RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487112.5

PGAP2-222, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 792 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-222	ENST00000487112	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PGAP2-222	ENST00000487112	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PGAP2-222	ENST00000487112	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PGAP2-222	ENST00000487112	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PGAP2-222	ENST00000487112	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PGAP2-222	ENST00000487112	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PGAP2-222	ENST00000487112	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PGAP2-222	ENST00000487112	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PGAP2-222	ENST00000487112	APLP2	Q06481	763 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PGAP2-222	ENST00000487112	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PGAP2-222	ENST00000487112	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PGAP2-222	ENST00000487112	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PGAP2-222	ENST00000487112	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PGAP2-222	ENST00000487112	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
PGAP2-222	ENST00000487112	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
PGAP2-222	ENST00000487112	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.45	■■■□□ 2.15
PGAP2-222	ENST00000487112	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.45	■■■□□ 2.15
PGAP2-222	ENST00000487112	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PGAP2-222	ENST00000487112	NUP160	Q12769	1436 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PGAP2-222	ENST00000487112	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PGAP2-222	ENST00000487112	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PGAP2-222	ENST00000487112	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PGAP2-222	ENST00000487112	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PGAP2-222	ENST00000487112	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PGAP2-222	ENST00000487112	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PGAP2-222	ENST00000487112	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PGAP2-222	ENST00000487112	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PGAP2-222	ENST00000487112	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PGAP2-222	ENST00000487112	FBLN2	P98095	1184 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PGAP2-222	ENST00000487112	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PGAP2-222	ENST00000487112	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PGAP2-222	ENST00000487112	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PGAP2-222	ENST00000487112	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PGAP2-222	ENST00000487112	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PGAP2-222	ENST00000487112	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
PGAP2-222	ENST00000487112	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PGAP2-222	ENST00000487112	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PGAP2-222	ENST00000487112	CHD1	O14646	1710 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PGAP2-222	ENST00000487112	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PGAP2-222	ENST00000487112	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PGAP2-222	ENST00000487112	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PGAP2-222	ENST00000487112	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
PGAP2-222	ENST00000487112	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
PGAP2-222	ENST00000487112	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PGAP2-222	ENST00000487112	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PGAP2-222	ENST00000487112	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PGAP2-222	ENST00000487112	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PGAP2-222	ENST00000487112	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PGAP2-222	ENST00000487112	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PGAP2-222	ENST00000487112	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PGAP2-222	ENST00000487112	HRC	P23327	699 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PGAP2-222	ENST00000487112	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PGAP2-222	ENST00000487112	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PGAP2-222	ENST00000487112	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PGAP2-222	ENST00000487112	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PGAP2-222	ENST00000487112	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PGAP2-222	ENST00000487112	ABCA8	O94911	1581 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PGAP2-222	ENST00000487112	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PGAP2-222	ENST00000487112	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PGAP2-222	ENST00000487112	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PGAP2-222	ENST00000487112	PTPRG	P23470	1445 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PGAP2-222	ENST00000487112	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PGAP2-222	ENST00000487112	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PGAP2-222	ENST00000487112	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	27.79	■■■□□ 2.04
PGAP2-222	ENST00000487112	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PGAP2-222	ENST00000487112	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PGAP2-222	ENST00000487112	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PGAP2-222	ENST00000487112	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PGAP2-222	ENST00000487112	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PGAP2-222	ENST00000487112	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PGAP2-222	ENST00000487112	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PGAP2-222	ENST00000487112	UACA	Q9BZF9	1416 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PGAP2-222	ENST00000487112	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PGAP2-222	ENST00000487112	ARID3C	A6NKF2	412 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PGAP2-222	ENST00000487112	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
PGAP2-222	ENST00000487112	ATP10B	O94823	1461 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PGAP2-222	ENST00000487112	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PGAP2-222	ENST00000487112	ABCC2	Q92887	1545 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PGAP2-222	ENST00000487112	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PGAP2-222	ENST00000487112	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PGAP2-222	ENST00000487112	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PGAP2-222	ENST00000487112	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PGAP2-222	ENST00000487112	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		27.57	■■■□□ 2
PGAP2-222	ENST00000487112	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.54	■■■□□ 2
PGAP2-222	ENST00000487112	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.53	■■■□□ 2
PGAP2-222	ENST00000487112	KIF14	Q15058	1648 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PGAP2-222	ENST00000487112	ITGAE	P38570	1179 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PGAP2-222	ENST00000487112	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PGAP2-222	ENST00000487112	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PGAP2-222	ENST00000487112	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PGAP2-222	ENST00000487112	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PGAP2-222	ENST00000487112	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.4	■■□□□ 1.98
PGAP2-222	ENST00000487112	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PGAP2-222	ENST00000487112	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PGAP2-222	ENST00000487112	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PGAP2-222	ENST00000487112	HFM1	A2PYH4	1435 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PGAP2-222	ENST00000487112	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PGAP2-222	ENST00000487112	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	27.33	■■□□□ 1.97
PGAP2-222	ENST00000487112	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.32	■■□□□ 1.96
PGAP2-222	ENST00000487112	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	27.31	■■□□□ 1.96

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