RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487284.2

CUX1-209, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene CUX1, Length 1,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-209ENST00000487284 CEP170Q5SW79 1584 aa22.7■■□□□ 1.22
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CUX1-209ENST00000487284 CEP162Q5TB80 1403 aa22.66■■□□□ 1.22
CUX1-209ENST00000487284 IQGAP2Q13576 1575 aa22.6■■□□□ 1.21
CUX1-209ENST00000487284 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.6■■□□□ 1.21
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CUX1-209ENST00000487284 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.54■■□□□ 1.2
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CUX1-209ENST00000487284 SHROOM2Q13796 1616 aa22.45■■□□□ 1.18
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CUX1-209ENST00000487284 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.43■■□□□ 1.18
CUX1-209ENST00000487284 DISP1Q96F81 1524 aa22.4■■□□□ 1.18
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CUX1-209ENST00000487284 ARAP1Q96P48 1450 aa22.37■■□□□ 1.17
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CUX1-209ENST00000487284 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.22■■□□□ 1.15
CUX1-209ENST00000487284 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
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CUX1-209ENST00000487284 ARHGEF11O15085 1522 aa22.19■■□□□ 1.14
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CUX1-209ENST00000487284 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.11■■□□□ 1.13
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CUX1-209ENST00000487284 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.79■■□□□ 1.08
CUX1-209ENST00000487284 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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CUX1-209ENST00000487284 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.69■■□□□ 1.06
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CUX1-209ENST00000487284 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.46■■□□□ 1.03
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CUX1-209ENST00000487284 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.44■■□□□ 1.02
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