RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481120.1

LAMA5-209, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 386 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-209ENST00000481120 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
LAMA5-209ENST00000481120 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.61■■■■□ 3.77
LAMA5-209ENST00000481120 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.6■■■■□ 3.77
LAMA5-209ENST00000481120 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
LAMA5-209ENST00000481120 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.51■■■■□ 3.76
LAMA5-209ENST00000481120 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.36■■■■□ 3.73
LAMA5-209ENST00000481120 IQGAP2Q13576 1575 aa38.31■■■■□ 3.72
LAMA5-209ENST00000481120 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.29■■■■□ 3.72
LAMA5-209ENST00000481120 PRXQ9BXM0 1461 aa38.24■■■■□ 3.71
LAMA5-209ENST00000481120 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.24■■■■□ 3.71
LAMA5-209ENST00000481120 PTPRGP23470 1445 aa38.23■■■■□ 3.71
LAMA5-209ENST00000481120 EEA1Q15075 1411 aa38.21■■■■□ 3.71
LAMA5-209ENST00000481120 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.21■■■■□ 3.71
LAMA5-209ENST00000481120 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.12■■■■□ 3.69
LAMA5-209ENST00000481120 DISP1Q96F81 1524 aa38.06■■■■□ 3.68
LAMA5-209ENST00000481120 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.03■■■■□ 3.68
LAMA5-209ENST00000481120 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
LAMA5-209ENST00000481120 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.01■■■■□ 3.67
LAMA5-209ENST00000481120 GOLGA3Q08378 1498 aa38■■■■□ 3.67
LAMA5-209ENST00000481120 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.99■■■■□ 3.67
LAMA5-209ENST00000481120 MAPKBP1O60336 1514 aa37.96■■■■□ 3.67
LAMA5-209ENST00000481120 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
LAMA5-209ENST00000481120 UACAQ9BZF9 1416 aa37.93■■■■□ 3.66
LAMA5-209ENST00000481120 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.92■■■■□ 3.66
LAMA5-209ENST00000481120 KIAA0556O60303 1618 aa37.9■■■■□ 3.66
LAMA5-209ENST00000481120 ABCC2Q92887 1545 aa37.87■■■■□ 3.65
LAMA5-209ENST00000481120 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.85■■■■□ 3.65
LAMA5-209ENST00000481120 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.85■■■■□ 3.65
LAMA5-209ENST00000481120 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.73■■■■□ 3.63
LAMA5-209ENST00000481120 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.72■■■■□ 3.63
LAMA5-209ENST00000481120 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.7■■■■□ 3.63
LAMA5-209ENST00000481120 KIF21BO75037 1637 aa37.66■■■■□ 3.62
LAMA5-209ENST00000481120 ASXL2Q76L83 1435 aa37.66■■■■□ 3.62
LAMA5-209ENST00000481120 DIP2BQ9P265 1576 aa37.65■■■■□ 3.62
LAMA5-209ENST00000481120 P3H3Q8IVL6 736 aa37.59■■■■□ 3.61
LAMA5-209ENST00000481120 ABCA8O94911 1581 aa37.55■■■■□ 3.6
LAMA5-209ENST00000481120 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
LAMA5-209ENST00000481120 SAMD9Q5K651 1589 aa37.52■■■■□ 3.6
LAMA5-209ENST00000481120 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
LAMA5-209ENST00000481120 GLI2P10070 1586 aa37.49■■■■□ 3.59
LAMA5-209ENST00000481120 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
LAMA5-209ENST00000481120 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
LAMA5-209ENST00000481120 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.4■■■■□ 3.58
LAMA5-209ENST00000481120 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.39■■■■□ 3.58
LAMA5-209ENST00000481120 TSPOAP1O95153 1857 aa37.31■■■■□ 3.56
LAMA5-209ENST00000481120 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.31■■■■□ 3.56
LAMA5-209ENST00000481120 ATP10BO94823 1461 aa37.3■■■■□ 3.56
LAMA5-209ENST00000481120 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.29■■■■□ 3.56
LAMA5-209ENST00000481120 KCNH8Q96L42 1107 aa37.29■■■■□ 3.56
LAMA5-209ENST00000481120 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.27■■■■□ 3.56
LAMA5-209ENST00000481120 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.24■■■■□ 3.55
LAMA5-209ENST00000481120 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
LAMA5-209ENST00000481120 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
LAMA5-209ENST00000481120 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.21■■■■□ 3.55
LAMA5-209ENST00000481120 ARID3CA6NKF2 412 aa37.2■■■■□ 3.55
LAMA5-209ENST00000481120 KDM6BO15054 1643 aa37.19■■■■□ 3.54
LAMA5-209ENST00000481120 CD109Q6YHK3 1445 aa37.17■■■■□ 3.54
LAMA5-209ENST00000481120 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
LAMA5-209ENST00000481120 FMN1Q68DA7 1419 aa37.14■■■■□ 3.54
LAMA5-209ENST00000481120 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.13■■■■□ 3.53
LAMA5-209ENST00000481120 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
LAMA5-209ENST00000481120 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.09■■■■□ 3.53
LAMA5-209ENST00000481120 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.09■■■■□ 3.53
LAMA5-209ENST00000481120 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.07■■■■□ 3.52
LAMA5-209ENST00000481120 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
LAMA5-209ENST00000481120 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.97■■■■□ 3.51
LAMA5-209ENST00000481120 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
LAMA5-209ENST00000481120 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
LAMA5-209ENST00000481120 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.92■■■■□ 3.5
LAMA5-209ENST00000481120 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
LAMA5-209ENST00000481120 HECW1Q76N89 1606 aa36.85■■■■□ 3.49
LAMA5-209ENST00000481120 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.8■■■■□ 3.48
LAMA5-209ENST00000481120 CLIP1P30622 1438 aa36.79■■■■□ 3.48
LAMA5-209ENST00000481120 NEO1Q92859 1461 aa36.78■■■■□ 3.48
LAMA5-209ENST00000481120 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
LAMA5-209ENST00000481120 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.74■■■■□ 3.47
LAMA5-209ENST00000481120 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.67■■■■□ 3.46
LAMA5-209ENST00000481120 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.66■■■■□ 3.46
LAMA5-209ENST00000481120 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
LAMA5-209ENST00000481120 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.61■■■■□ 3.45
LAMA5-209ENST00000481120 FANCAO15360 1455 aa36.59■■■■□ 3.45
LAMA5-209ENST00000481120 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.59■■■■□ 3.45
LAMA5-209ENST00000481120 PLCH2O75038 1416 aa36.59■■■■□ 3.45
LAMA5-209ENST00000481120 AKNAQ7Z591 1439 aa36.58■■■■□ 3.45
LAMA5-209ENST00000481120 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.57■■■■□ 3.44
LAMA5-209ENST00000481120 RAPGEF3O95398 923 aa36.56■■■■□ 3.44
LAMA5-209ENST00000481120 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.55■■■■□ 3.44
LAMA5-209ENST00000481120 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.53■■■■□ 3.44
LAMA5-209ENST00000481120 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
LAMA5-209ENST00000481120 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
LAMA5-209ENST00000481120 CEP162Q5TB80 1403 aa36.5■■■■□ 3.43
LAMA5-209ENST00000481120 KIF14Q15058 1648 aa36.49■■■■□ 3.43
LAMA5-209ENST00000481120 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.45■■■■□ 3.43
LAMA5-209ENST00000481120 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.43■■■■□ 3.42
LAMA5-209ENST00000481120 ADGRL1O94910 1474 aa36.4■■■■□ 3.42
LAMA5-209ENST00000481120 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.38■■■■□ 3.41
LAMA5-209ENST00000481120 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.36■■■■□ 3.41
LAMA5-209ENST00000481120 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.31■■■■□ 3.4
LAMA5-209ENST00000481120 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.31■■■■□ 3.4
LAMA5-209ENST00000481120 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.3■■■■□ 3.4
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