RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.13■■■■□ 3.21
NELFE-208ENST00000481121 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.11■■■■□ 3.21
NELFE-208ENST00000481121 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
NELFE-208ENST00000481121 JPH4Q96JJ6 628 aa35.03■■■■□ 3.2
NELFE-208ENST00000481121 IQGAP2Q13576 1575 aa35.01■■■■□ 3.2
NELFE-208ENST00000481121 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.98■■■■□ 3.19
NELFE-208ENST00000481121 PRXQ9BXM0 1461 aa34.95■■■■□ 3.19
NELFE-208ENST00000481121 EEA1Q15075 1411 aa34.95■■■■□ 3.19
NELFE-208ENST00000481121 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.94■■■■□ 3.18
NELFE-208ENST00000481121 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.82■■■■□ 3.16
NELFE-208ENST00000481121 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.76■■■■□ 3.16
NELFE-208ENST00000481121 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.76■■■■□ 3.16
NELFE-208ENST00000481121 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
NELFE-208ENST00000481121 DISP1Q96F81 1524 aa34.69■■■■□ 3.14
NELFE-208ENST00000481121 KIAA0556O60303 1618 aa34.68■■■■□ 3.14
NELFE-208ENST00000481121 KIF21BO75037 1637 aa34.68■■■■□ 3.14
NELFE-208ENST00000481121 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.63■■■■□ 3.13
NELFE-208ENST00000481121 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.62■■■■□ 3.13
NELFE-208ENST00000481121 PTPRGP23470 1445 aa34.59■■■■□ 3.13
NELFE-208ENST00000481121 GOLGA3Q08378 1498 aa34.56■■■■□ 3.12
NELFE-208ENST00000481121 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
NELFE-208ENST00000481121 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
NELFE-208ENST00000481121 SAMD9Q5K651 1589 aa34.42■■■■□ 3.1
NELFE-208ENST00000481121 MAPKBP1O60336 1514 aa34.41■■■■□ 3.1
NELFE-208ENST00000481121 ABCC2Q92887 1545 aa34.4■■■■□ 3.1
NELFE-208ENST00000481121 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.4■■■■□ 3.1
NELFE-208ENST00000481121 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.39■■■■□ 3.1
NELFE-208ENST00000481121 UACAQ9BZF9 1416 aa34.38■■■■□ 3.09
NELFE-208ENST00000481121 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.37■■■■□ 3.09
NELFE-208ENST00000481121 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.28■■■■□ 3.08
NELFE-208ENST00000481121 ABCA8O94911 1581 aa34.27■■■■□ 3.08
NELFE-208ENST00000481121 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.26■■■■□ 3.08
NELFE-208ENST00000481121 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
NELFE-208ENST00000481121 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.24■■■■□ 3.07
NELFE-208ENST00000481121 DIP2BQ9P265 1576 aa34.23■■■■□ 3.07
NELFE-208ENST00000481121 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
NELFE-208ENST00000481121 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.22■■■■□ 3.07
NELFE-208ENST00000481121 P3H3Q8IVL6 736 aa34.22■■■■□ 3.07
NELFE-208ENST00000481121 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
NELFE-208ENST00000481121 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.2■■■■□ 3.07
NELFE-208ENST00000481121 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.13■■■■□ 3.05
NELFE-208ENST00000481121 ASXL2Q76L83 1435 aa34.13■■■■□ 3.05
NELFE-208ENST00000481121 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.12■■■■□ 3.05
NELFE-208ENST00000481121 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.06■■■■□ 3.04
NELFE-208ENST00000481121 TSPOAP1O95153 1857 aa34.02■■■■□ 3.04
NELFE-208ENST00000481121 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.99■■■■□ 3.03
NELFE-208ENST00000481121 GLI2P10070 1586 aa33.98■■■■□ 3.03
NELFE-208ENST00000481121 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.97■■■■□ 3.03
NELFE-208ENST00000481121 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
NELFE-208ENST00000481121 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
NELFE-208ENST00000481121 ATP10BO94823 1461 aa33.91■■■■□ 3.02
NELFE-208ENST00000481121 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.89■■■■□ 3.02
NELFE-208ENST00000481121 ARID3CA6NKF2 412 aa33.88■■■■□ 3.01
NELFE-208ENST00000481121 FMN1Q68DA7 1419 aa33.86■■■■□ 3.01
NELFE-208ENST00000481121 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
NELFE-208ENST00000481121 HECW1Q76N89 1606 aa33.82■■■■□ 3
NELFE-208ENST00000481121 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.81■■■■□ 3
NELFE-208ENST00000481121 CLIP1P30622 1438 aa33.74■■■□□ 2.99
NELFE-208ENST00000481121 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
NELFE-208ENST00000481121 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
NELFE-208ENST00000481121 KDM6BO15054 1643 aa33.72■■■□□ 2.99
NELFE-208ENST00000481121 KCNH8Q96L42 1107 aa33.71■■■□□ 2.99
NELFE-208ENST00000481121 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
NELFE-208ENST00000481121 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
NELFE-208ENST00000481121 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.69■■■□□ 2.98
NELFE-208ENST00000481121 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.68■■■□□ 2.98
NELFE-208ENST00000481121 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.67■■■□□ 2.98
NELFE-208ENST00000481121 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
NELFE-208ENST00000481121 CD109Q6YHK3 1445 aa33.62■■■□□ 2.97
NELFE-208ENST00000481121 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.59■■■□□ 2.97
NELFE-208ENST00000481121 CEP162Q5TB80 1403 aa33.59■■■□□ 2.97
NELFE-208ENST00000481121 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.57■■■□□ 2.97
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.56■■■□□ 2.96
NELFE-208ENST00000481121 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.56■■■□□ 2.96
NELFE-208ENST00000481121 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.51■■■□□ 2.96
NELFE-208ENST00000481121 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.49■■■□□ 2.95
NELFE-208ENST00000481121 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.48■■■□□ 2.95
NELFE-208ENST00000481121 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.47■■■□□ 2.953e-7■□□□□ 8.5
NELFE-208ENST00000481121 KIF14Q15058 1648 aa33.43■■■□□ 2.94
NELFE-208ENST00000481121 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
NELFE-208ENST00000481121 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.4■■■□□ 2.94
NELFE-208ENST00000481121 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
NELFE-208ENST00000481121 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.38■■■□□ 2.93
NELFE-208ENST00000481121 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.37■■■□□ 2.93
NELFE-208ENST00000481121 NEO1Q92859 1461 aa33.34■■■□□ 2.93
NELFE-208ENST00000481121 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.3■■■□□ 2.92
NELFE-208ENST00000481121 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.28■■■□□ 2.92
NELFE-208ENST00000481121 FANCAO15360 1455 aa33.27■■■□□ 2.92
NELFE-208ENST00000481121 PLCH2O75038 1416 aa33.2■■■□□ 2.91
NELFE-208ENST00000481121 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.19■■■□□ 2.9
NELFE-208ENST00000481121 PREX2Q70Z35 1606 aa33.18■■■□□ 2.9
NELFE-208ENST00000481121 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.17■■■□□ 2.9
NELFE-208ENST00000481121 AKNAQ7Z591 1439 aa33.16■■■□□ 2.9
NELFE-208ENST00000481121 RICTORQ6R327 1708 aa33.16■■■□□ 2.9
NELFE-208ENST00000481121 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.16■■■□□ 2.9
NELFE-208ENST00000481121 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.15■■■□□ 2.9
NELFE-208ENST00000481121 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.14■■■□□ 2.9
NELFE-208ENST00000481121 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.13■■■□□ 2.89
NELFE-208ENST00000481121 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.1■■■□□ 2.89
NELFE-208ENST00000481121 TIAM1Q13009 1591 aa33.09■■■□□ 2.89
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