RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

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Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 GRIN2AQ12879 1464 aa42.16■■■■■ 4.34
HOXB3-210ENST00000489475 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
HOXB3-210ENST00000489475 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.14■■■■■ 4.34
HOXB3-210ENST00000489475 ARAP1Q96P48 1450 aa42.12■■■■■ 4.33
HOXB3-210ENST00000489475 FBLN2P98095 1184 aa42.05■■■■■ 4.32
HOXB3-210ENST00000489475 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.01■■■■■ 4.32
HOXB3-210ENST00000489475 IQGAP2Q13576 1575 aa41.98■■■■■ 4.31
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.94■■■■■ 4.3
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HOXB3-210ENST00000489475 CEP170Q5SW79 1584 aa41.86■■■■■ 4.29
HOXB3-210ENST00000489475 SAMD9Q5K651 1589 aa41.85■■■■■ 4.29
HOXB3-210ENST00000489475 NUP160Q12769 1436 aa41.85■■■■■ 4.29
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HOXB3-210ENST00000489475 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.77■■■■■ 4.28
HOXB3-210ENST00000489475 CHD1O14646 1710 aa41.74■■■■■ 4.27
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
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HOXB3-210ENST00000489475 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.59■■■■■ 4.25
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HOXB3-210ENST00000489475 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.53■■■■■ 4.24
HOXB3-210ENST00000489475 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.52■■■■■ 4.24
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HOXB3-210ENST00000489475 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.46■■■■■ 4.23
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HOXB3-210ENST00000489475 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.15■■■■■ 4.18
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HOXB3-210ENST00000489475 ARID3CA6NKF2 412 aa40.93■■■■■ 4.14
HOXB3-210ENST00000489475 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.9■■■■■ 4.14
HOXB3-210ENST00000489475 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.83■■■■■ 4.13
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HOXB3-210ENST00000489475 ATP10BO94823 1461 aa40.7■■■■■ 4.11
HOXB3-210ENST00000489475 ABCC2Q92887 1545 aa40.66■■■■■ 4.1
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGEF11O15085 1522 aa40.63■■■■■ 4.09
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HOXB3-210ENST00000489475 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.55■■■■■ 4.08
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HOXB3-210ENST00000489475 KIF14Q15058 1648 aa40.38■■■■■ 4.05
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HOXB3-210ENST00000489475 MIA2Q96PC5 1412 aa40.37■■■■■ 4.05
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HOXB3-210ENST00000489475 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.25■■■■■ 4.03
HOXB3-210ENST00000489475 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.24■■■■■ 4.03
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HOXB3-210ENST00000489475 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.12■■■■■ 4.01
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HOXB3-210ENST00000489475 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.1■■■■■ 4.01
HOXB3-210ENST00000489475 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.1■■■■■ 4.01
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HOXB3-210ENST00000489475 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
HOXB3-210ENST00000489475 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.06■■■■■ 41e-8■■□□□ 11.7
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
HOXB3-210ENST00000489475 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.05■■■■■ 4
HOXB3-210ENST00000489475 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.03■■■■■ 4
HOXB3-210ENST00000489475 PTPRKQ15262 1439 aa40.02■■■■■ 4
HOXB3-210ENST00000489475 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.02■■■■■ 4
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
HOXB3-210ENST00000489475 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.99■■■■□ 3.99
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