RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481605.5

TTC3-217, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTC3, Length 1,540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-217ENST00000481605 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.65■■■■■ 4.1
TTC3-217ENST00000481605 CUL7Q14999 1698 aa40.63■■■■■ 4.09
TTC3-217ENST00000481605 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.49■■■■■ 4.07
TTC3-217ENST00000481605 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.49■■■■■ 4.07
TTC3-217ENST00000481605 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.15■■■■■ 4.02
TTC3-217ENST00000481605 IQGAP2Q13576 1575 aa40.14■■■■■ 4.02
TTC3-217ENST00000481605 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.14■■■■■ 4.02
TTC3-217ENST00000481605 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.13■■■■■ 4.01
TTC3-217ENST00000481605 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.09■■■■■ 4.01
TTC3-217ENST00000481605 PTPRGP23470 1445 aa40.07■■■■■ 4
TTC3-217ENST00000481605 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
TTC3-217ENST00000481605 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.03■■■■■ 4
TTC3-217ENST00000481605 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.02■■■■■ 4
TTC3-217ENST00000481605 MAPKBP1O60336 1514 aa40.01■■■■■ 4
TTC3-217ENST00000481605 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.95■■■■□ 3.99
TTC3-217ENST00000481605 DISP1Q96F81 1524 aa39.93■■■■□ 3.98
TTC3-217ENST00000481605 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.93■■■■□ 3.98
TTC3-217ENST00000481605 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.9■■■■□ 3.98
TTC3-217ENST00000481605 DIP2BQ9P265 1576 aa39.85■■■■□ 3.97
TTC3-217ENST00000481605 PRXQ9BXM0 1461 aa39.81■■■■□ 3.96
TTC3-217ENST00000481605 ABCC2Q92887 1545 aa39.8■■■■□ 3.96
TTC3-217ENST00000481605 KIAA0556O60303 1618 aa39.77■■■■□ 3.96
TTC3-217ENST00000481605 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.77■■■■□ 3.96
TTC3-217ENST00000481605 UACAQ9BZF9 1416 aa39.77■■■■□ 3.96
TTC3-217ENST00000481605 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.76■■■■□ 3.95
TTC3-217ENST00000481605 ASXL2Q76L83 1435 aa39.64■■■■□ 3.94
TTC3-217ENST00000481605 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.6■■■■□ 3.93
TTC3-217ENST00000481605 GOLGA3Q08378 1498 aa39.6■■■■□ 3.93
TTC3-217ENST00000481605 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.6■■■■□ 3.93
TTC3-217ENST00000481605 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.58■■■■□ 3.93
TTC3-217ENST00000481605 TSPOAP1O95153 1857 aa39.55■■■■□ 3.92
TTC3-217ENST00000481605 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
TTC3-217ENST00000481605 EEA1Q15075 1411 aa39.47■■■■□ 3.91
TTC3-217ENST00000481605 GLI2P10070 1586 aa39.47■■■■□ 3.91
TTC3-217ENST00000481605 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
TTC3-217ENST00000481605 KDM6BO15054 1643 aa39.43■■■■□ 3.9
TTC3-217ENST00000481605 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
TTC3-217ENST00000481605 ABCA8O94911 1581 aa39.38■■■■□ 3.9
TTC3-217ENST00000481605 P3H3Q8IVL6 736 aa39.35■■■■□ 3.89
TTC3-217ENST00000481605 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
TTC3-217ENST00000481605 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.88
TTC3-217ENST00000481605 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.31■■■■□ 3.88
TTC3-217ENST00000481605 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.26■■■■□ 3.88
TTC3-217ENST00000481605 SAMD9Q5K651 1589 aa39.24■■■■□ 3.87
TTC3-217ENST00000481605 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.15■■■■□ 3.86
TTC3-217ENST00000481605 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.15■■■■□ 3.86
TTC3-217ENST00000481605 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.15■■■■□ 3.86
TTC3-217ENST00000481605 KCNH8Q96L42 1107 aa39.14■■■■□ 3.86
TTC3-217ENST00000481605 ARID3CA6NKF2 412 aa39.13■■■■□ 3.85
TTC3-217ENST00000481605 KIF21BO75037 1637 aa39.12■■■■□ 3.85
TTC3-217ENST00000481605 ATP10BO94823 1461 aa39.08■■■■□ 3.85
TTC3-217ENST00000481605 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
TTC3-217ENST00000481605 CD109Q6YHK3 1445 aa39.04■■■■□ 3.84
TTC3-217ENST00000481605 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.02■■■■□ 3.84
TTC3-217ENST00000481605 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.01■■■■□ 3.84
TTC3-217ENST00000481605 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.01■■■■□ 3.84
TTC3-217ENST00000481605 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.98■■■■□ 3.83
TTC3-217ENST00000481605 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.94■■■■□ 3.82
TTC3-217ENST00000481605 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.92■■■■□ 3.82
TTC3-217ENST00000481605 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.91■■■■□ 3.82
TTC3-217ENST00000481605 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
TTC3-217ENST00000481605 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
TTC3-217ENST00000481605 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
TTC3-217ENST00000481605 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.88■■■■□ 3.81
TTC3-217ENST00000481605 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.79■■■■□ 3.8
TTC3-217ENST00000481605 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.68■■■■□ 3.78
TTC3-217ENST00000481605 ADGRL1O94910 1474 aa38.67■■■■□ 3.78
TTC3-217ENST00000481605 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.66■■■■□ 3.78
TTC3-217ENST00000481605 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.64■■■■□ 3.78
TTC3-217ENST00000481605 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.62■■■■□ 3.77
TTC3-217ENST00000481605 FMN1Q68DA7 1419 aa38.58■■■■□ 3.77
TTC3-217ENST00000481605 NEO1Q92859 1461 aa38.56■■■■□ 3.76
TTC3-217ENST00000481605 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
TTC3-217ENST00000481605 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
TTC3-217ENST00000481605 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.49■■■■□ 3.758e-9■■■■□ 23.3
TTC3-217ENST00000481605 RAPGEF3O95398 923 aa38.48■■■■□ 3.75
TTC3-217ENST00000481605 HECW1Q76N89 1606 aa38.47■■■■□ 3.75
TTC3-217ENST00000481605 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.42■■■■□ 3.74
TTC3-217ENST00000481605 FANCAO15360 1455 aa38.38■■■■□ 3.73
TTC3-217ENST00000481605 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.36■■■■□ 3.73
TTC3-217ENST00000481605 AKNAQ7Z591 1439 aa38.35■■■■□ 3.73
TTC3-217ENST00000481605 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.33■■■■□ 3.73
TTC3-217ENST00000481605 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.33■■■■□ 3.73
TTC3-217ENST00000481605 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
TTC3-217ENST00000481605 PLCH2O75038 1416 aa38.26■■■■□ 3.71
TTC3-217ENST00000481605 RICTORQ6R327 1708 aa38.23■■■■□ 3.71
TTC3-217ENST00000481605 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.23■■■■□ 3.71
TTC3-217ENST00000481605 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
TTC3-217ENST00000481605 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.2■■■■□ 3.71
TTC3-217ENST00000481605 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
TTC3-217ENST00000481605 KIF14Q15058 1648 aa38.19■■■■□ 3.7
TTC3-217ENST00000481605 CLIP1P30622 1438 aa38.17■■■■□ 3.7
TTC3-217ENST00000481605 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.14■■■■□ 3.7
TTC3-217ENST00000481605 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.14■■■■□ 3.7
TTC3-217ENST00000481605 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
TTC3-217ENST00000481605 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.12■■■■□ 3.69
TTC3-217ENST00000481605 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.12■■■■□ 3.69
TTC3-217ENST00000481605 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.12■■■■□ 3.69
TTC3-217ENST00000481605 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.1■■■■□ 3.69
TTC3-217ENST00000481605 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.08■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7 ms