RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492979.2

SSC4D-202, Transcript of scavenger receptor cysteine rich family member with 4 domains, humanhuman

TSL 5

Gene SSC4D, Length 1,224 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4D-202ENST00000492979 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.36■■■□□ 2.77
SSC4D-202ENST00000492979 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.36■■■□□ 2.77
SSC4D-202ENST00000492979 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
SSC4D-202ENST00000492979 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.16■■■□□ 2.74
SSC4D-202ENST00000492979 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
SSC4D-202ENST00000492979 IQGAP2Q13576 1575 aa32.02■■■□□ 2.72
SSC4D-202ENST00000492979 PRXQ9BXM0 1461 aa32.01■■■□□ 2.71
SSC4D-202ENST00000492979 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32■■■□□ 2.71
SSC4D-202ENST00000492979 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.94■■■□□ 2.7
SSC4D-202ENST00000492979 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.94■■■□□ 2.7
SSC4D-202ENST00000492979 PTPRGP23470 1445 aa31.92■■■□□ 2.7
SSC4D-202ENST00000492979 EEA1Q15075 1411 aa31.89■■■□□ 2.7
SSC4D-202ENST00000492979 DISP1Q96F81 1524 aa31.88■■■□□ 2.69
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SSC4D-202ENST00000492979 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.85■■■□□ 2.69
SSC4D-202ENST00000492979 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.85■■■□□ 2.69
SSC4D-202ENST00000492979 MAPKBP1O60336 1514 aa31.85■■■□□ 2.69
SSC4D-202ENST00000492979 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.78■■■□□ 2.68
SSC4D-202ENST00000492979 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.75■■■□□ 2.67
SSC4D-202ENST00000492979 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.73■■■□□ 2.67
SSC4D-202ENST00000492979 GOLGA3Q08378 1498 aa31.72■■■□□ 2.67
SSC4D-202ENST00000492979 KIAA0556O60303 1618 aa31.71■■■□□ 2.67
SSC4D-202ENST00000492979 UACAQ9BZF9 1416 aa31.71■■■□□ 2.67
SSC4D-202ENST00000492979 ABCC2Q92887 1545 aa31.7■■■□□ 2.67
SSC4D-202ENST00000492979 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.66■■■□□ 2.66
SSC4D-202ENST00000492979 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.65■■■□□ 2.66
SSC4D-202ENST00000492979 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.6■■■□□ 2.65
SSC4D-202ENST00000492979 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.58■■■□□ 2.65
SSC4D-202ENST00000492979 DIP2BQ9P265 1576 aa31.58■■■□□ 2.65
SSC4D-202ENST00000492979 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.56■■■□□ 2.64
SSC4D-202ENST00000492979 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.64
SSC4D-202ENST00000492979 ASXL2Q76L83 1435 aa31.49■■■□□ 2.63
SSC4D-202ENST00000492979 KIF21BO75037 1637 aa31.48■■■□□ 2.63
SSC4D-202ENST00000492979 ABCA8O94911 1581 aa31.46■■■□□ 2.63
SSC4D-202ENST00000492979 GLI2P10070 1586 aa31.45■■■□□ 2.63
SSC4D-202ENST00000492979 SAMD9Q5K651 1589 aa31.43■■■□□ 2.62
SSC4D-202ENST00000492979 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
SSC4D-202ENST00000492979 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
SSC4D-202ENST00000492979 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
SSC4D-202ENST00000492979 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.28■■■□□ 2.6
SSC4D-202ENST00000492979 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.24■■■□□ 2.59
SSC4D-202ENST00000492979 P3H3Q8IVL6 736 aa31.24■■■□□ 2.59
SSC4D-202ENST00000492979 ATP10BO94823 1461 aa31.21■■■□□ 2.59
SSC4D-202ENST00000492979 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.2■■■□□ 2.58
SSC4D-202ENST00000492979 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
SSC4D-202ENST00000492979 TSPOAP1O95153 1857 aa31.15■■■□□ 2.58
SSC4D-202ENST00000492979 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.14■■■□□ 2.58
SSC4D-202ENST00000492979 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.13■■■□□ 2.57
SSC4D-202ENST00000492979 KDM6BO15054 1643 aa31.13■■■□□ 2.57
SSC4D-202ENST00000492979 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
SSC4D-202ENST00000492979 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.12■■■□□ 2.57
SSC4D-202ENST00000492979 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.08■■■□□ 2.57
SSC4D-202ENST00000492979 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
SSC4D-202ENST00000492979 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.06■■■□□ 2.56
SSC4D-202ENST00000492979 CD109Q6YHK3 1445 aa31.05■■■□□ 2.56
SSC4D-202ENST00000492979 KCNH8Q96L42 1107 aa31.02■■■□□ 2.56
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SSC4D-202ENST00000492979 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.99■■■□□ 2.55
SSC4D-202ENST00000492979 FMN1Q68DA7 1419 aa30.98■■■□□ 2.55
SSC4D-202ENST00000492979 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
SSC4D-202ENST00000492979 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.94■■■□□ 2.54
SSC4D-202ENST00000492979 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.93■■■□□ 2.54
SSC4D-202ENST00000492979 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.9■■■□□ 2.54
SSC4D-202ENST00000492979 ARID3CA6NKF2 412 aa30.9■■■□□ 2.54
SSC4D-202ENST00000492979 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
SSC4D-202ENST00000492979 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
SSC4D-202ENST00000492979 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.84■■■□□ 2.53
SSC4D-202ENST00000492979 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.82■■■□□ 2.52
SSC4D-202ENST00000492979 NEO1Q92859 1461 aa30.79■■■□□ 2.52
SSC4D-202ENST00000492979 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
SSC4D-202ENST00000492979 HECW1Q76N89 1606 aa30.76■■■□□ 2.52
SSC4D-202ENST00000492979 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
SSC4D-202ENST00000492979 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
SSC4D-202ENST00000492979 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.5
SSC4D-202ENST00000492979 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.68■■■□□ 2.5
SSC4D-202ENST00000492979 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.68■■■□□ 2.5
SSC4D-202ENST00000492979 CLIP1P30622 1438 aa30.64■■■□□ 2.5
SSC4D-202ENST00000492979 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
SSC4D-202ENST00000492979 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.59■■■□□ 2.49
SSC4D-202ENST00000492979 PLCH2O75038 1416 aa30.59■■■□□ 2.49
SSC4D-202ENST00000492979 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
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SSC4D-202ENST00000492979 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.56■■■□□ 2.48
SSC4D-202ENST00000492979 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.56■■■□□ 2.48
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SSC4D-202ENST00000492979 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.52■■■□□ 2.48
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SSC4D-202ENST00000492979 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
SSC4D-202ENST00000492979 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
SSC4D-202ENST00000492979 ADGRL1O94910 1474 aa30.48■■■□□ 2.47
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SSC4D-202ENST00000492979 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.46■■■□□ 2.47
SSC4D-202ENST00000492979 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.46■■■□□ 2.47
SSC4D-202ENST00000492979 RICTORQ6R327 1708 aa30.42■■■□□ 2.46
SSC4D-202ENST00000492979 CEP162Q5TB80 1403 aa30.4■■■□□ 2.46
SSC4D-202ENST00000492979 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.4■■■□□ 2.46
SSC4D-202ENST00000492979 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.39■■■□□ 2.46
SSC4D-202ENST00000492979 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.39■■■□□ 2.46
SSC4D-202ENST00000492979 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.36■■■□□ 2.45
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