RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.21■■■□□ 2.75
CLK1-211ENST00000481641 CUL7Q14999 1698 aa32.15■■■□□ 2.74
CLK1-211ENST00000481641 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.08■■■□□ 2.73
CLK1-211ENST00000481641 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.07■■■□□ 2.72
CLK1-211ENST00000481641 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.86■■■□□ 2.69
CLK1-211ENST00000481641 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
CLK1-211ENST00000481641 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.82■■■□□ 2.68
CLK1-211ENST00000481641 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.82■■■□□ 2.68
CLK1-211ENST00000481641 IQGAP2Q13576 1575 aa31.8■■■□□ 2.68
CLK1-211ENST00000481641 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.79■■■□□ 2.68
CLK1-211ENST00000481641 PTPRGP23470 1445 aa31.77■■■□□ 2.68
CLK1-211ENST00000481641 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.74■■■□□ 2.67
CLK1-211ENST00000481641 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.72■■■□□ 2.67
CLK1-211ENST00000481641 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.71■■■□□ 2.67
CLK1-211ENST00000481641 MAPKBP1O60336 1514 aa31.71■■■□□ 2.67
CLK1-211ENST00000481641 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.7■■■□□ 2.66
CLK1-211ENST00000481641 DISP1Q96F81 1524 aa31.66■■■□□ 2.66
CLK1-211ENST00000481641 DIP2BQ9P265 1576 aa31.63■■■□□ 2.65
CLK1-211ENST00000481641 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.59■■■□□ 2.65
CLK1-211ENST00000481641 ABCC2Q92887 1545 aa31.54■■■□□ 2.64
CLK1-211ENST00000481641 UACAQ9BZF9 1416 aa31.52■■■□□ 2.64
CLK1-211ENST00000481641 KIAA0556O60303 1618 aa31.52■■■□□ 2.64
CLK1-211ENST00000481641 PRXQ9BXM0 1461 aa31.52■■■□□ 2.64
CLK1-211ENST00000481641 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.51■■■□□ 2.63
CLK1-211ENST00000481641 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.49■■■□□ 2.63
CLK1-211ENST00000481641 TSPOAP1O95153 1857 aa31.46■■■□□ 2.63
CLK1-211ENST00000481641 ASXL2Q76L83 1435 aa31.45■■■□□ 2.63
CLK1-211ENST00000481641 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
CLK1-211ENST00000481641 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.39■■■□□ 2.62
CLK1-211ENST00000481641 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.37■■■□□ 2.61
CLK1-211ENST00000481641 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.36■■■□□ 2.61
CLK1-211ENST00000481641 GOLGA3Q08378 1498 aa31.33■■■□□ 2.61
CLK1-211ENST00000481641 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CLK1-211ENST00000481641 KDM6BO15054 1643 aa31.29■■■□□ 2.6
CLK1-211ENST00000481641 GLI2P10070 1586 aa31.29■■■□□ 2.6
CLK1-211ENST00000481641 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
CLK1-211ENST00000481641 P3H3Q8IVL6 736 aa31.25■■■□□ 2.59
CLK1-211ENST00000481641 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CLK1-211ENST00000481641 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
CLK1-211ENST00000481641 ABCA8O94911 1581 aa31.22■■■□□ 2.59
CLK1-211ENST00000481641 EEA1Q15075 1411 aa31.16■■■□□ 2.58
CLK1-211ENST00000481641 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.15■■■□□ 2.58
CLK1-211ENST00000481641 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.14■■■□□ 2.58
CLK1-211ENST00000481641 ARID3CA6NKF2 412 aa31.11■■■□□ 2.57
CLK1-211ENST00000481641 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
CLK1-211ENST00000481641 KCNH8Q96L42 1107 aa31.09■■■□□ 2.57
CLK1-211ENST00000481641 SAMD9Q5K651 1589 aa31.07■■■□□ 2.56
CLK1-211ENST00000481641 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
CLK1-211ENST00000481641 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.01■■■□□ 2.55
CLK1-211ENST00000481641 CHIC1Q5VXU3 224 aa31■■■□□ 2.55
CLK1-211ENST00000481641 ATP10BO94823 1461 aa30.99■■■□□ 2.55
CLK1-211ENST00000481641 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.97■■■□□ 2.55
CLK1-211ENST00000481641 CD109Q6YHK3 1445 aa30.96■■■□□ 2.55
CLK1-211ENST00000481641 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.95■■■□□ 2.55
CLK1-211ENST00000481641 KIF21BO75037 1637 aa30.95■■■□□ 2.54
CLK1-211ENST00000481641 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.94■■■□□ 2.54
CLK1-211ENST00000481641 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.93■■■□□ 2.54
CLK1-211ENST00000481641 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.92■■■□□ 2.54
CLK1-211ENST00000481641 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.88■■■□□ 2.53
CLK1-211ENST00000481641 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
CLK1-211ENST00000481641 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
CLK1-211ENST00000481641 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.53
CLK1-211ENST00000481641 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
CLK1-211ENST00000481641 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.76■■■□□ 2.51
CLK1-211ENST00000481641 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.74■■■□□ 2.51
CLK1-211ENST00000481641 ADGRL1O94910 1474 aa30.73■■■□□ 2.51
CLK1-211ENST00000481641 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.65■■■□□ 2.5
CLK1-211ENST00000481641 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.64■■■□□ 2.5
CLK1-211ENST00000481641 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.6■■■□□ 2.49
CLK1-211ENST00000481641 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CLK1-211ENST00000481641 RAPGEF3O95398 923 aa30.57■■■□□ 2.48
CLK1-211ENST00000481641 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
CLK1-211ENST00000481641 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.56■■■□□ 2.48
CLK1-211ENST00000481641 NEO1Q92859 1461 aa30.55■■■□□ 2.48
CLK1-211ENST00000481641 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.52■■■□□ 2.48
CLK1-211ENST00000481641 FMN1Q68DA7 1419 aa30.5■■■□□ 2.47
CLK1-211ENST00000481641 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.48■■■□□ 2.47
CLK1-211ENST00000481641 HECW1Q76N89 1606 aa30.45■■■□□ 2.47
CLK1-211ENST00000481641 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.45■■■□□ 2.46
CLK1-211ENST00000481641 AKNAQ7Z591 1439 aa30.42■■■□□ 2.46
CLK1-211ENST00000481641 FANCAO15360 1455 aa30.41■■■□□ 2.46
CLK1-211ENST00000481641 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CLK1-211ENST00000481641 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.34■■■□□ 2.45
CLK1-211ENST00000481641 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.33■■■□□ 2.45
CLK1-211ENST00000481641 RICTORQ6R327 1708 aa30.33■■■□□ 2.45
CLK1-211ENST00000481641 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
CLK1-211ENST00000481641 PLCH2O75038 1416 aa30.3■■■□□ 2.44
CLK1-211ENST00000481641 KIF14Q15058 1648 aa30.29■■■□□ 2.44
CLK1-211ENST00000481641 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.44
CLK1-211ENST00000481641 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
CLK1-211ENST00000481641 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
CLK1-211ENST00000481641 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.24■■■□□ 2.43
CLK1-211ENST00000481641 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.24■■■□□ 2.43
CLK1-211ENST00000481641 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.23■■■□□ 2.43
CLK1-211ENST00000481641 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.23■■■□□ 2.43
CLK1-211ENST00000481641 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.22■■■□□ 2.43
CLK1-211ENST00000481641 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.22■■■□□ 2.43
CLK1-211ENST00000481641 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.2■■■□□ 2.43
CLK1-211ENST00000481641 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.19■■■□□ 2.42
CLK1-211ENST00000481641 CLIP1P30622 1438 aa30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms