RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481800.1

COL9A3-212, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 4

Gene COL9A3, Length 548 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-212ENST00000481800 SHROOM2Q13796 1616 aa30.13■■■□□ 2.41
COL9A3-212ENST00000481800 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
COL9A3-212ENST00000481800 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.06■■■□□ 2.4
COL9A3-212ENST00000481800 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.05■■■□□ 2.4
COL9A3-212ENST00000481800 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.89■■■□□ 2.38
COL9A3-212ENST00000481800 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.81■■■□□ 2.36
COL9A3-212ENST00000481800 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.79■■■□□ 2.36
COL9A3-212ENST00000481800 IQGAP2Q13576 1575 aa29.77■■■□□ 2.36
COL9A3-212ENST00000481800 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
COL9A3-212ENST00000481800 PTPRGP23470 1445 aa29.74■■■□□ 2.35
COL9A3-212ENST00000481800 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.72■■■□□ 2.35
COL9A3-212ENST00000481800 PRXQ9BXM0 1461 aa29.65■■■□□ 2.34
COL9A3-212ENST00000481800 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.63■■■□□ 2.33
COL9A3-212ENST00000481800 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.62■■■□□ 2.33
COL9A3-212ENST00000481800 DISP1Q96F81 1524 aa29.61■■■□□ 2.33
COL9A3-212ENST00000481800 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.61■■■□□ 2.33
COL9A3-212ENST00000481800 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.55■■■□□ 2.32
COL9A3-212ENST00000481800 MAPKBP1O60336 1514 aa29.54■■■□□ 2.32
COL9A3-212ENST00000481800 EEA1Q15075 1411 aa29.54■■■□□ 2.32
COL9A3-212ENST00000481800 UACAQ9BZF9 1416 aa29.51■■■□□ 2.31
COL9A3-212ENST00000481800 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.5■■■□□ 2.31
COL9A3-212ENST00000481800 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
COL9A3-212ENST00000481800 KIAA0556O60303 1618 aa29.48■■■□□ 2.31
COL9A3-212ENST00000481800 GOLGA3Q08378 1498 aa29.48■■■□□ 2.31
COL9A3-212ENST00000481800 ABCC2Q92887 1545 aa29.47■■■□□ 2.31
COL9A3-212ENST00000481800 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.47■■■□□ 2.31
COL9A3-212ENST00000481800 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.45■■■□□ 2.31
COL9A3-212ENST00000481800 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.42■■■□□ 2.3
COL9A3-212ENST00000481800 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.38■■■□□ 2.29
COL9A3-212ENST00000481800 DIP2BQ9P265 1576 aa29.37■■■□□ 2.29
COL9A3-212ENST00000481800 ASXL2Q76L83 1435 aa29.35■■■□□ 2.29
COL9A3-212ENST00000481800 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.34■■■□□ 2.29
COL9A3-212ENST00000481800 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.31■■■□□ 2.28
COL9A3-212ENST00000481800 P3H3Q8IVL6 736 aa29.31■■■□□ 2.28
COL9A3-212ENST00000481800 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
COL9A3-212ENST00000481800 ABCA8O94911 1581 aa29.19■■■□□ 2.26
COL9A3-212ENST00000481800 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
COL9A3-212ENST00000481800 KIF21BO75037 1637 aa29.16■■■□□ 2.26
COL9A3-212ENST00000481800 GLI2P10070 1586 aa29.15■■■□□ 2.26
COL9A3-212ENST00000481800 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.15■■■□□ 2.26
COL9A3-212ENST00000481800 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
COL9A3-212ENST00000481800 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
COL9A3-212ENST00000481800 SAMD9Q5K651 1589 aa29.12■■■□□ 2.25
COL9A3-212ENST00000481800 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.11■■■□□ 2.25
COL9A3-212ENST00000481800 ARID3CA6NKF2 412 aa29.1■■■□□ 2.25
COL9A3-212ENST00000481800 TSPOAP1O95153 1857 aa29.09■■■□□ 2.25
COL9A3-212ENST00000481800 KCNH8Q96L42 1107 aa29.08■■■□□ 2.25
COL9A3-212ENST00000481800 KDM6BO15054 1643 aa29.05■■■□□ 2.24
COL9A3-212ENST00000481800 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.04■■■□□ 2.24
COL9A3-212ENST00000481800 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
COL9A3-212ENST00000481800 ATP10BO94823 1461 aa29■■■□□ 2.23
COL9A3-212ENST00000481800 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
COL9A3-212ENST00000481800 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
COL9A3-212ENST00000481800 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.98■■■□□ 2.23
COL9A3-212ENST00000481800 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.98■■■□□ 2.23
COL9A3-212ENST00000481800 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.96■■■□□ 2.23
COL9A3-212ENST00000481800 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.95■■■□□ 2.23
COL9A3-212ENST00000481800 CD109Q6YHK3 1445 aa28.94■■■□□ 2.22
COL9A3-212ENST00000481800 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
COL9A3-212ENST00000481800 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
COL9A3-212ENST00000481800 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.84■■■□□ 2.21
COL9A3-212ENST00000481800 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.82■■■□□ 2.2
COL9A3-212ENST00000481800 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.82■■■□□ 2.2
COL9A3-212ENST00000481800 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
COL9A3-212ENST00000481800 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.78■■■□□ 2.2
COL9A3-212ENST00000481800 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
COL9A3-212ENST00000481800 FMN1Q68DA7 1419 aa28.77■■■□□ 2.2
COL9A3-212ENST00000481800 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.7■■■□□ 2.19
COL9A3-212ENST00000481800 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.66■■■□□ 2.18
COL9A3-212ENST00000481800 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
COL9A3-212ENST00000481800 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.63■■■□□ 2.17
COL9A3-212ENST00000481800 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
COL9A3-212ENST00000481800 HECW1Q76N89 1606 aa28.61■■■□□ 2.17
COL9A3-212ENST00000481800 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.6■■■□□ 2.17
COL9A3-212ENST00000481800 NEO1Q92859 1461 aa28.59■■■□□ 2.17
COL9A3-212ENST00000481800 CLIP1P30622 1438 aa28.53■■■□□ 2.16
COL9A3-212ENST00000481800 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
COL9A3-212ENST00000481800 RAPGEF3O95398 923 aa28.52■■■□□ 2.16
COL9A3-212ENST00000481800 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.48■■■□□ 2.15
COL9A3-212ENST00000481800 ADGRL1O94910 1474 aa28.47■■■□□ 2.15
COL9A3-212ENST00000481800 FANCAO15360 1455 aa28.46■■■□□ 2.15
COL9A3-212ENST00000481800 AKNAQ7Z591 1439 aa28.46■■■□□ 2.15
COL9A3-212ENST00000481800 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.45■■■□□ 2.15
COL9A3-212ENST00000481800 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
COL9A3-212ENST00000481800 PLCH2O75038 1416 aa28.42■■■□□ 2.14
COL9A3-212ENST00000481800 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
COL9A3-212ENST00000481800 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.41■■■□□ 2.14
COL9A3-212ENST00000481800 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
COL9A3-212ENST00000481800 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.4■■■□□ 2.14
COL9A3-212ENST00000481800 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.38■■■□□ 2.13
COL9A3-212ENST00000481800 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.37■■■□□ 2.13
COL9A3-212ENST00000481800 KIF14Q15058 1648 aa28.36■■■□□ 2.13
COL9A3-212ENST00000481800 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.32■■■□□ 2.12
COL9A3-212ENST00000481800 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.3■■■□□ 2.12
COL9A3-212ENST00000481800 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.29■■■□□ 2.12
COL9A3-212ENST00000481800 CEP162Q5TB80 1403 aa28.29■■■□□ 2.12
COL9A3-212ENST00000481800 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
COL9A3-212ENST00000481800 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.25■■■□□ 2.11
COL9A3-212ENST00000481800 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.25■■■□□ 2.11
COL9A3-212ENST00000481800 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 160.8 ms