RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490738.5

CAMTA1-213, Transcript of calmodulin binding transcription activator 1, humanhuman

TSL 2

Gene CAMTA1, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1-213ENST00000490738 KIF27Q86VH2 1401 aa47.43■■■■■ 5.18
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CAMTA1-213ENST00000490738 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.11■■■■■ 5.13
CAMTA1-213ENST00000490738 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.09■■■■■ 5.13
CAMTA1-213ENST00000490738 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.07■■■■■ 5.13
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CAMTA1-213ENST00000490738 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.79■■■■■ 5.08
CAMTA1-213ENST00000490738 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.78■■■■■ 5.08
CAMTA1-213ENST00000490738 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.76■■■■■ 5.08
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CAMTA1-213ENST00000490738 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa46.55■■■■■ 5.04
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CAMTA1-213ENST00000490738 UACAQ9BZF9 1416 aa46.52■■■■■ 5.04
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CAMTA1-213ENST00000490738 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP46.01■■■■■ 4.96
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CAMTA1-213ENST00000490738 CD109Q6YHK3 1445 aa45.74■■■■■ 4.91
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CAMTA1-213ENST00000490738 ADGRL1O94910 1474 aa45.69■■■■■ 4.91
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CAMTA1-213ENST00000490738 NEO1Q92859 1461 aa45.16■■■■■ 4.82
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CAMTA1-213ENST00000490738 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45■■■■■ 4.79
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CAMTA1-213ENST00000490738 POGZQ7Z3K3 1410 aa44.5■■■■■ 4.71
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