RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493321.1

DNAJA4-211, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene DNAJA4, Length 1,134 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4-211ENST00000493321 SHROOM2Q13796 1616 aa24.81■■□□□ 1.56
DNAJA4-211ENST00000493321 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
DNAJA4-211ENST00000493321 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.76■■□□□ 1.55
DNAJA4-211ENST00000493321 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.76■■□□□ 1.55
DNAJA4-211ENST00000493321 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.66■■□□□ 1.54
DNAJA4-211ENST00000493321 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.65■■□□□ 1.54
DNAJA4-211ENST00000493321 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
DNAJA4-211ENST00000493321 PRXQ9BXM0 1461 aa24.61■■□□□ 1.53
DNAJA4-211ENST00000493321 EEA1Q15075 1411 aa24.6■■□□□ 1.53
DNAJA4-211ENST00000493321 IQGAP2Q13576 1575 aa24.59■■□□□ 1.53
DNAJA4-211ENST00000493321 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.58■■□□□ 1.53
DNAJA4-211ENST00000493321 PTPRGP23470 1445 aa24.52■■□□□ 1.52
DNAJA4-211ENST00000493321 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
DNAJA4-211ENST00000493321 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.51■■□□□ 1.51
DNAJA4-211ENST00000493321 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
DNAJA4-211ENST00000493321 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.47■■□□□ 1.51
DNAJA4-211ENST00000493321 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
DNAJA4-211ENST00000493321 DISP1Q96F81 1524 aa24.44■■□□□ 1.5
DNAJA4-211ENST00000493321 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.4■■□□□ 1.5
DNAJA4-211ENST00000493321 GOLGA3Q08378 1498 aa24.37■■□□□ 1.49
DNAJA4-211ENST00000493321 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.35■■□□□ 1.49
DNAJA4-211ENST00000493321 KIAA0556O60303 1618 aa24.33■■□□□ 1.49
DNAJA4-211ENST00000493321 UACAQ9BZF9 1416 aa24.32■■□□□ 1.48
DNAJA4-211ENST00000493321 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.28■■□□□ 1.48
DNAJA4-211ENST00000493321 MAPKBP1O60336 1514 aa24.26■■□□□ 1.47
DNAJA4-211ENST00000493321 KIF21BO75037 1637 aa24.26■■□□□ 1.47
DNAJA4-211ENST00000493321 ABCC2Q92887 1545 aa24.25■■□□□ 1.47
DNAJA4-211ENST00000493321 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.24■■□□□ 1.47
DNAJA4-211ENST00000493321 P3H3Q8IVL6 736 aa24.24■■□□□ 1.47
DNAJA4-211ENST00000493321 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
DNAJA4-211ENST00000493321 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.2■■□□□ 1.47
DNAJA4-211ENST00000493321 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
DNAJA4-211ENST00000493321 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.18■■□□□ 1.46
DNAJA4-211ENST00000493321 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.16■■□□□ 1.46
DNAJA4-211ENST00000493321 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.15■■□□□ 1.46
DNAJA4-211ENST00000493321 ASXL2Q76L83 1435 aa24.12■■□□□ 1.45
DNAJA4-211ENST00000493321 SAMD9Q5K651 1589 aa24.12■■□□□ 1.45
DNAJA4-211ENST00000493321 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.11■■□□□ 1.45
DNAJA4-211ENST00000493321 ABCA8O94911 1581 aa24.09■■□□□ 1.45
DNAJA4-211ENST00000493321 DIP2BQ9P265 1576 aa24.08■■□□□ 1.44
DNAJA4-211ENST00000493321 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
DNAJA4-211ENST00000493321 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.02■■□□□ 1.44
DNAJA4-211ENST00000493321 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.02■■□□□ 1.44
DNAJA4-211ENST00000493321 ARID3CA6NKF2 412 aa23.98■■□□□ 1.43
DNAJA4-211ENST00000493321 GLI2P10070 1586 aa23.98■■□□□ 1.43
DNAJA4-211ENST00000493321 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
DNAJA4-211ENST00000493321 ATP10BO94823 1461 aa23.96■■□□□ 1.43
DNAJA4-211ENST00000493321 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.96■■□□□ 1.43
DNAJA4-211ENST00000493321 KCNH8Q96L42 1107 aa23.96■■□□□ 1.43
DNAJA4-211ENST00000493321 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
DNAJA4-211ENST00000493321 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
DNAJA4-211ENST00000493321 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.94■■□□□ 1.42
DNAJA4-211ENST00000493321 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.89■■□□□ 1.42
DNAJA4-211ENST00000493321 TSPOAP1O95153 1857 aa23.89■■□□□ 1.41
DNAJA4-211ENST00000493321 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
DNAJA4-211ENST00000493321 FMN1Q68DA7 1419 aa23.87■■□□□ 1.41
DNAJA4-211ENST00000493321 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.84■■□□□ 1.41
DNAJA4-211ENST00000493321 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
DNAJA4-211ENST00000493321 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.81■■□□□ 1.4
DNAJA4-211ENST00000493321 CD109Q6YHK3 1445 aa23.81■■□□□ 1.4
DNAJA4-211ENST00000493321 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.8■■□□□ 1.4
DNAJA4-211ENST00000493321 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
DNAJA4-211ENST00000493321 KDM6BO15054 1643 aa23.75■■□□□ 1.39
DNAJA4-211ENST00000493321 CLIP1P30622 1438 aa23.74■■□□□ 1.39
DNAJA4-211ENST00000493321 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.74■■□□□ 1.39
DNAJA4-211ENST00000493321 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.73■■□□□ 1.39
DNAJA4-211ENST00000493321 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
DNAJA4-211ENST00000493321 HECW1Q76N89 1606 aa23.68■■□□□ 1.38
DNAJA4-211ENST00000493321 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
DNAJA4-211ENST00000493321 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.66■■□□□ 1.38
DNAJA4-211ENST00000493321 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.66■■□□□ 1.38
DNAJA4-211ENST00000493321 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.65■■□□□ 1.38
DNAJA4-211ENST00000493321 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
DNAJA4-211ENST00000493321 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.64■■□□□ 1.37
DNAJA4-211ENST00000493321 CEP162Q5TB80 1403 aa23.58■■□□□ 1.36
DNAJA4-211ENST00000493321 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.56■■□□□ 1.36
DNAJA4-211ENST00000493321 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
DNAJA4-211ENST00000493321 NEO1Q92859 1461 aa23.55■■□□□ 1.36
DNAJA4-211ENST00000493321 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.55■■□□□ 1.36
DNAJA4-211ENST00000493321 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.54■■□□□ 1.36
DNAJA4-211ENST00000493321 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
DNAJA4-211ENST00000493321 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
DNAJA4-211ENST00000493321 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
DNAJA4-211ENST00000493321 PLCH2O75038 1416 aa23.48■■□□□ 1.35
DNAJA4-211ENST00000493321 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.47■■□□□ 1.35
DNAJA4-211ENST00000493321 FANCAO15360 1455 aa23.46■■□□□ 1.35
DNAJA4-211ENST00000493321 RAPGEF3O95398 923 aa23.46■■□□□ 1.35
DNAJA4-211ENST00000493321 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.46■■□□□ 1.35
DNAJA4-211ENST00000493321 AKNAQ7Z591 1439 aa23.46■■□□□ 1.35
DNAJA4-211ENST00000493321 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.45■■□□□ 1.34
DNAJA4-211ENST00000493321 KIF14Q15058 1648 aa23.43■■□□□ 1.34
DNAJA4-211ENST00000493321 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.4■■□□□ 1.34
DNAJA4-211ENST00000493321 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
DNAJA4-211ENST00000493321 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.38■■□□□ 1.33
DNAJA4-211ENST00000493321 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.34■■□□□ 1.33
DNAJA4-211ENST00000493321 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.34■■□□□ 1.33
DNAJA4-211ENST00000493321 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.33■■□□□ 1.33
DNAJA4-211ENST00000493321 ADGRL1O94910 1474 aa23.33■■□□□ 1.33
DNAJA4-211ENST00000493321 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.31■■□□□ 1.32
DNAJA4-211ENST00000493321 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7 ms