RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484571.5

VWA3B-215, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 3

Gene VWA3B, Length 717 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-215ENST00000484571 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.33■■■■□ 3.25
VWA3B-215ENST00000484571 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.25
VWA3B-215ENST00000484571 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.32■■■■□ 3.25
VWA3B-215ENST00000484571 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
VWA3B-215ENST00000484571 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.09■■■■□ 3.21
VWA3B-215ENST00000484571 IQGAP2Q13576 1575 aa35■■■■□ 3.19
VWA3B-215ENST00000484571 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.98■■■■□ 3.19
VWA3B-215ENST00000484571 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.87■■■■□ 3.17
VWA3B-215ENST00000484571 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.87■■■■□ 3.17
VWA3B-215ENST00000484571 PTPRGP23470 1445 aa34.87■■■■□ 3.17
VWA3B-215ENST00000484571 PRXQ9BXM0 1461 aa34.86■■■■□ 3.17
VWA3B-215ENST00000484571 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.84■■■■□ 3.17
VWA3B-215ENST00000484571 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.82■■■■□ 3.16
VWA3B-215ENST00000484571 MAPKBP1O60336 1514 aa34.81■■■■□ 3.16
VWA3B-215ENST00000484571 DISP1Q96F81 1524 aa34.79■■■■□ 3.16
VWA3B-215ENST00000484571 EEA1Q15075 1411 aa34.74■■■■□ 3.15
VWA3B-215ENST00000484571 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.7■■■■□ 3.15
VWA3B-215ENST00000484571 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.68■■■■□ 3.14
VWA3B-215ENST00000484571 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.68■■■■□ 3.14
VWA3B-215ENST00000484571 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.68■■■■□ 3.14
VWA3B-215ENST00000484571 KIAA0556O60303 1618 aa34.66■■■■□ 3.14
VWA3B-215ENST00000484571 ABCC2Q92887 1545 aa34.65■■■■□ 3.14
VWA3B-215ENST00000484571 GOLGA3Q08378 1498 aa34.65■■■■□ 3.14
VWA3B-215ENST00000484571 UACAQ9BZF9 1416 aa34.64■■■■□ 3.14
VWA3B-215ENST00000484571 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.62■■■■□ 3.13
VWA3B-215ENST00000484571 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
VWA3B-215ENST00000484571 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.56■■■■□ 3.12
VWA3B-215ENST00000484571 DIP2BQ9P265 1576 aa34.56■■■■□ 3.12
VWA3B-215ENST00000484571 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.49■■■■□ 3.11
VWA3B-215ENST00000484571 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.48■■■■□ 3.11
VWA3B-215ENST00000484571 ASXL2Q76L83 1435 aa34.43■■■■□ 3.1
VWA3B-215ENST00000484571 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.39■■■■□ 3.1
VWA3B-215ENST00000484571 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
VWA3B-215ENST00000484571 GLI2P10070 1586 aa34.36■■■■□ 3.09
VWA3B-215ENST00000484571 ABCA8O94911 1581 aa34.34■■■■□ 3.09
VWA3B-215ENST00000484571 KIF21BO75037 1637 aa34.33■■■■□ 3.09
VWA3B-215ENST00000484571 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
VWA3B-215ENST00000484571 SAMD9Q5K651 1589 aa34.29■■■■□ 3.08
VWA3B-215ENST00000484571 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
VWA3B-215ENST00000484571 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.2■■■■□ 3.07
VWA3B-215ENST00000484571 P3H3Q8IVL6 736 aa34.14■■■■□ 3.06
VWA3B-215ENST00000484571 KDM6BO15054 1643 aa34.12■■■■□ 3.05
VWA3B-215ENST00000484571 TSPOAP1O95153 1857 aa34.12■■■■□ 3.05
VWA3B-215ENST00000484571 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.11■■■■□ 3.05
VWA3B-215ENST00000484571 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.11■■■■□ 3.05
VWA3B-215ENST00000484571 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.07■■■■□ 3.05
VWA3B-215ENST00000484571 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
VWA3B-215ENST00000484571 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.04■■■■□ 3.04
VWA3B-215ENST00000484571 ATP10BO94823 1461 aa34.03■■■■□ 3.04
VWA3B-215ENST00000484571 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34■■■■□ 3.03
VWA3B-215ENST00000484571 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
VWA3B-215ENST00000484571 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.96■■■■□ 3.03
VWA3B-215ENST00000484571 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.95■■■■□ 3.03
VWA3B-215ENST00000484571 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
VWA3B-215ENST00000484571 CD109Q6YHK3 1445 aa33.93■■■■□ 3.02
VWA3B-215ENST00000484571 KCNH8Q96L42 1107 aa33.92■■■■□ 3.02
VWA3B-215ENST00000484571 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
VWA3B-215ENST00000484571 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
VWA3B-215ENST00000484571 ARID3CA6NKF2 412 aa33.84■■■■□ 3.01
VWA3B-215ENST00000484571 FMN1Q68DA7 1419 aa33.81■■■■□ 3
VWA3B-215ENST00000484571 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
VWA3B-215ENST00000484571 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
VWA3B-215ENST00000484571 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
VWA3B-215ENST00000484571 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.79■■■■□ 3
VWA3B-215ENST00000484571 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.78■■■■□ 3
VWA3B-215ENST00000484571 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.75■■■□□ 2.99
VWA3B-215ENST00000484571 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.74■■■□□ 2.99
VWA3B-215ENST00000484571 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.73■■■□□ 2.99
VWA3B-215ENST00000484571 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.66■■■□□ 2.98
VWA3B-215ENST00000484571 HECW1Q76N89 1606 aa33.64■■■□□ 2.98
VWA3B-215ENST00000484571 NEO1Q92859 1461 aa33.63■■■□□ 2.97
VWA3B-215ENST00000484571 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
VWA3B-215ENST00000484571 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
VWA3B-215ENST00000484571 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.53■■■□□ 2.96
VWA3B-215ENST00000484571 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.51■■■□□ 2.95
VWA3B-215ENST00000484571 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
VWA3B-215ENST00000484571 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.45■■■□□ 2.95
VWA3B-215ENST00000484571 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.45■■■□□ 2.95
VWA3B-215ENST00000484571 CLIP1P30622 1438 aa33.43■■■□□ 2.94
VWA3B-215ENST00000484571 ADGRL1O94910 1474 aa33.42■■■□□ 2.94
VWA3B-215ENST00000484571 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.42■■■□□ 2.94
VWA3B-215ENST00000484571 FANCAO15360 1455 aa33.41■■■□□ 2.94
VWA3B-215ENST00000484571 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.41■■■□□ 2.94
VWA3B-215ENST00000484571 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
VWA3B-215ENST00000484571 AKNAQ7Z591 1439 aa33.38■■■□□ 2.93
VWA3B-215ENST00000484571 PLCH2O75038 1416 aa33.37■■■□□ 2.93
VWA3B-215ENST00000484571 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.36■■■□□ 2.93
VWA3B-215ENST00000484571 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
VWA3B-215ENST00000484571 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
VWA3B-215ENST00000484571 KIF14Q15058 1648 aa33.33■■■□□ 2.93
VWA3B-215ENST00000484571 RAPGEF3O95398 923 aa33.33■■■□□ 2.93
VWA3B-215ENST00000484571 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.3■■■□□ 2.92
VWA3B-215ENST00000484571 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.28■■■□□ 2.92
VWA3B-215ENST00000484571 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.24■■■□□ 2.91
VWA3B-215ENST00000484571 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.24■■■□□ 2.91
VWA3B-215ENST00000484571 RICTORQ6R327 1708 aa33.23■■■□□ 2.91
VWA3B-215ENST00000484571 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.21■■■□□ 2.91
VWA3B-215ENST00000484571 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.19■■■□□ 2.9
VWA3B-215ENST00000484571 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.17■■■□□ 2.9
VWA3B-215ENST00000484571 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms