RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492213.5

POLR2F-212, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 4

Gene POLR2F, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-212ENST00000492213 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.01■■■■□ 3.36
POLR2F-212ENST00000492213 JPH4Q96JJ6 628 aa35.97■■■■□ 3.35
POLR2F-212ENST00000492213 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.96■■■■□ 3.35
POLR2F-212ENST00000492213 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.93■■■■□ 3.34
POLR2F-212ENST00000492213 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
POLR2F-212ENST00000492213 PRXQ9BXM0 1461 aa35.89■■■■□ 3.34
POLR2F-212ENST00000492213 EEA1Q15075 1411 aa35.77■■■■□ 3.32
POLR2F-212ENST00000492213 IQGAP2Q13576 1575 aa35.76■■■■□ 3.32
POLR2F-212ENST00000492213 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.74■■■■□ 3.31
POLR2F-212ENST00000492213 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.62■■■■□ 3.29
POLR2F-212ENST00000492213 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.59■■■■□ 3.29
POLR2F-212ENST00000492213 DISP1Q96F81 1524 aa35.59■■■■□ 3.29
POLR2F-212ENST00000492213 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
POLR2F-212ENST00000492213 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.55■■■■□ 3.28
POLR2F-212ENST00000492213 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.5■■■■□ 3.27
POLR2F-212ENST00000492213 PTPRGP23470 1445 aa35.46■■■■□ 3.27
POLR2F-212ENST00000492213 KIAA0556O60303 1618 aa35.46■■■■□ 3.27
POLR2F-212ENST00000492213 KIF21BO75037 1637 aa35.44■■■■□ 3.26
POLR2F-212ENST00000492213 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.43■■■■□ 3.26
POLR2F-212ENST00000492213 GOLGA3Q08378 1498 aa35.34■■■■□ 3.25
POLR2F-212ENST00000492213 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
POLR2F-212ENST00000492213 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
POLR2F-212ENST00000492213 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.26■■■■□ 3.23
POLR2F-212ENST00000492213 UACAQ9BZF9 1416 aa35.25■■■■□ 3.23
POLR2F-212ENST00000492213 MAPKBP1O60336 1514 aa35.22■■■■□ 3.23
POLR2F-212ENST00000492213 SAMD9Q5K651 1589 aa35.21■■■■□ 3.23
POLR2F-212ENST00000492213 ABCC2Q92887 1545 aa35.2■■■■□ 3.23
POLR2F-212ENST00000492213 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.16■■■■□ 3.22
POLR2F-212ENST00000492213 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.13■■■■□ 3.21
POLR2F-212ENST00000492213 ABCA8O94911 1581 aa35.11■■■■□ 3.21
POLR2F-212ENST00000492213 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.09■■■■□ 3.21
POLR2F-212ENST00000492213 P3H3Q8IVL6 736 aa35.08■■■■□ 3.21
POLR2F-212ENST00000492213 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.08■■■■□ 3.21
POLR2F-212ENST00000492213 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.06■■■■□ 3.2
POLR2F-212ENST00000492213 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.05■■■■□ 3.2
POLR2F-212ENST00000492213 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
POLR2F-212ENST00000492213 DIP2BQ9P265 1576 aa35.01■■■■□ 3.2
POLR2F-212ENST00000492213 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
POLR2F-212ENST00000492213 EFCAB5A4FU69 1503 aa35■■■■□ 3.19
POLR2F-212ENST00000492213 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
POLR2F-212ENST00000492213 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.98■■■■□ 3.19
POLR2F-212ENST00000492213 ASXL2Q76L83 1435 aa34.98■■■■□ 3.19
POLR2F-212ENST00000492213 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.92■■■■□ 3.18
POLR2F-212ENST00000492213 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.85■■■■□ 3.17
POLR2F-212ENST00000492213 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.84■■■■□ 3.17
POLR2F-212ENST00000492213 GLI2P10070 1586 aa34.81■■■■□ 3.16
POLR2F-212ENST00000492213 ATP10BO94823 1461 aa34.8■■■■□ 3.16
POLR2F-212ENST00000492213 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
POLR2F-212ENST00000492213 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
POLR2F-212ENST00000492213 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.78■■■■□ 3.16
POLR2F-212ENST00000492213 ARID3CA6NKF2 412 aa34.72■■■■□ 3.15
POLR2F-212ENST00000492213 FMN1Q68DA7 1419 aa34.64■■■■□ 3.14
POLR2F-212ENST00000492213 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
POLR2F-212ENST00000492213 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.63■■■■□ 3.13
POLR2F-212ENST00000492213 TSPOAP1O95153 1857 aa34.62■■■■□ 3.13
POLR2F-212ENST00000492213 CLIP1P30622 1438 aa34.55■■■■□ 3.12
POLR2F-212ENST00000492213 KCNH8Q96L42 1107 aa34.54■■■■□ 3.12
POLR2F-212ENST00000492213 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
POLR2F-212ENST00000492213 HECW1Q76N89 1606 aa34.49■■■■□ 3.11
POLR2F-212ENST00000492213 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.47■■■■□ 3.11
POLR2F-212ENST00000492213 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
POLR2F-212ENST00000492213 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
POLR2F-212ENST00000492213 CD109Q6YHK3 1445 aa34.45■■■■□ 3.11
POLR2F-212ENST00000492213 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.43■■■■□ 3.1
POLR2F-212ENST00000492213 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.43■■■■□ 3.1
POLR2F-212ENST00000492213 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.42■■■■□ 3.1
POLR2F-212ENST00000492213 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
POLR2F-212ENST00000492213 CEP162Q5TB80 1403 aa34.41■■■■□ 3.1
POLR2F-212ENST00000492213 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.41■■■■□ 3.1
POLR2F-212ENST00000492213 KDM6BO15054 1643 aa34.41■■■■□ 3.1
POLR2F-212ENST00000492213 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.4■■■■□ 3.1
POLR2F-212ENST00000492213 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.38■■■■□ 3.09
POLR2F-212ENST00000492213 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.38■■■■□ 3.09
POLR2F-212ENST00000492213 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
POLR2F-212ENST00000492213 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
POLR2F-212ENST00000492213 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.32■■■■□ 3.08
POLR2F-212ENST00000492213 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.26■■■■□ 3.086e-7■■■■■ 36.7
POLR2F-212ENST00000492213 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.24■■■■□ 3.07
POLR2F-212ENST00000492213 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.23■■■■□ 3.07
POLR2F-212ENST00000492213 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
POLR2F-212ENST00000492213 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
POLR2F-212ENST00000492213 KIF14Q15058 1648 aa34.15■■■■□ 3.06
POLR2F-212ENST00000492213 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.13■■■■□ 3.05
POLR2F-212ENST00000492213 NEO1Q92859 1461 aa34.13■■■■□ 3.05
POLR2F-212ENST00000492213 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.11■■■■□ 3.05
POLR2F-212ENST00000492213 PLCH2O75038 1416 aa34.04■■■■□ 3.04
POLR2F-212ENST00000492213 FANCAO15360 1455 aa34.02■■■■□ 3.04
POLR2F-212ENST00000492213 VPS8Q8N3P4 1428 aa34■■■■□ 3.03
POLR2F-212ENST00000492213 AKNAQ7Z591 1439 aa33.99■■■■□ 3.03
POLR2F-212ENST00000492213 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.98■■■■□ 3.03
POLR2F-212ENST00000492213 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.97■■■■□ 3.03
POLR2F-212ENST00000492213 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.96■■■■□ 3.03
POLR2F-212ENST00000492213 RAPGEF3O95398 923 aa33.92■■■■□ 3.02
POLR2F-212ENST00000492213 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
POLR2F-212ENST00000492213 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.86■■■■□ 3.01
POLR2F-212ENST00000492213 PREX2Q70Z35 1606 aa33.86■■■■□ 3.01
POLR2F-212ENST00000492213 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.85■■■■□ 3.01
POLR2F-212ENST00000492213 RICTORQ6R327 1708 aa33.85■■■■□ 3.01
POLR2F-212ENST00000492213 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.85■■■■□ 3.01
POLR2F-212ENST00000492213 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.84■■■■□ 3.01
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