RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494188.1

RAB1A-205, Transcript of RAB1A, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB1A, Length 771 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1A-205ENST00000494188 EEA1Q15075 1411 aa38.41■■■■□ 3.74
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RAB1A-205ENST00000494188 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.36■■■■□ 3.73
RAB1A-205ENST00000494188 PRXQ9BXM0 1461 aa38.36■■■■□ 3.73
RAB1A-205ENST00000494188 JPH4Q96JJ6 628 aa38.35■■■■□ 3.73
RAB1A-205ENST00000494188 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.34■■■■□ 3.73
RAB1A-205ENST00000494188 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.72
RAB1A-205ENST00000494188 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
RAB1A-205ENST00000494188 IQGAP2Q13576 1575 aa38.24■■■■□ 3.71
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RAB1A-205ENST00000494188 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.03■■■■□ 3.68
RAB1A-205ENST00000494188 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.01■■■■□ 3.67
RAB1A-205ENST00000494188 DISP1Q96F81 1524 aa37.94■■■■□ 3.66
RAB1A-205ENST00000494188 KIAA0556O60303 1618 aa37.89■■■■□ 3.66
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RAB1A-205ENST00000494188 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
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RAB1A-205ENST00000494188 PTPRGP23470 1445 aa37.85■■■■□ 3.65
RAB1A-205ENST00000494188 GOLGA3Q08378 1498 aa37.83■■■■□ 3.65
RAB1A-205ENST00000494188 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.72■■■■□ 3.63
RAB1A-205ENST00000494188 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
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RAB1A-205ENST00000494188 P3H3Q8IVL6 736 aa37.62■■■■□ 3.61
RAB1A-205ENST00000494188 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
RAB1A-205ENST00000494188 UACAQ9BZF9 1416 aa37.61■■■■□ 3.61
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RAB1A-205ENST00000494188 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.5■■■■□ 3.59
RAB1A-205ENST00000494188 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.46■■■■□ 3.59
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RAB1A-205ENST00000494188 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.36■■■■□ 3.57
RAB1A-205ENST00000494188 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
RAB1A-205ENST00000494188 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.33■■■■□ 3.57
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RAB1A-205ENST00000494188 ASXL2Q76L83 1435 aa37.27■■■■□ 3.56
RAB1A-205ENST00000494188 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.26■■■■□ 3.56
RAB1A-205ENST00000494188 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.23■■■■□ 3.55
RAB1A-205ENST00000494188 DIP2BQ9P265 1576 aa37.23■■■■□ 3.55
RAB1A-205ENST00000494188 ARID3CA6NKF2 412 aa37.21■■■■□ 3.55
RAB1A-205ENST00000494188 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.2■■■■□ 3.55
RAB1A-205ENST00000494188 CLIP1P30622 1438 aa37.15■■■■□ 3.54
RAB1A-205ENST00000494188 FMN1Q68DA7 1419 aa37.15■■■■□ 3.54
RAB1A-205ENST00000494188 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.54
RAB1A-205ENST00000494188 ATP10BO94823 1461 aa37.12■■■■□ 3.53
RAB1A-205ENST00000494188 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.1■■■■□ 3.53
RAB1A-205ENST00000494188 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.08■■■■□ 3.53
RAB1A-205ENST00000494188 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
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RAB1A-205ENST00000494188 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.86■■■■□ 3.49
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RAB1A-205ENST00000494188 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.8■■■■□ 3.48
RAB1A-205ENST00000494188 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
RAB1A-205ENST00000494188 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.77■■■■□ 3.48
RAB1A-205ENST00000494188 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.76■■■■□ 3.47
RAB1A-205ENST00000494188 CD109Q6YHK3 1445 aa36.74■■■■□ 3.47
RAB1A-205ENST00000494188 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.74■■■■□ 3.47
RAB1A-205ENST00000494188 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.7■■■■□ 3.47
RAB1A-205ENST00000494188 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.7■■■■□ 3.47
RAB1A-205ENST00000494188 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
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RAB1A-205ENST00000494188 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.56■■■■□ 3.44
RAB1A-205ENST00000494188 KIF14Q15058 1648 aa36.55■■■■□ 3.44
RAB1A-205ENST00000494188 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.54■■■■□ 3.44
RAB1A-205ENST00000494188 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
RAB1A-205ENST00000494188 NEO1Q92859 1461 aa36.39■■■■□ 3.42
RAB1A-205ENST00000494188 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.37■■■■□ 3.41
RAB1A-205ENST00000494188 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.37■■■■□ 3.41
RAB1A-205ENST00000494188 FANCAO15360 1455 aa36.36■■■■□ 3.41
RAB1A-205ENST00000494188 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.35■■■■□ 3.41
RAB1A-205ENST00000494188 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.35■■■■□ 3.41
RAB1A-205ENST00000494188 PLCH2O75038 1416 aa36.34■■■■□ 3.41
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RAB1A-205ENST00000494188 TIAM1Q13009 1591 aa36.31■■■■□ 3.4
RAB1A-205ENST00000494188 AKNAQ7Z591 1439 aa36.27■■■■□ 3.4
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RAB1A-205ENST00000494188 PREX2Q70Z35 1606 aa36.22■■■■□ 3.39
RAB1A-205ENST00000494188 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.21■■■■□ 3.39
RAB1A-205ENST00000494188 MAP3K1Q13233 1512 aa36.18■■■■□ 3.38
RAB1A-205ENST00000494188 ADGRL1O94910 1474 aa36.18■■■■□ 3.38
RAB1A-205ENST00000494188 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.17■■■■□ 3.38
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