RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482821.5

MRPS5-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene MRPS5, Length 3,680 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS5-208	ENST00000482821	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPS5-208	ENST00000482821	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
MRPS5-208	ENST00000482821	CUL7	Q14999	1698 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPS5-208	ENST00000482821	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		13.89	□□□□□ -0.19
MRPS5-208	ENST00000482821	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPS5-208	ENST00000482821	ARID3C	A6NKF2	412 aa		13.88	□□□□□ -0.19
MRPS5-208	ENST00000482821	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
MRPS5-208	ENST00000482821	WDR62	O43379	1518 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MRPS5-208	ENST00000482821	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MRPS5-208	ENST00000482821	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
MRPS5-208	ENST00000482821	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MRPS5-208	ENST00000482821	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		13.82	□□□□□ -0.2
MRPS5-208	ENST00000482821	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
MRPS5-208	ENST00000482821	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MRPS5-208	ENST00000482821	WDR97	A6NE52	1622 aa		13.79	□□□□□ -0.2
MRPS5-208	ENST00000482821	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MRPS5-208	ENST00000482821	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MRPS5-208	ENST00000482821	PBRM1	Q86U86	1689 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MRPS5-208	ENST00000482821	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MRPS5-208	ENST00000482821	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MRPS5-208	ENST00000482821	ADAMTS12	P58397	1594 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MRPS5-208	ENST00000482821	JPH4	Q96JJ6	628 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MRPS5-208	ENST00000482821	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MRPS5-208	ENST00000482821	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MRPS5-208	ENST00000482821	GRIN2A	Q12879	1464 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MRPS5-208	ENST00000482821	IQGAP2	Q13576	1575 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MRPS5-208	ENST00000482821	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
MRPS5-208	ENST00000482821	SYNJ2	O15056	1496 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MRPS5-208	ENST00000482821	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MRPS5-208	ENST00000482821	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.68	□□□□□ -0.22
MRPS5-208	ENST00000482821	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MRPS5-208	ENST00000482821	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		13.67	□□□□□ -0.22
MRPS5-208	ENST00000482821	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.66	□□□□□ -0.22
MRPS5-208	ENST00000482821	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
MRPS5-208	ENST00000482821	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MRPS5-208	ENST00000482821	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.64	□□□□□ -0.23
MRPS5-208	ENST00000482821	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MRPS5-208	ENST00000482821	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MRPS5-208	ENST00000482821	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MRPS5-208	ENST00000482821	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MRPS5-208	ENST00000482821	SAMD9	Q5K651	1589 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPS5-208	ENST00000482821	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MRPS5-208	ENST00000482821	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MRPS5-208	ENST00000482821	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MRPS5-208	ENST00000482821	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MRPS5-208	ENST00000482821	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MRPS5-208	ENST00000482821	PTPRG	P23470	1445 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MRPS5-208	ENST00000482821	CEP170	Q5SW79	1584 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	NUP160	Q12769	1436 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	DISP1	Q96F81	1524 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	KIAA0556	O60303	1618 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.49	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	TRIM52	Q96A61	297 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		13.48	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		13.47	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	KCNH8	Q96L42	1107 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.46	□□□□□ -0.25
MRPS5-208	ENST00000482821	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.45	□□□□□ -0.26
MRPS5-208	ENST00000482821	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPS5-208	ENST00000482821	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPS5-208	ENST00000482821	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		13.44	□□□□□ -0.26
MRPS5-208	ENST00000482821	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		13.43	□□□□□ -0.26
MRPS5-208	ENST00000482821	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
MRPS5-208	ENST00000482821	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		13.41	□□□□□ -0.26
MRPS5-208	ENST00000482821	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
MRPS5-208	ENST00000482821	CHD1	O14646	1710 aa		13.4	□□□□□ -0.26
MRPS5-208	ENST00000482821	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.27
MRPS5-208	ENST00000482821	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
MRPS5-208	ENST00000482821	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MRPS5-208	ENST00000482821	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MRPS5-208	ENST00000482821	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MRPS5-208	ENST00000482821	TSPY4	P0CV99	314 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MRPS5-208	ENST00000482821	TSPY10	P0CW01	314 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MRPS5-208	ENST00000482821	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MRPS5-208	ENST00000482821	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MRPS5-208	ENST00000482821	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
MRPS5-208	ENST00000482821	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MRPS5-208	ENST00000482821	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MRPS5-208	ENST00000482821	ATP10B	O94823	1461 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MRPS5-208	ENST00000482821	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MRPS5-208	ENST00000482821	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MRPS5-208	ENST00000482821	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
MRPS5-208	ENST00000482821	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MRPS5-208	ENST00000482821	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.28	□□□□□ -0.28	7e-6	■■■■□ 20.2
MRPS5-208	ENST00000482821	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
MRPS5-208	ENST00000482821	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
MRPS5-208	ENST00000482821	ABCA8	O94911	1581 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MRPS5-208	ENST00000482821	ARHGEF11	O15085	1522 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MRPS5-208	ENST00000482821	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MRPS5-208	ENST00000482821	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MRPS5-208	ENST00000482821	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MRPS5-208	ENST00000482821	HFM1	A2PYH4	1435 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MRPS5-208	ENST00000482821	KIF14	Q15058	1648 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MRPS5-208	ENST00000482821	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.23	□□□□□ -0.29

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