RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491824.1

HCLS1-210, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 3

Gene HCLS1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-210ENST00000491824 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.66■■■□□ 2.02
HCLS1-210ENST00000491824 JPH4Q96JJ6 628 aa27.63■■■□□ 2.01
HCLS1-210ENST00000491824 EEA1Q15075 1411 aa27.6■■■□□ 2.01
HCLS1-210ENST00000491824 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
HCLS1-210ENST00000491824 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.54■■■□□ 2
HCLS1-210ENST00000491824 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.53■■■□□ 2
HCLS1-210ENST00000491824 IQGAP2Q13576 1575 aa27.52■■■□□ 2
HCLS1-210ENST00000491824 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.5■■□□□ 1.99
HCLS1-210ENST00000491824 PRXQ9BXM0 1461 aa27.49■■□□□ 1.99
HCLS1-210ENST00000491824 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.47■■□□□ 1.99
HCLS1-210ENST00000491824 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
HCLS1-210ENST00000491824 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.38■■□□□ 1.97
HCLS1-210ENST00000491824 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.32■■□□□ 1.96
HCLS1-210ENST00000491824 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.31■■□□□ 1.96
HCLS1-210ENST00000491824 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
HCLS1-210ENST00000491824 PTPRGP23470 1445 aa27.3■■□□□ 1.96
HCLS1-210ENST00000491824 GOLGA3Q08378 1498 aa27.29■■□□□ 1.96
HCLS1-210ENST00000491824 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
HCLS1-210ENST00000491824 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
HCLS1-210ENST00000491824 KIF21BO75037 1637 aa27.24■■□□□ 1.95
HCLS1-210ENST00000491824 DISP1Q96F81 1524 aa27.24■■□□□ 1.95
HCLS1-210ENST00000491824 KIAA0556O60303 1618 aa27.22■■□□□ 1.95
HCLS1-210ENST00000491824 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.14■■□□□ 1.94
HCLS1-210ENST00000491824 UACAQ9BZF9 1416 aa27.09■■□□□ 1.93
HCLS1-210ENST00000491824 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HCLS1-210ENST00000491824 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.06■■□□□ 1.92
HCLS1-210ENST00000491824 ABCC2Q92887 1545 aa27.05■■□□□ 1.92
HCLS1-210ENST00000491824 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.04■■□□□ 1.92
HCLS1-210ENST00000491824 MAPKBP1O60336 1514 aa27.04■■□□□ 1.92
HCLS1-210ENST00000491824 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
HCLS1-210ENST00000491824 SAMD9Q5K651 1589 aa27■■□□□ 1.91
HCLS1-210ENST00000491824 P3H3Q8IVL6 736 aa26.99■■□□□ 1.91
HCLS1-210ENST00000491824 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.96■■□□□ 1.91
HCLS1-210ENST00000491824 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.93■■□□□ 1.9
HCLS1-210ENST00000491824 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.91■■□□□ 1.9
HCLS1-210ENST00000491824 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.9■■□□□ 1.9
HCLS1-210ENST00000491824 ABCA8O94911 1581 aa26.89■■□□□ 1.9
HCLS1-210ENST00000491824 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.89■■□□□ 1.9
HCLS1-210ENST00000491824 ASXL2Q76L83 1435 aa26.87■■□□□ 1.89
HCLS1-210ENST00000491824 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.86■■□□□ 1.89
HCLS1-210ENST00000491824 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HCLS1-210ENST00000491824 DIP2BQ9P265 1576 aa26.84■■□□□ 1.89
HCLS1-210ENST00000491824 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.82■■□□□ 1.88
HCLS1-210ENST00000491824 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.79■■□□□ 1.88
HCLS1-210ENST00000491824 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.75■■□□□ 1.87
HCLS1-210ENST00000491824 FMN1Q68DA7 1419 aa26.74■■□□□ 1.87
HCLS1-210ENST00000491824 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
HCLS1-210ENST00000491824 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
HCLS1-210ENST00000491824 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.71■■□□□ 1.87
HCLS1-210ENST00000491824 ARID3CA6NKF2 412 aa26.71■■□□□ 1.87
HCLS1-210ENST00000491824 GLI2P10070 1586 aa26.7■■□□□ 1.86
HCLS1-210ENST00000491824 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HCLS1-210ENST00000491824 ATP10BO94823 1461 aa26.67■■□□□ 1.86
HCLS1-210ENST00000491824 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HCLS1-210ENST00000491824 CLIP1P30622 1438 aa26.63■■□□□ 1.85
HCLS1-210ENST00000491824 KCNH8Q96L42 1107 aa26.62■■□□□ 1.85
HCLS1-210ENST00000491824 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
HCLS1-210ENST00000491824 HECW1Q76N89 1606 aa26.61■■□□□ 1.85
HCLS1-210ENST00000491824 TSPOAP1O95153 1857 aa26.6■■□□□ 1.85
HCLS1-210ENST00000491824 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.57■■□□□ 1.84
HCLS1-210ENST00000491824 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.56■■□□□ 1.84
HCLS1-210ENST00000491824 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.55■■□□□ 1.84
HCLS1-210ENST00000491824 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.53■■□□□ 1.84
HCLS1-210ENST00000491824 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
HCLS1-210ENST00000491824 CD109Q6YHK3 1445 aa26.51■■□□□ 1.83
HCLS1-210ENST00000491824 KDM6BO15054 1643 aa26.5■■□□□ 1.83
HCLS1-210ENST00000491824 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HCLS1-210ENST00000491824 CEP162Q5TB80 1403 aa26.47■■□□□ 1.83
HCLS1-210ENST00000491824 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
HCLS1-210ENST00000491824 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.45■■□□□ 1.82
HCLS1-210ENST00000491824 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.44■■□□□ 1.82
HCLS1-210ENST00000491824 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
HCLS1-210ENST00000491824 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.43■■□□□ 1.82
HCLS1-210ENST00000491824 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.43■■□□□ 1.82
HCLS1-210ENST00000491824 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HCLS1-210ENST00000491824 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.42■■□□□ 1.82
HCLS1-210ENST00000491824 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.38■■□□□ 1.81
HCLS1-210ENST00000491824 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.32■■□□□ 1.8
HCLS1-210ENST00000491824 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
HCLS1-210ENST00000491824 KIF14Q15058 1648 aa26.3■■□□□ 1.8
HCLS1-210ENST00000491824 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
HCLS1-210ENST00000491824 NEO1Q92859 1461 aa26.27■■□□□ 1.8
HCLS1-210ENST00000491824 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.26■■□□□ 1.79
HCLS1-210ENST00000491824 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.25■■□□□ 1.79
HCLS1-210ENST00000491824 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.24■■□□□ 1.79
HCLS1-210ENST00000491824 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.2■■□□□ 1.79
HCLS1-210ENST00000491824 FANCAO15360 1455 aa26.2■■□□□ 1.78
HCLS1-210ENST00000491824 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
HCLS1-210ENST00000491824 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.17■■□□□ 1.78
HCLS1-210ENST00000491824 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.17■■□□□ 1.78
HCLS1-210ENST00000491824 PLCH2O75038 1416 aa26.16■■□□□ 1.78
HCLS1-210ENST00000491824 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.16■■□□□ 1.78
HCLS1-210ENST00000491824 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.13■■□□□ 1.77
HCLS1-210ENST00000491824 AKNAQ7Z591 1439 aa26.13■■□□□ 1.77
HCLS1-210ENST00000491824 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.1■■□□□ 1.77
HCLS1-210ENST00000491824 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
HCLS1-210ENST00000491824 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.07■■□□□ 1.76
HCLS1-210ENST00000491824 ADGRL1O94910 1474 aa26.06■■□□□ 1.76
HCLS1-210ENST00000491824 RAPGEF3O95398 923 aa26.05■■□□□ 1.76
HCLS1-210ENST00000491824 APLP2Q06481 763 aa26.03■■□□□ 1.76
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