22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 ABCC5O15440 1437 aa22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 KDM6BO15054 1643 aa22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 ROCK1Q13464 1354 aa22.46■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PDZRN3-211ENST00000494559 PTPRGP23470 1445 aa22.45■■□□□ 1.18
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