RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485341.5

LSP1-216, Transcript of lymphocyte specific protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene LSP1, Length 2,024 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1-216ENST00000485341 ADAMTS12P58397 1594 aa23.84■■□□□ 1.41
LSP1-216ENST00000485341 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.8■■□□□ 1.4
LSP1-216ENST00000485341 ARAP1Q96P48 1450 aa23.79■■□□□ 1.4
LSP1-216ENST00000485341 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.76■■□□□ 1.39
LSP1-216ENST00000485341 P3H3Q8IVL6 736 aa23.75■■□□□ 1.39
LSP1-216ENST00000485341 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.74■■□□□ 1.39
LSP1-216ENST00000485341 FBLN2P98095 1184 aa23.72■■□□□ 1.39
LSP1-216ENST00000485341 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
LSP1-216ENST00000485341 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
LSP1-216ENST00000485341 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
LSP1-216ENST00000485341 GRIN2AQ12879 1464 aa23.68■■□□□ 1.38
LSP1-216ENST00000485341 SYNJ2O15056 1496 aa23.66■■□□□ 1.38
LSP1-216ENST00000485341 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.62■■□□□ 1.37
LSP1-216ENST00000485341 IQGAP2Q13576 1575 aa23.57■■□□□ 1.36
LSP1-216ENST00000485341 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.57■■□□□ 1.36
LSP1-216ENST00000485341 APLP2Q06481 763 aa23.57■■□□□ 1.36
LSP1-216ENST00000485341 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.55■■□□□ 1.36
LSP1-216ENST00000485341 CEP170Q5SW79 1584 aa23.54■■□□□ 1.36
LSP1-216ENST00000485341 SAMD9Q5K651 1589 aa23.53■■□□□ 1.36
LSP1-216ENST00000485341 NUP160Q12769 1436 aa23.49■■□□□ 1.35
LSP1-216ENST00000485341 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
LSP1-216ENST00000485341 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
LSP1-216ENST00000485341 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.45■■□□□ 1.34
LSP1-216ENST00000485341 CHD1O14646 1710 aa23.42■■□□□ 1.34
LSP1-216ENST00000485341 JPH4Q96JJ6 628 aa23.42■■□□□ 1.34
LSP1-216ENST00000485341 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
LSP1-216ENST00000485341 FMN1Q68DA7 1419 aa23.41■■□□□ 1.34
LSP1-216ENST00000485341 DISP1Q96F81 1524 aa23.4■■□□□ 1.34
LSP1-216ENST00000485341 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.38■■□□□ 1.33
LSP1-216ENST00000485341 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
LSP1-216ENST00000485341 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
LSP1-216ENST00000485341 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.34■■□□□ 1.33
LSP1-216ENST00000485341 KIAA0556O60303 1618 aa23.34■■□□□ 1.33
LSP1-216ENST00000485341 TIAM1Q13009 1591 aa23.31■■□□□ 1.32
LSP1-216ENST00000485341 MAP3K1Q13233 1512 aa23.28■■□□□ 1.32
LSP1-216ENST00000485341 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.24■■□□□ 1.31
LSP1-216ENST00000485341 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.24■■□□□ 1.31
LSP1-216ENST00000485341 ARID3CA6NKF2 412 aa23.23■■□□□ 1.31
LSP1-216ENST00000485341 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
LSP1-216ENST00000485341 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.22■■□□□ 1.31
LSP1-216ENST00000485341 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.21■■□□□ 1.31
LSP1-216ENST00000485341 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.14■■□□□ 1.3
LSP1-216ENST00000485341 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.14■■□□□ 1.29
LSP1-216ENST00000485341 SHROOM2Q13796 1616 aa23.13■■□□□ 1.29
LSP1-216ENST00000485341 HECW1Q76N89 1606 aa23.13■■□□□ 1.29
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LSP1-216ENST00000485341 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.11■■□□□ 1.29
LSP1-216ENST00000485341 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
LSP1-216ENST00000485341 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
LSP1-216ENST00000485341 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.1■■□□□ 1.29
LSP1-216ENST00000485341 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.1■■□□□ 1.29
LSP1-216ENST00000485341 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.09■■□□□ 1.29
LSP1-216ENST00000485341 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.09■■□□□ 1.29
LSP1-216ENST00000485341 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
LSP1-216ENST00000485341 PTPRGP23470 1445 aa23.08■■□□□ 1.29
LSP1-216ENST00000485341 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.07■■□□□ 1.28
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LSP1-216ENST00000485341 OSCARQ8IYS5 282 aa23.04■■□□□ 1.28
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LSP1-216ENST00000485341 NCOA2Q15596 1464 aa22.97■■□□□ 1.27
LSP1-216ENST00000485341 ITGAEP38570 1179 aa22.94■■□□□ 1.26
LSP1-216ENST00000485341 ATP10BO94823 1461 aa22.93■■□□□ 1.26
LSP1-216ENST00000485341 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LSP1-216ENST00000485341 UACAQ9BZF9 1416 aa22.92■■□□□ 1.26
LSP1-216ENST00000485341 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
LSP1-216ENST00000485341 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LSP1-216ENST00000485341 ARHGEF11O15085 1522 aa22.88■■□□□ 1.25
LSP1-216ENST00000485341 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.86■■□□□ 1.25
LSP1-216ENST00000485341 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.86■■□□□ 1.25
LSP1-216ENST00000485341 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LSP1-216ENST00000485341 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.84■■□□□ 1.25
LSP1-216ENST00000485341 ABCC2Q92887 1545 aa22.81■■□□□ 1.24
LSP1-216ENST00000485341 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.78■■□□□ 1.24
LSP1-216ENST00000485341 KIF14Q15058 1648 aa22.77■■□□□ 1.24
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LSP1-216ENST00000485341 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.73■■□□□ 1.23
LSP1-216ENST00000485341 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.72■■□□□ 1.23
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LSP1-216ENST00000485341 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
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LSP1-216ENST00000485341 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LSP1-216ENST00000485341 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.7■■□□□ 1.22
LSP1-216ENST00000485341 MIA2Q96PC5 1412 aa22.69■■□□□ 1.22
LSP1-216ENST00000485341 PTPRKQ15262 1439 aa22.69■■□□□ 1.22
LSP1-216ENST00000485341 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.68■■□□□ 1.22
LSP1-216ENST00000485341 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
LSP1-216ENST00000485341 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
LSP1-216ENST00000485341 KCNH8Q96L42 1107 aa22.67■■□□□ 1.22
LSP1-216ENST00000485341 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
LSP1-216ENST00000485341 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
LSP1-216ENST00000485341 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.66■■□□□ 1.22
LSP1-216ENST00000485341 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
LSP1-216ENST00000485341 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.6■■□□□ 1.21
LSP1-216ENST00000485341 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.59■■□□□ 1.21
LSP1-216ENST00000485341 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.59■■□□□ 1.21
LSP1-216ENST00000485341 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.57■■□□□ 1.2
LSP1-216ENST00000485341 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.56■■□□□ 1.2
LSP1-216ENST00000485341 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
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