RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488949.1

RAB22A-202, Transcript of RAB22A, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 3

Gene RAB22A, Length 1,032 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB22A-202ENST00000488949 SHROOM2Q13796 1616 aa42.31■■■■■ 4.36
RAB22A-202ENST00000488949 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
RAB22A-202ENST00000488949 JPH4Q96JJ6 628 aa42.13■■■■■ 4.33
RAB22A-202ENST00000488949 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.13■■■■■ 4.33
RAB22A-202ENST00000488949 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.05■■■■■ 4.32
RAB22A-202ENST00000488949 IQGAP2Q13576 1575 aa41.91■■■■■ 4.3
RAB22A-202ENST00000488949 PRXQ9BXM0 1461 aa41.85■■■■■ 4.29
RAB22A-202ENST00000488949 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.8■■■■■ 4.28
RAB22A-202ENST00000488949 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.73■■■■■ 4.27
RAB22A-202ENST00000488949 EEA1Q15075 1411 aa41.71■■■■■ 4.27
RAB22A-202ENST00000488949 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.7■■■■■ 4.27
RAB22A-202ENST00000488949 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.69■■■■■ 4.26
RAB22A-202ENST00000488949 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
RAB22A-202ENST00000488949 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.64■■■■■ 4.26
RAB22A-202ENST00000488949 DISP1Q96F81 1524 aa41.62■■■■■ 4.25
RAB22A-202ENST00000488949 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
RAB22A-202ENST00000488949 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.58■■■■■ 4.25
RAB22A-202ENST00000488949 PTPRGP23470 1445 aa41.58■■■■■ 4.25
RAB22A-202ENST00000488949 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.55■■■■■ 4.24
RAB22A-202ENST00000488949 KIAA0556O60303 1618 aa41.52■■■■■ 4.24
RAB22A-202ENST00000488949 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.38■■■■■ 4.21
RAB22A-202ENST00000488949 GOLGA3Q08378 1498 aa41.37■■■■■ 4.21
RAB22A-202ENST00000488949 KIF21BO75037 1637 aa41.36■■■■■ 4.21
RAB22A-202ENST00000488949 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.31■■■■■ 4.2
RAB22A-202ENST00000488949 UACAQ9BZF9 1416 aa41.29■■■■■ 4.2
RAB22A-202ENST00000488949 MAPKBP1O60336 1514 aa41.28■■■■■ 4.2
RAB22A-202ENST00000488949 ABCC2Q92887 1545 aa41.25■■■■■ 4.19
RAB22A-202ENST00000488949 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.24■■■■■ 4.19
RAB22A-202ENST00000488949 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.22■■■■■ 4.19
RAB22A-202ENST00000488949 P3H3Q8IVL6 736 aa41.17■■■■■ 4.18
RAB22A-202ENST00000488949 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.15■■■■■ 4.18
RAB22A-202ENST00000488949 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
RAB22A-202ENST00000488949 SAMD9Q5K651 1589 aa41.15■■■■■ 4.18
RAB22A-202ENST00000488949 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.13■■■■■ 4.17
RAB22A-202ENST00000488949 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
RAB22A-202ENST00000488949 DIP2BQ9P265 1576 aa41.1■■■■■ 4.17
RAB22A-202ENST00000488949 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.08■■■■■ 4.17
RAB22A-202ENST00000488949 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.07■■■■■ 4.16
RAB22A-202ENST00000488949 ABCA8O94911 1581 aa41.06■■■■■ 4.16
RAB22A-202ENST00000488949 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
RAB22A-202ENST00000488949 ASXL2Q76L83 1435 aa41.03■■■■■ 4.16
RAB22A-202ENST00000488949 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
RAB22A-202ENST00000488949 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.95■■■■■ 4.15
RAB22A-202ENST00000488949 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.9■■■■■ 4.14
RAB22A-202ENST00000488949 ARID3CA6NKF2 412 aa40.83■■■■■ 4.13
RAB22A-202ENST00000488949 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.82■■■■■ 4.12
RAB22A-202ENST00000488949 TSPOAP1O95153 1857 aa40.81■■■■■ 4.12
RAB22A-202ENST00000488949 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
RAB22A-202ENST00000488949 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.78■■■■■ 4.12
RAB22A-202ENST00000488949 GLI2P10070 1586 aa40.76■■■■■ 4.12
RAB22A-202ENST00000488949 ATP10BO94823 1461 aa40.7■■■■■ 4.11
RAB22A-202ENST00000488949 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.7■■■■■ 4.11
RAB22A-202ENST00000488949 KDM6BO15054 1643 aa40.68■■■■■ 4.1
RAB22A-202ENST00000488949 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
RAB22A-202ENST00000488949 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.61■■■■■ 4.09
RAB22A-202ENST00000488949 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
RAB22A-202ENST00000488949 KCNH8Q96L42 1107 aa40.59■■■■■ 4.09
RAB22A-202ENST00000488949 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
RAB22A-202ENST00000488949 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
RAB22A-202ENST00000488949 FMN1Q68DA7 1419 aa40.5■■■■■ 4.07
RAB22A-202ENST00000488949 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.43■■■■■ 4.06
RAB22A-202ENST00000488949 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
RAB22A-202ENST00000488949 CD109Q6YHK3 1445 aa40.42■■■■■ 4.06
RAB22A-202ENST00000488949 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.41■■■■■ 4.06
RAB22A-202ENST00000488949 HECW1Q76N89 1606 aa40.4■■■■■ 4.06
RAB22A-202ENST00000488949 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
RAB22A-202ENST00000488949 CLIP1P30622 1438 aa40.38■■■■■ 4.05
RAB22A-202ENST00000488949 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.32■■■■■ 4.05
RAB22A-202ENST00000488949 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.31■■■■■ 4.04
RAB22A-202ENST00000488949 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.29■■■■■ 4.04
RAB22A-202ENST00000488949 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
RAB22A-202ENST00000488949 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
RAB22A-202ENST00000488949 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.22■■■■■ 4.03
RAB22A-202ENST00000488949 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.19■■■■■ 4.02
RAB22A-202ENST00000488949 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.18■■■■■ 4.02
RAB22A-202ENST00000488949 CEP162Q5TB80 1403 aa40.16■■■■■ 4.02
RAB22A-202ENST00000488949 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.13■■■■■ 4.01
RAB22A-202ENST00000488949 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.12■■■■■ 4.01
RAB22A-202ENST00000488949 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.11■■■■■ 4.01
RAB22A-202ENST00000488949 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.09■■■■■ 4.01
RAB22A-202ENST00000488949 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
RAB22A-202ENST00000488949 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.05■■■■■ 4
RAB22A-202ENST00000488949 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
RAB22A-202ENST00000488949 KIF14Q15058 1648 aa39.99■■■■□ 3.99
RAB22A-202ENST00000488949 NEO1Q92859 1461 aa39.99■■■■□ 3.99
RAB22A-202ENST00000488949 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.97■■■■□ 3.99
RAB22A-202ENST00000488949 ADGRL1O94910 1474 aa39.94■■■■□ 3.98
RAB22A-202ENST00000488949 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.92■■■■□ 3.98
RAB22A-202ENST00000488949 FANCAO15360 1455 aa39.91■■■■□ 3.98
RAB22A-202ENST00000488949 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.87■■■■□ 3.97
RAB22A-202ENST00000488949 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.84■■■■□ 3.97
RAB22A-202ENST00000488949 PLCH2O75038 1416 aa39.83■■■■□ 3.97
RAB22A-202ENST00000488949 AKNAQ7Z591 1439 aa39.82■■■■□ 3.97
RAB22A-202ENST00000488949 RAPGEF3O95398 923 aa39.82■■■■□ 3.97
RAB22A-202ENST00000488949 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.8■■■■□ 3.96
RAB22A-202ENST00000488949 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
RAB22A-202ENST00000488949 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.71■■■■□ 3.95
RAB22A-202ENST00000488949 RICTORQ6R327 1708 aa39.68■■■■□ 3.94
RAB22A-202ENST00000488949 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.67■■■■□ 3.94
RAB22A-202ENST00000488949 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.65■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.1 ms