RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493234.1

TNNT3-214, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

TSL 2

Gene TNNT3, Length 1,113 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-214ENST00000493234 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
TNNT3-214ENST00000493234 EEA1Q15075 1411 aa29.79■■■□□ 2.36
TNNT3-214ENST00000493234 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.78■■■□□ 2.36
TNNT3-214ENST00000493234 JPH4Q96JJ6 628 aa29.78■■■□□ 2.36
TNNT3-214ENST00000493234 ARAP1Q96P48 1450 aa29.78■■■□□ 2.36
TNNT3-214ENST00000493234 PRXQ9BXM0 1461 aa29.78■■■□□ 2.36
TNNT3-214ENST00000493234 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.76■■■□□ 2.35
TNNT3-214ENST00000493234 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.76■■■□□ 2.35
TNNT3-214ENST00000493234 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
TNNT3-214ENST00000493234 IQGAP2Q13576 1575 aa29.63■■■□□ 2.33
TNNT3-214ENST00000493234 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.56■■■□□ 2.32
TNNT3-214ENST00000493234 KIF21BO75037 1637 aa29.49■■■□□ 2.31
TNNT3-214ENST00000493234 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.47■■■□□ 2.31
TNNT3-214ENST00000493234 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.45■■■□□ 2.3
TNNT3-214ENST00000493234 DISP1Q96F81 1524 aa29.44■■■□□ 2.3
TNNT3-214ENST00000493234 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.43■■■□□ 2.3
TNNT3-214ENST00000493234 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
TNNT3-214ENST00000493234 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.37■■■□□ 2.29
TNNT3-214ENST00000493234 KIAA0556O60303 1618 aa29.35■■■□□ 2.29
TNNT3-214ENST00000493234 PTPRGP23470 1445 aa29.35■■■□□ 2.29
TNNT3-214ENST00000493234 GOLGA3Q08378 1498 aa29.33■■■□□ 2.29
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TNNT3-214ENST00000493234 P3H3Q8IVL6 736 aa29.23■■■□□ 2.27
TNNT3-214ENST00000493234 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.23■■■□□ 2.27
TNNT3-214ENST00000493234 SAMD9Q5K651 1589 aa29.18■■■□□ 2.26
TNNT3-214ENST00000493234 UACAQ9BZF9 1416 aa29.15■■■□□ 2.26
TNNT3-214ENST00000493234 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.12■■■□□ 2.25
TNNT3-214ENST00000493234 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
TNNT3-214ENST00000493234 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.1■■■□□ 2.25
TNNT3-214ENST00000493234 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.08■■■□□ 2.25
TNNT3-214ENST00000493234 ABCC2Q92887 1545 aa29.08■■■□□ 2.25
TNNT3-214ENST00000493234 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.06■■■□□ 2.24
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TNNT3-214ENST00000493234 ABCA8O94911 1581 aa29.03■■■□□ 2.24
TNNT3-214ENST00000493234 MAPKBP1O60336 1514 aa28.99■■■□□ 2.23
TNNT3-214ENST00000493234 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.97■■■□□ 2.23
TNNT3-214ENST00000493234 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.97■■■□□ 2.23
TNNT3-214ENST00000493234 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
TNNT3-214ENST00000493234 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.92■■■□□ 2.22
TNNT3-214ENST00000493234 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.9■■■□□ 2.22
TNNT3-214ENST00000493234 ASXL2Q76L83 1435 aa28.88■■■□□ 2.21
TNNT3-214ENST00000493234 ARID3CA6NKF2 412 aa28.88■■■□□ 2.21
TNNT3-214ENST00000493234 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.87■■■□□ 2.21
TNNT3-214ENST00000493234 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.86■■■□□ 2.21
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TNNT3-214ENST00000493234 CLIP1P30622 1438 aa28.83■■■□□ 2.21
TNNT3-214ENST00000493234 ATP10BO94823 1461 aa28.82■■■□□ 2.2
TNNT3-214ENST00000493234 DIP2BQ9P265 1576 aa28.82■■■□□ 2.2
TNNT3-214ENST00000493234 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
TNNT3-214ENST00000493234 FMN1Q68DA7 1419 aa28.78■■■□□ 2.2
TNNT3-214ENST00000493234 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.73■■■□□ 2.19
TNNT3-214ENST00000493234 CEP162Q5TB80 1403 aa28.72■■■□□ 2.19
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TNNT3-214ENST00000493234 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
TNNT3-214ENST00000493234 KCNH8Q96L42 1107 aa28.68■■■□□ 2.18
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TNNT3-214ENST00000493234 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
TNNT3-214ENST00000493234 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.6■■■□□ 2.17
TNNT3-214ENST00000493234 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.57■■■□□ 2.16
TNNT3-214ENST00000493234 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.57■■■□□ 2.16
TNNT3-214ENST00000493234 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.55■■■□□ 2.16
TNNT3-214ENST00000493234 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
TNNT3-214ENST00000493234 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.51■■■□□ 2.15
TNNT3-214ENST00000493234 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.48■■■□□ 2.15
TNNT3-214ENST00000493234 CD109Q6YHK3 1445 aa28.48■■■□□ 2.15
TNNT3-214ENST00000493234 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.45■■■□□ 2.14
TNNT3-214ENST00000493234 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.44■■■□□ 2.14
TNNT3-214ENST00000493234 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
TNNT3-214ENST00000493234 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.39■■■□□ 2.14
TNNT3-214ENST00000493234 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.38■■■□□ 2.13
TNNT3-214ENST00000493234 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
TNNT3-214ENST00000493234 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
TNNT3-214ENST00000493234 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.35■■■□□ 2.13
TNNT3-214ENST00000493234 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.33■■■□□ 2.12
TNNT3-214ENST00000493234 KDM6BO15054 1643 aa28.32■■■□□ 2.12
TNNT3-214ENST00000493234 KIF14Q15058 1648 aa28.32■■■□□ 2.12
TNNT3-214ENST00000493234 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
TNNT3-214ENST00000493234 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.2■■■□□ 2.1
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TNNT3-214ENST00000493234 NEO1Q92859 1461 aa28.19■■■□□ 2.1
TNNT3-214ENST00000493234 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.18■■■□□ 2.1
TNNT3-214ENST00000493234 TIAM1Q13009 1591 aa28.16■■■□□ 2.1
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TNNT3-214ENST00000493234 AKNAQ7Z591 1439 aa28.13■■■□□ 2.09
TNNT3-214ENST00000493234 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.13■■■□□ 2.09
TNNT3-214ENST00000493234 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.11■■■□□ 2.09
TNNT3-214ENST00000493234 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.1■■■□□ 2.09
TNNT3-214ENST00000493234 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.09■■■□□ 2.09
TNNT3-214ENST00000493234 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.08■■■□□ 2.09
TNNT3-214ENST00000493234 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.08■■■□□ 2.08
TNNT3-214ENST00000493234 MAP3K1Q13233 1512 aa28.08■■■□□ 2.08
TNNT3-214ENST00000493234 RAPGEF3O95398 923 aa28.07■■■□□ 2.08
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