RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.22■■■■■ 4.19
EHD1-211ENST00000489379 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.16■■■■■ 4.18
EHD1-211ENST00000489379 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
EHD1-211ENST00000489379 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.12■■■■■ 4.17
EHD1-211ENST00000489379 IQGAP2Q13576 1575 aa40.94■■■■■ 4.14
EHD1-211ENST00000489379 EEA1Q15075 1411 aa40.91■■■■■ 4.14
EHD1-211ENST00000489379 PRXQ9BXM0 1461 aa40.9■■■■■ 4.14
EHD1-211ENST00000489379 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.82■■■■■ 4.13
EHD1-211ENST00000489379 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.82■■■■■ 4.12
EHD1-211ENST00000489379 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.8■■■■■ 4.12
EHD1-211ENST00000489379 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.77■■■■■ 4.12
EHD1-211ENST00000489379 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.72■■■■■ 4.11
EHD1-211ENST00000489379 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
EHD1-211ENST00000489379 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.67■■■■■ 4.1
EHD1-211ENST00000489379 PTPRGP23470 1445 aa40.64■■■■■ 4.1
EHD1-211ENST00000489379 DISP1Q96F81 1524 aa40.62■■■■■ 4.09
EHD1-211ENST00000489379 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.54■■■■■ 4.08
EHD1-211ENST00000489379 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.53■■■■■ 4.08
EHD1-211ENST00000489379 GOLGA3Q08378 1498 aa40.53■■■■■ 4.08
EHD1-211ENST00000489379 KIAA0556O60303 1618 aa40.53■■■■■ 4.08
EHD1-211ENST00000489379 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
EHD1-211ENST00000489379 KIF21BO75037 1637 aa40.44■■■■■ 4.06
EHD1-211ENST00000489379 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
EHD1-211ENST00000489379 MAPKBP1O60336 1514 aa40.39■■■■■ 4.06
EHD1-211ENST00000489379 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.39■■■■■ 4.06
EHD1-211ENST00000489379 UACAQ9BZF9 1416 aa40.37■■■■■ 4.05
EHD1-211ENST00000489379 ABCC2Q92887 1545 aa40.32■■■■■ 4.04
EHD1-211ENST00000489379 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.24■■■■■ 4.03
EHD1-211ENST00000489379 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.21■■■■■ 4.03
EHD1-211ENST00000489379 SAMD9Q5K651 1589 aa40.19■■■■■ 4.02
EHD1-211ENST00000489379 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.16■■■■■ 4.02
EHD1-211ENST00000489379 ABCA8O94911 1581 aa40.11■■■■■ 4.01
EHD1-211ENST00000489379 DIP2BQ9P265 1576 aa40.11■■■■■ 4.01
EHD1-211ENST00000489379 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.11■■■■■ 4.01
EHD1-211ENST00000489379 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.1■■■■■ 4.01
EHD1-211ENST00000489379 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
EHD1-211ENST00000489379 P3H3Q8IVL6 736 aa40.06■■■■■ 4
EHD1-211ENST00000489379 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
EHD1-211ENST00000489379 ASXL2Q76L83 1435 aa40.05■■■■■ 4
EHD1-211ENST00000489379 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.02■■■■■ 4
EHD1-211ENST00000489379 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
EHD1-211ENST00000489379 GLI2P10070 1586 aa39.92■■■■□ 3.98
EHD1-211ENST00000489379 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.9■■■■□ 3.98
EHD1-211ENST00000489379 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.87■■■■□ 3.97
EHD1-211ENST00000489379 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.87■■■■□ 3.97
EHD1-211ENST00000489379 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.84■■■■□ 3.97
EHD1-211ENST00000489379 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
EHD1-211ENST00000489379 TSPOAP1O95153 1857 aa39.79■■■■□ 3.96
EHD1-211ENST00000489379 ATP10BO94823 1461 aa39.76■■■■□ 3.96
EHD1-211ENST00000489379 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.69■■■■□ 3.94
EHD1-211ENST00000489379 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.69■■■■□ 3.94
EHD1-211ENST00000489379 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
EHD1-211ENST00000489379 FMN1Q68DA7 1419 aa39.66■■■■□ 3.94
EHD1-211ENST00000489379 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
EHD1-211ENST00000489379 ARID3CA6NKF2 412 aa39.61■■■■□ 3.93
EHD1-211ENST00000489379 KCNH8Q96L42 1107 aa39.59■■■■□ 3.93
EHD1-211ENST00000489379 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.59■■■■□ 3.93
EHD1-211ENST00000489379 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.58■■■■□ 3.93
EHD1-211ENST00000489379 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
EHD1-211ENST00000489379 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
EHD1-211ENST00000489379 KDM6BO15054 1643 aa39.55■■■■□ 3.92
EHD1-211ENST00000489379 CD109Q6YHK3 1445 aa39.5■■■■□ 3.91
EHD1-211ENST00000489379 HECW1Q76N89 1606 aa39.47■■■■□ 3.91
EHD1-211ENST00000489379 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.47■■■■□ 3.91
EHD1-211ENST00000489379 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.46■■■■□ 3.91
EHD1-211ENST00000489379 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.43■■■■□ 3.9
EHD1-211ENST00000489379 CLIP1P30622 1438 aa39.4■■■■□ 3.9
EHD1-211ENST00000489379 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
EHD1-211ENST00000489379 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
EHD1-211ENST00000489379 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
EHD1-211ENST00000489379 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.29■■■■□ 3.88
EHD1-211ENST00000489379 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.25■■■■□ 3.87
EHD1-211ENST00000489379 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
EHD1-211ENST00000489379 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
EHD1-211ENST00000489379 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.2■■■■□ 3.87
EHD1-211ENST00000489379 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.19■■■■□ 3.86
EHD1-211ENST00000489379 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.18■■■■□ 3.86
EHD1-211ENST00000489379 CEP162Q5TB80 1403 aa39.16■■■■□ 3.86
EHD1-211ENST00000489379 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.16■■■■□ 3.86
EHD1-211ENST00000489379 NEO1Q92859 1461 aa39.15■■■■□ 3.86
EHD1-211ENST00000489379 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.14■■■■□ 3.86
EHD1-211ENST00000489379 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
EHD1-211ENST00000489379 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.08■■■■□ 3.85
EHD1-211ENST00000489379 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.05■■■■□ 3.84
EHD1-211ENST00000489379 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.05■■■■□ 3.84
EHD1-211ENST00000489379 KIF14Q15058 1648 aa39.04■■■■□ 3.84
EHD1-211ENST00000489379 FANCAO15360 1455 aa38.98■■■■□ 3.83
EHD1-211ENST00000489379 PLCH2O75038 1416 aa38.97■■■■□ 3.83
EHD1-211ENST00000489379 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.96■■■■□ 3.83
EHD1-211ENST00000489379 AKNAQ7Z591 1439 aa38.93■■■■□ 3.82
EHD1-211ENST00000489379 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
EHD1-211ENST00000489379 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.85■■■■□ 3.81
EHD1-211ENST00000489379 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
EHD1-211ENST00000489379 RAPGEF3O95398 923 aa38.81■■■■□ 3.8
EHD1-211ENST00000489379 RICTORQ6R327 1708 aa38.78■■■■□ 3.8
EHD1-211ENST00000489379 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.78■■■■□ 3.8
EHD1-211ENST00000489379 ADGRL1O94910 1474 aa38.76■■■■□ 3.8
EHD1-211ENST00000489379 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.75■■■■□ 3.79
EHD1-211ENST00000489379 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.74■■■■□ 3.79
EHD1-211ENST00000489379 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.73■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms