RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.93■■■■□ 3.82
SENP6-211ENST00000493959 CUL7Q14999 1698 aa38.9■■■■□ 3.82
SENP6-211ENST00000493959 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.89■■■■□ 3.82
SENP6-211ENST00000493959 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.81■■■■□ 3.8
SENP6-211ENST00000493959 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.57■■■■□ 3.76
SENP6-211ENST00000493959 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
SENP6-211ENST00000493959 IQGAP2Q13576 1575 aa38.46■■■■□ 3.75
SENP6-211ENST00000493959 PTPRGP23470 1445 aa38.43■■■■□ 3.74
SENP6-211ENST00000493959 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.41■■■■□ 3.74
SENP6-211ENST00000493959 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.39■■■■□ 3.74
SENP6-211ENST00000493959 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.39■■■■□ 3.74
SENP6-211ENST00000493959 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.36■■■■□ 3.73
SENP6-211ENST00000493959 DISP1Q96F81 1524 aa38.33■■■■□ 3.73
SENP6-211ENST00000493959 PRXQ9BXM0 1461 aa38.31■■■■□ 3.72
SENP6-211ENST00000493959 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.26■■■■□ 3.72
SENP6-211ENST00000493959 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.24■■■■□ 3.71
SENP6-211ENST00000493959 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.24■■■■□ 3.71
SENP6-211ENST00000493959 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.23■■■■□ 3.71
SENP6-211ENST00000493959 MAPKBP1O60336 1514 aa38.18■■■■□ 3.7
SENP6-211ENST00000493959 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.16■■■■□ 3.7
SENP6-211ENST00000493959 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.13■■■■□ 3.69
SENP6-211ENST00000493959 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
SENP6-211ENST00000493959 UACAQ9BZF9 1416 aa38.11■■■■□ 3.69
SENP6-211ENST00000493959 KIAA0556O60303 1618 aa38.1■■■■□ 3.69
SENP6-211ENST00000493959 ABCC2Q92887 1545 aa38.07■■■■□ 3.69
SENP6-211ENST00000493959 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.05■■■■□ 3.68
SENP6-211ENST00000493959 DIP2BQ9P265 1576 aa38.04■■■■□ 3.68
SENP6-211ENST00000493959 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.02■■■■□ 3.68
SENP6-211ENST00000493959 EEA1Q15075 1411 aa37.96■■■■□ 3.67
SENP6-211ENST00000493959 GOLGA3Q08378 1498 aa37.96■■■■□ 3.67
SENP6-211ENST00000493959 P3H3Q8IVL6 736 aa37.95■■■■□ 3.67
SENP6-211ENST00000493959 ASXL2Q76L83 1435 aa37.95■■■■□ 3.67
SENP6-211ENST00000493959 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.91■■■■□ 3.66
SENP6-211ENST00000493959 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.89■■■■□ 3.66
SENP6-211ENST00000493959 TSPOAP1O95153 1857 aa37.86■■■■□ 3.65
SENP6-211ENST00000493959 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
SENP6-211ENST00000493959 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
SENP6-211ENST00000493959 ABCA8O94911 1581 aa37.76■■■■□ 3.64
SENP6-211ENST00000493959 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.75■■■■□ 3.63
SENP6-211ENST00000493959 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
SENP6-211ENST00000493959 ARID3CA6NKF2 412 aa37.7■■■■□ 3.63
SENP6-211ENST00000493959 GLI2P10070 1586 aa37.7■■■■□ 3.63
SENP6-211ENST00000493959 SAMD9Q5K651 1589 aa37.65■■■■□ 3.62
SENP6-211ENST00000493959 KIF21BO75037 1637 aa37.64■■■■□ 3.62
SENP6-211ENST00000493959 KCNH8Q96L42 1107 aa37.63■■■■□ 3.61
SENP6-211ENST00000493959 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.6■■■■□ 3.61
SENP6-211ENST00000493959 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
SENP6-211ENST00000493959 KDM6BO15054 1643 aa37.58■■■■□ 3.61
SENP6-211ENST00000493959 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
SENP6-211ENST00000493959 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.54■■■■□ 3.6
SENP6-211ENST00000493959 ATP10BO94823 1461 aa37.54■■■■□ 3.6
SENP6-211ENST00000493959 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.51■■■■□ 3.6
SENP6-211ENST00000493959 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
SENP6-211ENST00000493959 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
SENP6-211ENST00000493959 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.43■■■■□ 3.58
SENP6-211ENST00000493959 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
SENP6-211ENST00000493959 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
SENP6-211ENST00000493959 CD109Q6YHK3 1445 aa37.39■■■■□ 3.58
SENP6-211ENST00000493959 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
SENP6-211ENST00000493959 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.35■■■■□ 3.57
SENP6-211ENST00000493959 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.33■■■■□ 3.57
SENP6-211ENST00000493959 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.28■■■■□ 3.56
SENP6-211ENST00000493959 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.27■■■■□ 3.56
SENP6-211ENST00000493959 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.21■■■■□ 3.55
SENP6-211ENST00000493959 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.2■■■■□ 3.55
SENP6-211ENST00000493959 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.18■■■■□ 3.54
SENP6-211ENST00000493959 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
SENP6-211ENST00000493959 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.12■■■■□ 3.53
SENP6-211ENST00000493959 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
SENP6-211ENST00000493959 FMN1Q68DA7 1419 aa37.05■■■■□ 3.52
SENP6-211ENST00000493959 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.98■■■■□ 3.51
SENP6-211ENST00000493959 RAPGEF3O95398 923 aa36.95■■■■□ 3.51
SENP6-211ENST00000493959 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.91■■■■□ 3.5
SENP6-211ENST00000493959 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.9■■■■□ 3.53e-9■□□□□ 10.5
SENP6-211ENST00000493959 HECW1Q76N89 1606 aa36.88■■■■□ 3.5
SENP6-211ENST00000493959 NEO1Q92859 1461 aa36.88■■■■□ 3.5
SENP6-211ENST00000493959 ADGRL1O94910 1474 aa36.88■■■■□ 3.49
SENP6-211ENST00000493959 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.83■■■■□ 3.49
SENP6-211ENST00000493959 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
SENP6-211ENST00000493959 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.79■■■■□ 3.48
SENP6-211ENST00000493959 CLIP1P30622 1438 aa36.78■■■■□ 3.48
SENP6-211ENST00000493959 AKNAQ7Z591 1439 aa36.77■■■■□ 3.48
SENP6-211ENST00000493959 FANCAO15360 1455 aa36.76■■■■□ 3.48
SENP6-211ENST00000493959 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.75■■■■□ 3.47
SENP6-211ENST00000493959 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
SENP6-211ENST00000493959 PLCH2O75038 1416 aa36.7■■■■□ 3.47
SENP6-211ENST00000493959 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
SENP6-211ENST00000493959 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.7■■■■□ 3.46
SENP6-211ENST00000493959 KIF14Q15058 1648 aa36.69■■■■□ 3.46
SENP6-211ENST00000493959 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
SENP6-211ENST00000493959 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.61■■■■□ 3.45
SENP6-211ENST00000493959 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.6■■■■□ 3.45
SENP6-211ENST00000493959 RICTORQ6R327 1708 aa36.59■■■■□ 3.45
SENP6-211ENST00000493959 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.59■■■■□ 3.45
SENP6-211ENST00000493959 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.58■■■■□ 3.45
SENP6-211ENST00000493959 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.57■■■■□ 3.45
SENP6-211ENST00000493959 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.56■■■■□ 3.44
SENP6-211ENST00000493959 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.54■■■■□ 3.44
SENP6-211ENST00000493959 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
SENP6-211ENST00000493959 CEP162Q5TB80 1403 aa36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms