RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 KIF27Q86VH2 1401 aa29.05■■■□□ 2.24
SH3BP4-210ENST00000489601 CUL7Q14999 1698 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP4-210ENST00000489601 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP4-210ENST00000489601 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.91■■■□□ 2.22
SH3BP4-210ENST00000489601 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.86■■■□□ 2.21
SH3BP4-210ENST00000489601 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.2
SH3BP4-210ENST00000489601 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.8■■■□□ 2.2
SH3BP4-210ENST00000489601 MAPKBP1O60336 1514 aa28.79■■■□□ 2.2
SH3BP4-210ENST00000489601 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.77■■■□□ 2.2
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SH3BP4-210ENST00000489601 DIP2BQ9P265 1576 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BP4-210ENST00000489601 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP4-210ENST00000489601 IQGAP2Q13576 1575 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP4-210ENST00000489601 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.65■■■□□ 2.18
SH3BP4-210ENST00000489601 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP4-210ENST00000489601 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SH3BP4-210ENST00000489601 ABCC2Q92887 1545 aa28.53■■■□□ 2.16
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SH3BP4-210ENST00000489601 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.51■■■□□ 2.15
SH3BP4-210ENST00000489601 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.5■■■□□ 2.15
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SH3BP4-210ENST00000489601 UACAQ9BZF9 1416 aa28.47■■■□□ 2.15
SH3BP4-210ENST00000489601 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.44■■■□□ 2.14
SH3BP4-210ENST00000489601 KDM6BO15054 1643 aa28.43■■■□□ 2.14
SH3BP4-210ENST00000489601 ASXL2Q76L83 1435 aa28.43■■■□□ 2.14
SH3BP4-210ENST00000489601 KIAA0556O60303 1618 aa28.41■■■□□ 2.14
SH3BP4-210ENST00000489601 GLI2P10070 1586 aa28.39■■■□□ 2.14
SH3BP4-210ENST00000489601 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.38■■■□□ 2.13
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SH3BP4-210ENST00000489601 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
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SH3BP4-210ENST00000489601 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP4-210ENST00000489601 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP4-210ENST00000489601 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.14■■■□□ 2.09
SH3BP4-210ENST00000489601 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
SH3BP4-210ENST00000489601 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.08■■■□□ 2.09
SH3BP4-210ENST00000489601 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.03■■■□□ 2.08
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SH3BP4-210ENST00000489601 CD109Q6YHK3 1445 aa28■■■□□ 2.07
SH3BP4-210ENST00000489601 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.99■■■□□ 2.07
SH3BP4-210ENST00000489601 KCNH8Q96L42 1107 aa27.99■■■□□ 2.07
SH3BP4-210ENST00000489601 EEA1Q15075 1411 aa27.98■■■□□ 2.07
SH3BP4-210ENST00000489601 P3H3Q8IVL6 736 aa27.97■■■□□ 2.07
SH3BP4-210ENST00000489601 SAMD9Q5K651 1589 aa27.97■■■□□ 2.07
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SH3BP4-210ENST00000489601 ADGRL1O94910 1474 aa27.9■■■□□ 2.06
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SH3BP4-210ENST00000489601 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.77■■■□□ 2.04
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SH3BP4-210ENST00000489601 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.68■■■□□ 2.02
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SH3BP4-210ENST00000489601 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.52■■■□□ 2
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SH3BP4-210ENST00000489601 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SH3BP4-210ENST00000489601 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
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SH3BP4-210ENST00000489601 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SH3BP4-210ENST00000489601 MADDQ8WXG6 1647 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP4-210ENST00000489601 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP4-210ENST00000489601 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP4-210ENST00000489601 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.27■■□□□ 1.96
SH3BP4-210ENST00000489601 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.26■■□□□ 1.95
SH3BP4-210ENST00000489601 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.25■■□□□ 1.95
SH3BP4-210ENST00000489601 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.24■■□□□ 1.95
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