RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486411.1

GOLGA2-208, Transcript of golgin A2, human

TSL 3

Gene GOLGA2, Length 591 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GOLGA2-208	ENST00000486411	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GOLGA2-208	ENST00000486411	EEA1	Q15075	1411 aa		32.85	■■■□□ 2.85
GOLGA2-208	ENST00000486411	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GOLGA2-208	ENST00000486411	JPH4	Q96JJ6	628 aa		32.78	■■■□□ 2.84
GOLGA2-208	ENST00000486411	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GOLGA2-208	ENST00000486411	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
GOLGA2-208	ENST00000486411	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.73	■■■□□ 2.83
GOLGA2-208	ENST00000486411	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GOLGA2-208	ENST00000486411	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.65	■■■□□ 2.82
GOLGA2-208	ENST00000486411	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GOLGA2-208	ENST00000486411	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GOLGA2-208	ENST00000486411	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GOLGA2-208	ENST00000486411	KIF21B	O75037	1637 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GOLGA2-208	ENST00000486411	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GOLGA2-208	ENST00000486411	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
GOLGA2-208	ENST00000486411	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GOLGA2-208	ENST00000486411	PTPRG	P23470	1445 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GOLGA2-208	ENST00000486411	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GOLGA2-208	ENST00000486411	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GOLGA2-208	ENST00000486411	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GOLGA2-208	ENST00000486411	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.19	■■■□□ 2.74
GOLGA2-208	ENST00000486411	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GOLGA2-208	ENST00000486411	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GOLGA2-208	ENST00000486411	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GOLGA2-208	ENST00000486411	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GOLGA2-208	ENST00000486411	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.1	■■■□□ 2.73
GOLGA2-208	ENST00000486411	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
GOLGA2-208	ENST00000486411	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
GOLGA2-208	ENST00000486411	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
GOLGA2-208	ENST00000486411	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.04	■■■□□ 2.72
GOLGA2-208	ENST00000486411	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.01	■■■□□ 2.72
GOLGA2-208	ENST00000486411	ABCA8	O94911	1581 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GOLGA2-208	ENST00000486411	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GOLGA2-208	ENST00000486411	P3H3	Q8IVL6	736 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GOLGA2-208	ENST00000486411	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GOLGA2-208	ENST00000486411	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		31.9	■■■□□ 2.7
GOLGA2-208	ENST00000486411	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		31.9	■■■□□ 2.7
GOLGA2-208	ENST00000486411	ASXL2	Q76L83	1435 aa		31.85	■■■□□ 2.69
GOLGA2-208	ENST00000486411	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
GOLGA2-208	ENST00000486411	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
GOLGA2-208	ENST00000486411	DIP2B	Q9P265	1576 aa		31.84	■■■□□ 2.69
GOLGA2-208	ENST00000486411	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.83	■■■□□ 2.69
GOLGA2-208	ENST00000486411	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GOLGA2-208	ENST00000486411	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GOLGA2-208	ENST00000486411	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		31.76	■■■□□ 2.67
GOLGA2-208	ENST00000486411	FMN1	Q68DA7	1419 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GOLGA2-208	ENST00000486411	GLI2	P10070	1586 aa		31.73	■■■□□ 2.67
GOLGA2-208	ENST00000486411	ATP10B	O94823	1461 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GOLGA2-208	ENST00000486411	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		31.72	■■■□□ 2.67
GOLGA2-208	ENST00000486411	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
GOLGA2-208	ENST00000486411	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
GOLGA2-208	ENST00000486411	CLIP1	P30622	1438 aa		31.64	■■■□□ 2.66
GOLGA2-208	ENST00000486411	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.54	■■■□□ 2.64
GOLGA2-208	ENST00000486411	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.53	■■■□□ 2.64
GOLGA2-208	ENST00000486411	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.53	■■■□□ 2.64
GOLGA2-208	ENST00000486411	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.49	■■■□□ 2.63
GOLGA2-208	ENST00000486411	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.49	■■■□□ 2.63
GOLGA2-208	ENST00000486411	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
GOLGA2-208	ENST00000486411	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
GOLGA2-208	ENST00000486411	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
GOLGA2-208	ENST00000486411	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.44	■■■□□ 2.62
GOLGA2-208	ENST00000486411	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.43	■■■□□ 2.62
GOLGA2-208	ENST00000486411	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.43	■■■□□ 2.62
GOLGA2-208	ENST00000486411	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
GOLGA2-208	ENST00000486411	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.42	■■■□□ 2.62
GOLGA2-208	ENST00000486411	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.42	■■■□□ 2.62
GOLGA2-208	ENST00000486411	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.41	■■■□□ 2.62
GOLGA2-208	ENST00000486411	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
GOLGA2-208	ENST00000486411	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.4	■■■□□ 2.62
GOLGA2-208	ENST00000486411	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.4	■■■□□ 2.62
GOLGA2-208	ENST00000486411	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.38	■■■□□ 2.61
GOLGA2-208	ENST00000486411	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.38	■■■□□ 2.61
GOLGA2-208	ENST00000486411	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.37	■■■□□ 2.61
GOLGA2-208	ENST00000486411	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
GOLGA2-208	ENST00000486411	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
GOLGA2-208	ENST00000486411	KDM6B	O15054	1643 aa		31.29	■■■□□ 2.6
GOLGA2-208	ENST00000486411	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.27	■■■□□ 2.6
GOLGA2-208	ENST00000486411	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.6
GOLGA2-208	ENST00000486411	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.24	■■■□□ 2.59
GOLGA2-208	ENST00000486411	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.21	■■■□□ 2.59
GOLGA2-208	ENST00000486411	NEO1	Q92859	1461 aa		31.17	■■■□□ 2.58
GOLGA2-208	ENST00000486411	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.17	■■■□□ 2.58
GOLGA2-208	ENST00000486411	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
GOLGA2-208	ENST00000486411	KIF14	Q15058	1648 aa		31.16	■■■□□ 2.58
GOLGA2-208	ENST00000486411	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.15	■■■□□ 2.58
GOLGA2-208	ENST00000486411	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.14	■■■□□ 2.57
GOLGA2-208	ENST00000486411	PLCH2	O75038	1416 aa		31.09	■■■□□ 2.57
GOLGA2-208	ENST00000486411	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.06	■■■□□ 2.56
GOLGA2-208	ENST00000486411	FANCA	O15360	1455 aa		31.05	■■■□□ 2.56
GOLGA2-208	ENST00000486411	AKNA	Q7Z591	1439 aa		30.99	■■■□□ 2.55
GOLGA2-208	ENST00000486411	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		30.98	■■■□□ 2.55
GOLGA2-208	ENST00000486411	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		30.98	■■■□□ 2.55
GOLGA2-208	ENST00000486411	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		30.97	■■■□□ 2.55
GOLGA2-208	ENST00000486411	MAP3K1	Q13233	1512 aa		30.95	■■■□□ 2.55
GOLGA2-208	ENST00000486411	TIAM1	Q13009	1591 aa		30.94	■■■□□ 2.54
GOLGA2-208	ENST00000486411	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		30.94	■■■□□ 2.54
GOLGA2-208	ENST00000486411	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	30.91	■■■□□ 2.54
GOLGA2-208	ENST00000486411	PREX2	Q70Z35	1606 aa		30.91	■■■□□ 2.54
GOLGA2-208	ENST00000486411	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		30.88	■■■□□ 2.53
GOLGA2-208	ENST00000486411	ADGRL1	O94910	1474 aa		30.88	■■■□□ 2.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms