RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487411.5

STX4-210, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene STX4, Length 1,290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-210ENST00000487411 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.43■■■■□ 3.74
STX4-210ENST00000487411 JPH4Q96JJ6 628 aa38.42■■■■□ 3.74
STX4-210ENST00000487411 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
STX4-210ENST00000487411 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.33■■■■□ 3.73
STX4-210ENST00000487411 IQGAP2Q13576 1575 aa38.18■■■■□ 3.7
STX4-210ENST00000487411 PRXQ9BXM0 1461 aa38.15■■■■□ 3.7
STX4-210ENST00000487411 EEA1Q15075 1411 aa38.04■■■■□ 3.68
STX4-210ENST00000487411 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.02■■■■□ 3.68
STX4-210ENST00000487411 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38■■■■□ 3.67
STX4-210ENST00000487411 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.98■■■■□ 3.67
STX4-210ENST00000487411 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.98■■■■□ 3.67
STX4-210ENST00000487411 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.97■■■■□ 3.67
STX4-210ENST00000487411 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.96■■■■□ 3.67
STX4-210ENST00000487411 DISP1Q96F81 1524 aa37.93■■■■□ 3.66
STX4-210ENST00000487411 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.92■■■■□ 3.66
STX4-210ENST00000487411 PTPRGP23470 1445 aa37.89■■■■□ 3.66
STX4-210ENST00000487411 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.87■■■■□ 3.65
STX4-210ENST00000487411 KIAA0556O60303 1618 aa37.83■■■■□ 3.65
STX4-210ENST00000487411 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.74■■■■□ 3.63
STX4-210ENST00000487411 GOLGA3Q08378 1498 aa37.72■■■■□ 3.63
STX4-210ENST00000487411 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
STX4-210ENST00000487411 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.72■■■■□ 3.63
STX4-210ENST00000487411 MAPKBP1O60336 1514 aa37.71■■■■□ 3.63
STX4-210ENST00000487411 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.67■■■■□ 3.62
STX4-210ENST00000487411 KIF21BO75037 1637 aa37.67■■■■□ 3.62
STX4-210ENST00000487411 UACAQ9BZF9 1416 aa37.65■■■■□ 3.62
STX4-210ENST00000487411 ABCC2Q92887 1545 aa37.63■■■■□ 3.61
STX4-210ENST00000487411 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.55■■■■□ 3.6
STX4-210ENST00000487411 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.54■■■■□ 3.6
STX4-210ENST00000487411 SAMD9Q5K651 1589 aa37.5■■■■□ 3.59
STX4-210ENST00000487411 DIP2BQ9P265 1576 aa37.49■■■■□ 3.59
STX4-210ENST00000487411 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.48■■■■□ 3.59
STX4-210ENST00000487411 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.46■■■■□ 3.59
STX4-210ENST00000487411 ABCA8O94911 1581 aa37.44■■■■□ 3.58
STX4-210ENST00000487411 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.42■■■■□ 3.58
STX4-210ENST00000487411 ASXL2Q76L83 1435 aa37.4■■■■□ 3.58
STX4-210ENST00000487411 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
STX4-210ENST00000487411 P3H3Q8IVL6 736 aa37.36■■■■□ 3.57
STX4-210ENST00000487411 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.29■■■■□ 3.56
STX4-210ENST00000487411 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
STX4-210ENST00000487411 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
STX4-210ENST00000487411 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.24■■■■□ 3.55
STX4-210ENST00000487411 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.24■■■■□ 3.55
STX4-210ENST00000487411 GLI2P10070 1586 aa37.24■■■■□ 3.55
STX4-210ENST00000487411 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
STX4-210ENST00000487411 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.19■■■■□ 3.54
STX4-210ENST00000487411 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.17■■■■□ 3.54
STX4-210ENST00000487411 ATP10BO94823 1461 aa37.1■■■■□ 3.53
STX4-210ENST00000487411 TSPOAP1O95153 1857 aa37.08■■■■□ 3.53
STX4-210ENST00000487411 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
STX4-210ENST00000487411 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.04■■■■□ 3.52
STX4-210ENST00000487411 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.04■■■■□ 3.52
STX4-210ENST00000487411 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
STX4-210ENST00000487411 ARID3CA6NKF2 412 aa37.02■■■■□ 3.52
STX4-210ENST00000487411 KDM6BO15054 1643 aa36.94■■■■□ 3.5
STX4-210ENST00000487411 FMN1Q68DA7 1419 aa36.92■■■■□ 3.5
STX4-210ENST00000487411 KCNH8Q96L42 1107 aa36.91■■■■□ 3.5
STX4-210ENST00000487411 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.9■■■■□ 3.5
STX4-210ENST00000487411 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.89■■■■□ 3.5
STX4-210ENST00000487411 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
STX4-210ENST00000487411 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
STX4-210ENST00000487411 CD109Q6YHK3 1445 aa36.85■■■■□ 3.49
STX4-210ENST00000487411 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.82■■■■□ 3.48
STX4-210ENST00000487411 HECW1Q76N89 1606 aa36.78■■■■□ 3.48
STX4-210ENST00000487411 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.77■■■■□ 3.48
STX4-210ENST00000487411 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
STX4-210ENST00000487411 CLIP1P30622 1438 aa36.71■■■■□ 3.47
STX4-210ENST00000487411 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.71■■■■□ 3.47
STX4-210ENST00000487411 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
STX4-210ENST00000487411 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
STX4-210ENST00000487411 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
STX4-210ENST00000487411 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.6■■■■□ 3.45
STX4-210ENST00000487411 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.55■■■■□ 3.44
STX4-210ENST00000487411 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.54■■■■□ 3.44
STX4-210ENST00000487411 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.52■■■■□ 3.44
STX4-210ENST00000487411 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.52■■■■□ 3.44
STX4-210ENST00000487411 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
STX4-210ENST00000487411 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.5■■■■□ 3.43
STX4-210ENST00000487411 NEO1Q92859 1461 aa36.5■■■■□ 3.43
STX4-210ENST00000487411 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.5■■■■□ 3.43
STX4-210ENST00000487411 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.5■■■■□ 3.43
STX4-210ENST00000487411 CEP162Q5TB80 1403 aa36.5■■■■□ 3.43
STX4-210ENST00000487411 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
STX4-210ENST00000487411 KIF14Q15058 1648 aa36.4■■■■□ 3.42
STX4-210ENST00000487411 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.37■■■■□ 3.41
STX4-210ENST00000487411 FANCAO15360 1455 aa36.37■■■■□ 3.41
STX4-210ENST00000487411 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.36■■■■□ 3.41
STX4-210ENST00000487411 PLCH2O75038 1416 aa36.34■■■■□ 3.41
STX4-210ENST00000487411 AKNAQ7Z591 1439 aa36.31■■■■□ 3.4
STX4-210ENST00000487411 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
STX4-210ENST00000487411 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.27■■■■□ 3.4
STX4-210ENST00000487411 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.27■■■■□ 3.4
STX4-210ENST00000487411 RAPGEF3O95398 923 aa36.24■■■■□ 3.39
STX4-210ENST00000487411 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
STX4-210ENST00000487411 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.18■■■■□ 3.38
STX4-210ENST00000487411 RICTORQ6R327 1708 aa36.17■■■■□ 3.38
STX4-210ENST00000487411 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.16■■■■□ 3.38
STX4-210ENST00000487411 ADGRL1O94910 1474 aa36.16■■■■□ 3.38
STX4-210ENST00000487411 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.13■■■■□ 3.38
STX4-210ENST00000487411 PREX2Q70Z35 1606 aa36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms