RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.24	■■■■■ 4.51
TTC3-223	ENST00000492275	PRX	Q9BXM0	1461 aa		43.22	■■■■■ 4.51
TTC3-223	ENST00000492275	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		43.22	■■■■■ 4.51
TTC3-223	ENST00000492275	JPH4	Q96JJ6	628 aa		43.22	■■■■■ 4.51
TTC3-223	ENST00000492275	EEA1	Q15075	1411 aa		43.21	■■■■■ 4.51
TTC3-223	ENST00000492275	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		43.2	■■■■■ 4.51
TTC3-223	ENST00000492275	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		43.2	■■■■■ 4.51
TTC3-223	ENST00000492275	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	43.11	■■■■■ 4.49
TTC3-223	ENST00000492275	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	43.1	■■■■■ 4.49
TTC3-223	ENST00000492275	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.99	■■■■■ 4.47
TTC3-223	ENST00000492275	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.92	■■■■■ 4.46
TTC3-223	ENST00000492275	KIF21B	O75037	1637 aa		42.79	■■■■■ 4.44
TTC3-223	ENST00000492275	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.79	■■■■■ 4.44
TTC3-223	ENST00000492275	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.73	■■■■■ 4.43
TTC3-223	ENST00000492275	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.73	■■■■■ 4.43
TTC3-223	ENST00000492275	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.62	■■■■■ 4.41
TTC3-223	ENST00000492275	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.6	■■■■■ 4.41
TTC3-223	ENST00000492275	PTPRG	P23470	1445 aa		42.59	■■■■■ 4.41
TTC3-223	ENST00000492275	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.55	■■■■■ 4.4
TTC3-223	ENST00000492275	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.53	■■■■■ 4.4
TTC3-223	ENST00000492275	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.52	■■■■■ 4.4
TTC3-223	ENST00000492275	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.45	■■■■■ 4.39
TTC3-223	ENST00000492275	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.38
TTC3-223	ENST00000492275	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.37	■■■■■ 4.37
TTC3-223	ENST00000492275	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.35	■■■■■ 4.37
TTC3-223	ENST00000492275	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.35	■■■■■ 4.37
TTC3-223	ENST00000492275	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.31	■■■■■ 4.36
TTC3-223	ENST00000492275	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.27	■■■■■ 4.36
TTC3-223	ENST00000492275	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.26	■■■■■ 4.36
TTC3-223	ENST00000492275	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.24	■■■■■ 4.35
TTC3-223	ENST00000492275	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.22	■■■■■ 4.35
TTC3-223	ENST00000492275	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.19	■■■■■ 4.34
TTC3-223	ENST00000492275	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		42.15	■■■■■ 4.34
TTC3-223	ENST00000492275	ABCA8	O94911	1581 aa		42.15	■■■■■ 4.34
TTC3-223	ENST00000492275	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		42.12	■■■■■ 4.33
TTC3-223	ENST00000492275	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.12	■■■■■ 4.33
TTC3-223	ENST00000492275	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.07	■■■■■ 4.33
TTC3-223	ENST00000492275	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		42.03	■■■■■ 4.32
TTC3-223	ENST00000492275	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
TTC3-223	ENST00000492275	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		41.97	■■■■■ 4.31
TTC3-223	ENST00000492275	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.94	■■■■■ 4.3
TTC3-223	ENST00000492275	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.93	■■■■■ 4.3
TTC3-223	ENST00000492275	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.92	■■■■■ 4.3
TTC3-223	ENST00000492275	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.87	■■■■■ 4.29
TTC3-223	ENST00000492275	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.86	■■■■■ 4.29
TTC3-223	ENST00000492275	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.85	■■■■■ 4.29
TTC3-223	ENST00000492275	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.82	■■■■■ 4.29
TTC3-223	ENST00000492275	ATP10B	O94823	1461 aa		41.82	■■■■■ 4.29
TTC3-223	ENST00000492275	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.79	■■■■■ 4.28
TTC3-223	ENST00000492275	CLIP1	P30622	1438 aa		41.78	■■■■■ 4.28
TTC3-223	ENST00000492275	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.77	■■■■■ 4.28
TTC3-223	ENST00000492275	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.71	■■■■■ 4.27
TTC3-223	ENST00000492275	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.68	■■■■■ 4.26
TTC3-223	ENST00000492275	GLI2	P10070	1586 aa		41.67	■■■■■ 4.26
TTC3-223	ENST00000492275	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.62	■■■■■ 4.25
TTC3-223	ENST00000492275	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.61	■■■■■ 4.25
TTC3-223	ENST00000492275	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.61	■■■■■ 4.25
TTC3-223	ENST00000492275	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.58	■■■■■ 4.25
TTC3-223	ENST00000492275	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.57	■■■■■ 4.25
TTC3-223	ENST00000492275	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.56	■■■■■ 4.24
TTC3-223	ENST00000492275	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.56	■■■■■ 4.24
TTC3-223	ENST00000492275	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.52	■■■■■ 4.24
TTC3-223	ENST00000492275	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.49	■■■■■ 4.23
TTC3-223	ENST00000492275	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.49	■■■■■ 4.23
TTC3-223	ENST00000492275	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.48	■■■■■ 4.23
TTC3-223	ENST00000492275	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.48	■■■■■ 4.23
TTC3-223	ENST00000492275	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.45	■■■■■ 4.23
TTC3-223	ENST00000492275	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.44	■■■■■ 4.22
TTC3-223	ENST00000492275	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.38	■■■■■ 4.21
TTC3-223	ENST00000492275	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		41.36	■■■■■ 4.21
TTC3-223	ENST00000492275	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.33	■■■■■ 4.21
TTC3-223	ENST00000492275	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.31	■■■■■ 4.2
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		41.27	■■■■■ 4.2
TTC3-223	ENST00000492275	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.26	■■■■■ 4.2
TTC3-223	ENST00000492275	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.24	■■■■■ 4.19
TTC3-223	ENST00000492275	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.22	■■■■■ 4.19
TTC3-223	ENST00000492275	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.18	■■■■■ 4.18	8e-9	■■■■□ 23.3
TTC3-223	ENST00000492275	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.17	■■■■■ 4.18
TTC3-223	ENST00000492275	KDM6B	O15054	1643 aa		41.15	■■■■■ 4.18
TTC3-223	ENST00000492275	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.12	■■■■■ 4.17
TTC3-223	ENST00000492275	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		41.11	■■■■■ 4.17
TTC3-223	ENST00000492275	KIF14	Q15058	1648 aa		41.09	■■■■■ 4.17
TTC3-223	ENST00000492275	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.07	■■■■■ 4.16
TTC3-223	ENST00000492275	NEO1	Q92859	1461 aa		40.93	■■■■■ 4.14
TTC3-223	ENST00000492275	PLCH2	O75038	1416 aa		40.93	■■■■■ 4.14
TTC3-223	ENST00000492275	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.92	■■■■■ 4.14
TTC3-223	ENST00000492275	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.91	■■■■■ 4.14
TTC3-223	ENST00000492275	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.89	■■■■■ 4.14
TTC3-223	ENST00000492275	FANCA	O15360	1455 aa		40.88	■■■■■ 4.13
TTC3-223	ENST00000492275	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		40.86	■■■■■ 4.13
TTC3-223	ENST00000492275	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.85	■■■■■ 4.13
TTC3-223	ENST00000492275	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.82	■■■■■ 4.12
TTC3-223	ENST00000492275	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.82	■■■■■ 4.12
TTC3-223	ENST00000492275	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		40.79	■■■■■ 4.12
TTC3-223	ENST00000492275	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.79	■■■■■ 4.12
TTC3-223	ENST00000492275	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		40.76	■■■■■ 4.12
TTC3-223	ENST00000492275	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.76	■■■■■ 4.12
TTC3-223	ENST00000492275	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.76	■■■■■ 4.12
TTC3-223	ENST00000492275	PREX2	Q70Z35	1606 aa		40.74	■■■■■ 4.11
TTC3-223	ENST00000492275	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		40.72	■■■■■ 4.11

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms