RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481348.5

ABCD4-210, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,177 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-210ENST00000481348 JPH4Q96JJ6 628 aa23.23■■□□□ 1.31
ABCD4-210ENST00000481348 CUL7Q14999 1698 aa23.19■■□□□ 1.3
ABCD4-210ENST00000481348 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ABCD4-210ENST00000481348 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.17■■□□□ 1.3
ABCD4-210ENST00000481348 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.14■■□□□ 1.29
ABCD4-210ENST00000481348 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.11■■□□□ 1.29
ABCD4-210ENST00000481348 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-210ENST00000481348 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-210ENST00000481348 IQGAP2Q13576 1575 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCD4-210ENST00000481348 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-210ENST00000481348 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.87■■□□□ 1.25
ABCD4-210ENST00000481348 PTPRGP23470 1445 aa22.87■■□□□ 1.25
ABCD4-210ENST00000481348 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-210ENST00000481348 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.84■■□□□ 1.25
ABCD4-210ENST00000481348 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-210ENST00000481348 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-210ENST00000481348 MAPKBP1O60336 1514 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-210ENST00000481348 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-210ENST00000481348 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-210ENST00000481348 DISP1Q96F81 1524 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-210ENST00000481348 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-210ENST00000481348 PRXQ9BXM0 1461 aa22.73■■□□□ 1.23
ABCD4-210ENST00000481348 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.71■■□□□ 1.23
ABCD4-210ENST00000481348 UACAQ9BZF9 1416 aa22.7■■□□□ 1.22
ABCD4-210ENST00000481348 ABCC2Q92887 1545 aa22.7■■□□□ 1.22
ABCD4-210ENST00000481348 DIP2BQ9P265 1576 aa22.7■■□□□ 1.22
ABCD4-210ENST00000481348 KIAA0556O60303 1618 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-210ENST00000481348 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.69■■□□□ 1.22
ABCD4-210ENST00000481348 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.66■■□□□ 1.22
ABCD4-210ENST00000481348 GOLGA3Q08378 1498 aa22.63■■□□□ 1.21
ABCD4-210ENST00000481348 ASXL2Q76L83 1435 aa22.61■■□□□ 1.21
ABCD4-210ENST00000481348 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.6■■□□□ 1.21
ABCD4-210ENST00000481348 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.58■■□□□ 1.21
ABCD4-210ENST00000481348 EEA1Q15075 1411 aa22.57■■□□□ 1.2
ABCD4-210ENST00000481348 TSPOAP1O95153 1857 aa22.57■■□□□ 1.2
ABCD4-210ENST00000481348 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-210ENST00000481348 GLI2P10070 1586 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-210ENST00000481348 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-210ENST00000481348 ABCA8O94911 1581 aa22.47■■□□□ 1.19
ABCD4-210ENST00000481348 P3H3Q8IVL6 736 aa22.47■■□□□ 1.19
ABCD4-210ENST00000481348 KDM6BO15054 1643 aa22.46■■□□□ 1.19
ABCD4-210ENST00000481348 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ABCD4-210ENST00000481348 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.42■■□□□ 1.18
ABCD4-210ENST00000481348 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
ABCD4-210ENST00000481348 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ABCD4-210ENST00000481348 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.39■■□□□ 1.18
ABCD4-210ENST00000481348 SAMD9Q5K651 1589 aa22.39■■□□□ 1.18
ABCD4-210ENST00000481348 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
ABCD4-210ENST00000481348 KIF21BO75037 1637 aa22.35■■□□□ 1.17
ABCD4-210ENST00000481348 KCNH8Q96L42 1107 aa22.35■■□□□ 1.17
ABCD4-210ENST00000481348 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.34■■□□□ 1.17
ABCD4-210ENST00000481348 ARID3CA6NKF2 412 aa22.32■■□□□ 1.16
ABCD4-210ENST00000481348 ATP10BO94823 1461 aa22.31■■□□□ 1.16
ABCD4-210ENST00000481348 CD109Q6YHK3 1445 aa22.28■■□□□ 1.16
ABCD4-210ENST00000481348 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.28■■□□□ 1.16
ABCD4-210ENST00000481348 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCD4-210ENST00000481348 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.26■■□□□ 1.15
ABCD4-210ENST00000481348 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-210ENST00000481348 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ABCD4-210ENST00000481348 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-210ENST00000481348 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.24■■□□□ 1.15
ABCD4-210ENST00000481348 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-210ENST00000481348 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ABCD4-210ENST00000481348 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.22■■□□□ 1.15
ABCD4-210ENST00000481348 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ABCD4-210ENST00000481348 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.17■■□□□ 1.14
ABCD4-210ENST00000481348 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.13■■□□□ 1.13
ABCD4-210ENST00000481348 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCD4-210ENST00000481348 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.07■■□□□ 1.12
ABCD4-210ENST00000481348 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.06■■□□□ 1.12
ABCD4-210ENST00000481348 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.06■■□□□ 1.12
ABCD4-210ENST00000481348 FMN1Q68DA7 1419 aa22.05■■□□□ 1.12
ABCD4-210ENST00000481348 ADGRL1O94910 1474 aa22.03■■□□□ 1.12
ABCD4-210ENST00000481348 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-210ENST00000481348 NEO1Q92859 1461 aa22.02■■□□□ 1.12
ABCD4-210ENST00000481348 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ABCD4-210ENST00000481348 HECW1Q76N89 1606 aa21.97■■□□□ 1.11
ABCD4-210ENST00000481348 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
ABCD4-210ENST00000481348 RAPGEF3O95398 923 aa21.95■■□□□ 1.1
ABCD4-210ENST00000481348 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ABCD4-210ENST00000481348 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.91■■□□□ 1.1
ABCD4-210ENST00000481348 FANCAO15360 1455 aa21.9■■□□□ 1.1
ABCD4-210ENST00000481348 AKNAQ7Z591 1439 aa21.89■■□□□ 1.1
ABCD4-210ENST00000481348 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.89■■□□□ 1.09
ABCD4-210ENST00000481348 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-210ENST00000481348 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-210ENST00000481348 PLCH2O75038 1416 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-210ENST00000481348 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-210ENST00000481348 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-210ENST00000481348 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.82■■□□□ 1.08
ABCD4-210ENST00000481348 CLIP1P30622 1438 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-210ENST00000481348 RICTORQ6R327 1708 aa21.81■■□□□ 1.08
ABCD4-210ENST00000481348 KIF14Q15058 1648 aa21.8■■□□□ 1.08
ABCD4-210ENST00000481348 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ABCD4-210ENST00000481348 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.79■■□□□ 1.08
ABCD4-210ENST00000481348 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCD4-210ENST00000481348 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.78■■□□□ 1.08
ABCD4-210ENST00000481348 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.76■■□□□ 1.07
ABCD4-210ENST00000481348 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ABCD4-210ENST00000481348 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.74■■□□□ 1.07
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