RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489918.1

C1orf61-220, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 427 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-220ENST00000489918 JPH4Q96JJ6 628 aa33.43■■■□□ 2.94
C1orf61-220ENST00000489918 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
C1orf61-220ENST00000489918 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.39■■■□□ 2.94
C1orf61-220ENST00000489918 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.31■■■□□ 2.92
C1orf61-220ENST00000489918 IQGAP2Q13576 1575 aa33.19■■■□□ 2.9
C1orf61-220ENST00000489918 PRXQ9BXM0 1461 aa33.16■■■□□ 2.9
C1orf61-220ENST00000489918 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
C1orf61-220ENST00000489918 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.09■■■□□ 2.89
C1orf61-220ENST00000489918 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.05■■■□□ 2.88
C1orf61-220ENST00000489918 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.03■■■□□ 2.88
C1orf61-220ENST00000489918 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.02■■■□□ 2.88
C1orf61-220ENST00000489918 DISP1Q96F81 1524 aa33■■■□□ 2.87
C1orf61-220ENST00000489918 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33■■■□□ 2.87
C1orf61-220ENST00000489918 EEA1Q15075 1411 aa33■■■□□ 2.87
C1orf61-220ENST00000489918 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.96■■■□□ 2.87
C1orf61-220ENST00000489918 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
C1orf61-220ENST00000489918 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
C1orf61-220ENST00000489918 PTPRGP23470 1445 aa32.95■■■□□ 2.87
C1orf61-220ENST00000489918 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.95■■■□□ 2.86
C1orf61-220ENST00000489918 KIAA0556O60303 1618 aa32.9■■■□□ 2.86
C1orf61-220ENST00000489918 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.79■■■□□ 2.84
C1orf61-220ENST00000489918 GOLGA3Q08378 1498 aa32.75■■■□□ 2.83
C1orf61-220ENST00000489918 MAPKBP1O60336 1514 aa32.75■■■□□ 2.83
C1orf61-220ENST00000489918 KIF21BO75037 1637 aa32.73■■■□□ 2.83
C1orf61-220ENST00000489918 UACAQ9BZF9 1416 aa32.73■■■□□ 2.83
C1orf61-220ENST00000489918 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.71■■■□□ 2.83
C1orf61-220ENST00000489918 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.71■■■□□ 2.83
C1orf61-220ENST00000489918 ABCC2Q92887 1545 aa32.71■■■□□ 2.83
C1orf61-220ENST00000489918 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.63■■■□□ 2.81
C1orf61-220ENST00000489918 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.61■■■□□ 2.81
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C1orf61-220ENST00000489918 SAMD9Q5K651 1589 aa32.6■■■□□ 2.81
C1orf61-220ENST00000489918 DIP2BQ9P265 1576 aa32.6■■■□□ 2.81
C1orf61-220ENST00000489918 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.59■■■□□ 2.81
C1orf61-220ENST00000489918 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.58■■■□□ 2.81
C1orf61-220ENST00000489918 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.57■■■□□ 2.8
C1orf61-220ENST00000489918 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
C1orf61-220ENST00000489918 ABCA8O94911 1581 aa32.55■■■□□ 2.8
C1orf61-220ENST00000489918 ASXL2Q76L83 1435 aa32.53■■■□□ 2.8
C1orf61-220ENST00000489918 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
C1orf61-220ENST00000489918 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
C1orf61-220ENST00000489918 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.42■■■□□ 2.78
C1orf61-220ENST00000489918 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.36■■■□□ 2.77
C1orf61-220ENST00000489918 TSPOAP1O95153 1857 aa32.36■■■□□ 2.77
C1orf61-220ENST00000489918 GLI2P10070 1586 aa32.34■■■□□ 2.77
C1orf61-220ENST00000489918 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
C1orf61-220ENST00000489918 ARID3CA6NKF2 412 aa32.33■■■□□ 2.77
C1orf61-220ENST00000489918 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.33■■■□□ 2.77
C1orf61-220ENST00000489918 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.32■■■□□ 2.76
C1orf61-220ENST00000489918 ATP10BO94823 1461 aa32.29■■■□□ 2.76
C1orf61-220ENST00000489918 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
C1orf61-220ENST00000489918 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
C1orf61-220ENST00000489918 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.23■■■□□ 2.75
C1orf61-220ENST00000489918 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.22■■■□□ 2.75
C1orf61-220ENST00000489918 KCNH8Q96L42 1107 aa32.18■■■□□ 2.74
C1orf61-220ENST00000489918 KDM6BO15054 1643 aa32.12■■■□□ 2.73
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C1orf61-220ENST00000489918 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.06■■■□□ 2.72
C1orf61-220ENST00000489918 FMN1Q68DA7 1419 aa32.06■■■□□ 2.72
C1orf61-220ENST00000489918 CD109Q6YHK3 1445 aa32.04■■■□□ 2.72
C1orf61-220ENST00000489918 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.02■■■□□ 2.72
C1orf61-220ENST00000489918 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
C1orf61-220ENST00000489918 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.98■■■□□ 2.71
C1orf61-220ENST00000489918 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
C1orf61-220ENST00000489918 HECW1Q76N89 1606 aa31.97■■■□□ 2.71
C1orf61-220ENST00000489918 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.96■■■□□ 2.71
C1orf61-220ENST00000489918 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
C1orf61-220ENST00000489918 CLIP1P30622 1438 aa31.94■■■□□ 2.7
C1orf61-220ENST00000489918 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.92■■■□□ 2.7
C1orf61-220ENST00000489918 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.86■■■□□ 2.69
C1orf61-220ENST00000489918 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
C1orf61-220ENST00000489918 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.82■■■□□ 2.68
C1orf61-220ENST00000489918 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.8■■■□□ 2.683e-7■■■■■ 59
C1orf61-220ENST00000489918 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.78■■■□□ 2.68
C1orf61-220ENST00000489918 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.77■■■□□ 2.68
C1orf61-220ENST00000489918 CEP162Q5TB80 1403 aa31.75■■■□□ 2.67
C1orf61-220ENST00000489918 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.72■■■□□ 2.67
C1orf61-220ENST00000489918 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.71■■■□□ 2.67
C1orf61-220ENST00000489918 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
C1orf61-220ENST00000489918 NEO1Q92859 1461 aa31.7■■■□□ 2.66
C1orf61-220ENST00000489918 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.69■■■□□ 2.66
C1orf61-220ENST00000489918 KIF14Q15058 1648 aa31.68■■■□□ 2.66
C1orf61-220ENST00000489918 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
C1orf61-220ENST00000489918 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.66■■■□□ 2.66
C1orf61-220ENST00000489918 FANCAO15360 1455 aa31.62■■■□□ 2.65
C1orf61-220ENST00000489918 PLCH2O75038 1416 aa31.58■■■□□ 2.65
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C1orf61-220ENST00000489918 AKNAQ7Z591 1439 aa31.58■■■□□ 2.65
C1orf61-220ENST00000489918 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
C1orf61-220ENST00000489918 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.56■■■□□ 2.64
C1orf61-220ENST00000489918 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.56■■■□□ 2.64
C1orf61-220ENST00000489918 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.55■■■□□ 2.64
C1orf61-220ENST00000489918 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.53■■■□□ 2.64
C1orf61-220ENST00000489918 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
C1orf61-220ENST00000489918 RICTORQ6R327 1708 aa31.47■■■□□ 2.63
C1orf61-220ENST00000489918 ADGRL1O94910 1474 aa31.45■■■□□ 2.62
C1orf61-220ENST00000489918 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.44■■■□□ 2.62
C1orf61-220ENST00000489918 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.43■■■□□ 2.62
C1orf61-220ENST00000489918 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.43■■■□□ 2.62
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